135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2627 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2627  pur operon repressor  100 
 
 		 272 aa  556  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3095  pur operon repressor  59.48 
 
 		 270 aa  333  2e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.933063  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21340  pur operon repressor  47.41 
 
 		 271 aa  272  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2815  pur operon repressor  47.76 
 
 		 267 aa  256  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2501  pur operon repressor  47.39 
 
 		 267 aa  255  5e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0089  pur operon repressor  46.15 
 
 		 278 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0041  pur operon repressor  45.45 
 
 		 282 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0044  pur operon repressor  45.45 
 
 		 282 aa  249  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0041  pur operon repressor  45.45 
 
 		 282 aa  249  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0042  pur operon repressor  43.94 
 
 		 274 aa  249  3e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00214648  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5265  pur operon repressor  45.08 
 
 		 282 aa  248  7e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.549004  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0045  pur operon repressor  45.08 
 
 		 282 aa  248  9e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0041  pur operon repressor  45.08 
 
 		 282 aa  248  9e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0044  pur operon repressor  45.08 
 
 		 282 aa  248  9e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0055  pur operon repressor  45.08 
 
 		 282 aa  248  9e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.748352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0051  pur operon repressor  45.08 
 
 		 282 aa  248  9e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000444912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0041  pur operon repressor  45.08 
 
 		 282 aa  247  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0051  pur operon repressor  45.08 
 
 		 282 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0040  pur operon repressor  44.7 
 
 		 273 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0584  pur operon repressor  41.91 
 
 		 274 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1765  pur operon repressor  40.15 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.011589  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0058  pur operon repressor  44.75 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0517  pur operon repressor  38.11 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00109684  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0530  pur operon repressor  38.11 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000100819  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0134  pur operon repressor  36.98 
 
 		 274 aa  217  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000199065  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1772  pur operon repressor  38.64 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000200517  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2400  pur operon repressor  41.67 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0210  pur operon repressor  38.93 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000033257  normal  0.0176248 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2590  pur operon repressor  36.4 
 
 		 271 aa  202  6e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0219  pur operon repressor  39.16 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000738086  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1608  pur operon repressor  36.9 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0175  pur operon repressor  38.87 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0230472  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1543  pur operon repressor  36.76 
 
 		 284 aa  186  3e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0772  phosphoribosyltransferase  36.15 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.15147  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47930  xanthine phosphoribosyltransferase  33.58 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0380  xanthine phosphoribosyltransferase  36 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000351735  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2173  xanthine phosphoribosyltransferase  33.87 
 
 		 188 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0867075  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2755  xanthine phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69940  xanthine phosphoribosyltransferase  31.2 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6072  xanthine phosphoribosyltransferase  31.2 
 
 		 190 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0251  xanthine phosphoribosyltransferase  32.8 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1265  xanthine phosphoribosyltransferase  27.93 
 
 		 197 aa  68.2  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.165454  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0537  adenine/guanine phosphoribosyltransferase-like protein  31.2 
 
 		 206 aa  68.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0798782  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2387  xanthine phosphoribosyltransferase  33.6 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3719  xanthine phosphoribosyltransferase  28.95 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1490  xanthine phosphoribosyltransferase  28.95 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2147  xanthine phosphoribosyltransferase  28.86 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1697  xanthine phosphoribosyltransferase  28.95 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1475  xanthine phosphoribosyltransferase  28.95 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0761652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1447  xanthine phosphoribosyltransferase  28.95 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1591  xanthine phosphoribosyltransferase  28.95 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.556835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1661  xanthine phosphoribosyltransferase  28.95 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.855078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1737  xanthine phosphoribosyltransferase  28.95 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000180349  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1447  xanthine phosphoribosyltransferase  28.17 
 
 		 191 aa  65.1  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0902677  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1626  xanthine phosphoribosyltransferase  28.29 
 
 		 197 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1086  xanthine phosphoribosyltransferase  32.77 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.821507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1448  xanthine phosphoribosyltransferase  28.95 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000584742  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5520  xanthine phosphoribosyltransferase  32.8 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1302  xanthine phosphoribosyltransferase  30.07 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.550156  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5265  xanthine phosphoribosyltransferase  31.2 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5175  xanthine phosphoribosyltransferase  31.2 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458979  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5317  xanthine phosphoribosyltransferase  31.2 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0748508  normal  0.105571 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0205  xanthine phosphoribosyltransferase  30.4 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605547 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0076  xanthine phosphoribosyltransferase  29.6 
 
 		 189 aa  62  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0720  xanthine phosphoribosyltransferase  28.66 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000414905  normal  0.141539 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0229  xanthine phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115581  hitchhiker  6.642120000000001e-23 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17850  xanthine phosphoribosyltransferase  30.16 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0628  xanthine phosphoribosyltransferase  29.84 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00387933  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0319  xanthine phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0313  xanthine phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0112  xanthine phosphoribosyltransferase  28.8 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3381  xanthine phosphoribosyltransferase  32.8 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00123669  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2510  xanthine phosphoribosyltransferase  27.48 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0705495  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0491  xanthine phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0435  xanthine phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 		 192 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.584524  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0446  xanthine phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 		 192 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210484  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46613  predicted protein  23.94 
 
 		 798 aa  56.2  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1785  adenine phosphoribosyltransferase  29.05 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.232267  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1498  xanthine phosphoribosyltransferase  30.16 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00482653  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1287  xanthine phosphoribosyltransferase  30.16 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11335  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1102  phosphoribosyltransferase  25 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.594083  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1633  adenine phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 		 190 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2059  adenine/guanine phosphoribosyltransferase-like protein  29.01 
 
 		 189 aa  55.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0364  xanthine phosphoribosyltransferase  28.33 
 
 		 193 aa  55.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2968  xanthine phosphoribosyltransferase  28.81 
 
 		 191 aa  54.3  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0067  xanthine phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 		 192 aa  53.5  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00414676  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0200  adenine phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 		 230 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0563  adenine phosphoribosyltransferase  22.22 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0138344 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  24.38 
 
 		 193 aa  53.1  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  25.81 
 
 		 171 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1854  adenine phosphoribosyltransferase  27.62 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.787643 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  28.1 
 
 		 195 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1405  xanthine phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 		 190 aa  50.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000101739  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2135  xanthine phosphoribosyltransferase  26.92 
 
 		 204 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  23.23 
 
 		 191 aa  49.7  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1267  adenine phosphoribosyltransferase  28 
 
 		 230 aa  49.7  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2104  adenine phosphoribosyltransferase  25.98 
 
 		 230 aa  49.3  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.52752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1847  adenine phosphoribosyltransferase  25.95 
 
 		 183 aa  48.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.820811  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0958  phosphoribosyltransferase  23.59 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.934235  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13991  adenine phosphoribosyltransferase  24.12 
 
 		 193 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>