211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2594 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  100 
 
 		 246 aa  471  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  62.35 
 
 		 247 aa  291  7e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  45.54 
 
 		 239 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  34.82 
 
 		 255 aa  138  8.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  33.73 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  36.02 
 
 		 239 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  34.03 
 
 		 266 aa  115  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  37.29 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  35.71 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  33.48 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  31.65 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  34.88 
 
 		 239 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  32.16 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  30.99 
 
 		 244 aa  99.4  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  30.42 
 
 		 243 aa  98.6  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  32.95 
 
 		 279 aa  97.8  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  29.17 
 
 		 270 aa  97.8  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  33.62 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  32.13 
 
 		 271 aa  96.7  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  31.25 
 
 		 265 aa  96.3  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  30.67 
 
 		 305 aa  95.9  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  31.25 
 
 		 265 aa  95.9  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  31.02 
 
 		 268 aa  95.1  9e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  29.37 
 
 		 244 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0856  zinc transporter ZupT  31.8 
 
 		 289 aa  94.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000612212  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  31.41 
 
 		 291 aa  93.6  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  32.64 
 
 		 258 aa  93.2  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2148  zinc/iron permease  33.75 
 
 		 276 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0290  zinc transporter ZupT  32.16 
 
 		 291 aa  92.8  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  31.09 
 
 		 309 aa  92  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0717  zinc transporter ZupT  30.98 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000126072  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  31.51 
 
 		 272 aa  90.5  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  31.36 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1001  zinc/iron permease  31.69 
 
 		 267 aa  89.7  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  28.99 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  31.6 
 
 		 312 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  30.58 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  32.16 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  33.04 
 
 		 277 aa  86.7  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  32.08 
 
 		 271 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  29.46 
 
 		 252 aa  86.3  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  32.03 
 
 		 312 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0870  zinc/iron permease  31.02 
 
 		 290 aa  86.3  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  31.66 
 
 		 258 aa  85.9  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0057  zinc/iron permease  36.13 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  27.16 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  31.17 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  30 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  31.98 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  28.18 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  30 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  31.98 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3077  zinc/iron permease  30.08 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1139  hypothetical protein  31.79 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.854966  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  29.03 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  30.57 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  33.04 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  28.21 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0206  zinc transporter ZupT  29.41 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0874805  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  32.54 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  29.57 
 
 		 308 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  34.3 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  33.04 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1236  zinc/iron permease  31.12 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.216123  normal  0.828913 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  33.5 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4292  zinc/iron permease  29.92 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22030  predicted divalent heavy-metal cations transporter  30.08 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.895881  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  30.45 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  30 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  28.18 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  28.51 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3064  zinc/iron permease  29.6 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  27.35 
 
 		 273 aa  78.6  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  28.63 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  39.71 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  32.05 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  30.24 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0543  zinc/iron permease  27.04 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.884027  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  30.49 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  29.07 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  32.21 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  27.95 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  30.94 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  28.51 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  28.99 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  30.77 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2825  zinc transporter ZupT  29.26 
 
 		 298 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  30.89 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  28.57 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15590  predicted divalent heavy-metal cations transporter  32.61 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0273955  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  27.71 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  30.13 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  35.86 
 
 		 271 aa  72  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  30.92 
 
 		 253 aa  72  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0305  zinc/iron permease  35.97 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0694906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  27.43 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  27.43 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  32.62 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22166  predicted protein  30.23 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00107582  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  31.38 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>