227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2526 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2526  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  100 
 
 		 142 aa  287  4e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569901  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  45.11 
 
 		 407 aa  115  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1369  siroheme synthase  43.38 
 
 		 155 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1785  siroheme synthase  38.06 
 
 		 151 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000034128  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  38.46 
 
 		 209 aa  101  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  32.59 
 
 		 218 aa  92.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  36.57 
 
 		 280 aa  90.5  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1844  siroheme synthase  37.5 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204715  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0708  siroheme synthase  34.78 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  36.57 
 
 		 212 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  33.09 
 
 		 224 aa  87.8  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2374  precorrin-2 dehydrogenase  34.35 
 
 		 200 aa  86.7  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  33.33 
 
 		 225 aa  86.7  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3282  siroheme synthase  32.84 
 
 		 224 aa  86.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.12 
 
 		 626 aa  86.3  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0141  porphyrin biosynthesis protein, putative  35.56 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2307  porphyrin biosynthesis protein, putative  38.52 
 
 		 149 aa  85.5  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.187642  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  27.69 
 
 		 213 aa  85.1  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0345  siroheme synthase  33.83 
 
 		 182 aa  84.7  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00442257  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.44 
 
 		 487 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  34.19 
 
 		 468 aa  84  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06710  siroheme synthase Met8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05680)  37.04 
 
 		 242 aa  83.6  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  31.11 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  34.07 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.58 
 
 		 479 aa  82.4  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11590  siroheme synthase, N-terminal domain protein  31.62 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1943  siroheme synthase-like  31.65 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3379  siroheme synthase  31.85 
 
 		 197 aa  80.9  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  32.35 
 
 		 306 aa  81.3  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  32.58 
 
 		 489 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  30.3 
 
 		 493 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.59 
 
 		 462 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  31.62 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0042  porphyrin biosynthesis protein, putative  33.33 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.58 
 
 		 476 aa  78.2  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  33.59 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  35.38 
 
 		 462 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2812  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.61 
 
 		 420 aa  77.8  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00743993 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1123  siroheme synthase  31.85 
 
 		 230 aa  77.8  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.967334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6615  siroheme synthase  35.29 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.027684 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0405  siroheme synthase  34.56 
 
 		 224 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.58 
 
 		 472 aa  77.8  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  30.3 
 
 		 314 aa  77.8  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.75 
 
 		 528 aa  77.4  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3236  siroheme synthase  33.33 
 
 		 220 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0304551  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2332  siroheme synthase  27.61 
 
 		 303 aa  77  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.477134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12390  siroheme synthase, N-terminal domain protein  31.01 
 
 		 255 aa  77  0.00000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.58 
 
 		 480 aa  76.6  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  31.34 
 
 		 312 aa  77  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0362  siroheme synthase  30.58 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.37 
 
 		 800 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0580  siroheme synthase  31.06 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0536  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.33 
 
 		 419 aa  75.5  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.865143  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0049  porphyrin biosynthesis protein, putative  30.08 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.843521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3111  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  33.06 
 
 		 418 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  29.32 
 
 		 472 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  27.82 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  29.32 
 
 		 472 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.32 
 
 		 472 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.08 
 
 		 480 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  33.9 
 
 		 554 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  30.08 
 
 		 462 aa  73.9  0.0000000000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  33.33 
 
 		 465 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  33.33 
 
 		 465 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3617  precorrin-2 dehydrogenase  31.85 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370108 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2642  precorrin-2 dehydrogenase  31.62 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0710  siroheme synthase  33.33 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2697  precorrin-2 dehydrogenase  31.62 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2801  siroheme synthase  29.58 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0131295  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10020  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  31.75 
 
 		 422 aa  72.4  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0127568  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2876  siroheme synthase  28.78 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.71 
 
 		 502 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1576  siroheme synthase  29.58 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190124  hitchhiker  0.000000012919 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2781  siroheme synthase  29.58 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0880434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1945  precorrin-2 dehydrogenase  30.83 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.996395  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  34.88 
 
 		 205 aa  72  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2289  precorrin-2 dehydrogenase  30.83 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3108  siroheme synthase, N-terminal component, putative  28.87 
 
 		 303 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.08 
 
 		 473 aa  71.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0464  siroheme synthase  34.75 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142976  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3066  siroheme synthase  29.63 
 
 		 221 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2188  precorrin-2 dehydrogenase  31.97 
 
 		 203 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0204  precorrin-2 dehydrogenase  29.46 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7364  siroheme synthase  33.33 
 
 		 410 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0139888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2148  precorrin-2 dehydrogenase  30.83 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  31.21 
 
 		 473 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  31.21 
 
 		 473 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.58 
 
 		 482 aa  70.1  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  33.59 
 
 		 474 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  32.58 
 
 		 467 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1745  siroheme synthase  29.32 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.9 
 
 		 464 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  32.2 
 
 		 464 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1986  precorrin-2 dehydrogenase  28.57 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.347019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  31.06 
 
 		 470 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2165  siroheme synthase  31.82 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.576163  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0537  siroheme synthase, N-terminal component  26.12 
 
 		 321 aa  68.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1407  siroheme synthase  25.93 
 
 		 307 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117036  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  33.08 
 
 		 498 aa  68.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1993  precorrin-2 dehydrogenase  30.08 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>