More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2528 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2528  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  100 
 
 
493 aa  1009    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1278  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.3 
 
 
504 aa  457  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.06 
 
 
497 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000345374  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1371  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.29 
 
 
502 aa  422  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.65 
 
 
507 aa  363  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.67 
 
 
504 aa  348  9e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  40.2 
 
 
516 aa  348  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.08 
 
 
512 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.17 
 
 
505 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  39.32 
 
 
505 aa  336  5e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  37.84 
 
 
503 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.7 
 
 
503 aa  334  3e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.75 
 
 
504 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  40.08 
 
 
520 aa  327  3e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.28 
 
 
503 aa  326  5e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.89 
 
 
519 aa  325  9e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1346  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.76 
 
 
511 aa  325  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.694338  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5880  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.68 
 
 
492 aa  323  4e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204086  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.72 
 
 
508 aa  318  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2449  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.17 
 
 
502 aa  318  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.448467  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  37.4 
 
 
513 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.96 
 
 
511 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.04 
 
 
511 aa  310  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.6 
 
 
510 aa  310  5e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.09 
 
 
497 aa  309  9e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12360  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.49 
 
 
579 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11620  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.63 
 
 
546 aa  305  8.000000000000001e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.27 
 
 
512 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1023  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.29 
 
 
493 aa  300  3e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0358  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.39 
 
 
510 aa  297  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0896  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.38 
 
 
506 aa  295  1e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  34.87 
 
 
513 aa  293  7e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2131  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.34 
 
 
507 aa  290  4e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0860734  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3286  uroporphyrinogen III synthase/methyltransferase  38.64 
 
 
515 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3452  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.06 
 
 
525 aa  288  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305578  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2069  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.15 
 
 
522 aa  286  4e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.198087  hitchhiker  0.000347629 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  36.42 
 
 
513 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1687  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  35.92 
 
 
492 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0805383  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1421  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  34.89 
 
 
492 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16426  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3374  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.53 
 
 
509 aa  281  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.95 
 
 
491 aa  280  3e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1199  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.42 
 
 
491 aa  277  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  52.63 
 
 
457 aa  263  4e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  52.63 
 
 
457 aa  263  4e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  52.63 
 
 
457 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.63 
 
 
457 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  52.63 
 
 
457 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  52.63 
 
 
457 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  52.63 
 
 
457 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  52.63 
 
 
457 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  52.63 
 
 
457 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  52.63 
 
 
457 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  52.63 
 
 
457 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  52.63 
 
 
459 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  51.44 
 
 
464 aa  263  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  52.63 
 
 
457 aa  263  6e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  52.63 
 
 
457 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  51.84 
 
 
457 aa  262  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  51.44 
 
 
464 aa  261  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  51.03 
 
 
464 aa  260  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.01 
 
 
464 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.97 
 
 
463 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.83 
 
 
463 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.83 
 
 
463 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.95 
 
 
481 aa  256  5e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  51.84 
 
 
473 aa  256  6e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  51.84 
 
 
473 aa  256  6e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  51.84 
 
 
470 aa  256  6e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  48.97 
 
 
465 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  48.97 
 
 
465 aa  253  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.21 
 
 
464 aa  253  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1555  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.08 
 
 
545 aa  253  7e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.59 
 
 
272 aa  251  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1712  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.1 
 
 
464 aa  249  1e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.53 
 
 
479 aa  248  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  48.15 
 
 
462 aa  247  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.18 
 
 
273 aa  247  4e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.57 
 
 
281 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.57 
 
 
281 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.57 
 
 
278 aa  246  9e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0795  siroheme synthase (Includes: Uroporphyrin-III C-methyltransferase, Precorrin-2 dehydrogenase,Sirohydrochlorin ferrochelatase)  51.64 
 
 
275 aa  245  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  46.56 
 
 
489 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.36 
 
 
276 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.77 
 
 
278 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1028  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.16 
 
 
505 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.16 
 
 
276 aa  244  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  51.43 
 
 
467 aa  243  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  49.39 
 
 
459 aa  243  5e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.54 
 
 
269 aa  243  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  45.34 
 
 
493 aa  243  6e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3325  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  33.46 
 
 
512 aa  243  6e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.16 
 
 
276 aa  243  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  49.39 
 
 
459 aa  243  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.16 
 
 
277 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.98 
 
 
258 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.76 
 
 
502 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  48.15 
 
 
458 aa  241  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.58 
 
 
271 aa  240  5e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.228653  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0251  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.68 
 
 
490 aa  240  5e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.56 
 
 
283 aa  240  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>