More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2506 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  100 
 
 
1013 aa  2058  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  40.93 
 
 
739 aa  135  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  42.2 
 
 
846 aa  134  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  40 
 
 
739 aa  132  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  40.22 
 
 
1226 aa  131  5e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  3.13752e-05 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  36.51 
 
 
1821 aa  124  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  37.22 
 
 
1009 aa  122  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  4.81253e-06  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  36.87 
 
 
1208 aa  120  1e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  39.88 
 
 
758 aa  120  1e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  36.52 
 
 
506 aa  120  2e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.11 
 
 
1016 aa  118  7e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  36.67 
 
 
546 aa  117  1e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  38.29 
 
 
506 aa  117  1e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  36.31 
 
 
926 aa  117  2e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.16 
 
 
1661 aa  115  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  38.01 
 
 
1194 aa  115  4e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  36.16 
 
 
223 aa  115  4e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  38.15 
 
 
820 aa  115  4e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  39.9 
 
 
767 aa  115  4e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  36.63 
 
 
1321 aa  115  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  35.75 
 
 
1847 aa  115  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  37.91 
 
 
573 aa  114  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  33.17 
 
 
526 aa  114  1e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  34.64 
 
 
414 aa  113  2e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  36.16 
 
 
1174 aa  112  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  33.04 
 
 
756 aa  112  4e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  42.13 
 
 
548 aa  112  4e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0608  S-layer domain protein  34.27 
 
 
547 aa  110  9e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.453799  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  36.63 
 
 
518 aa  110  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  32.24 
 
 
932 aa  110  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  38.03 
 
 
757 aa  110  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  36.31 
 
 
631 aa  109  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3210  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.64 
 
 
533 aa  108  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5468  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.64 
 
 
533 aa  108  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000294756  normal  0.0109567 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  39.53 
 
 
457 aa  108  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  34.71 
 
 
1168 aa  107  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  32.58 
 
 
413 aa  107  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.04 
 
 
938 aa  105  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  40.22 
 
 
767 aa  106  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  35.48 
 
 
1042 aa  105  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  36.52 
 
 
625 aa  105  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  33.33 
 
 
288 aa  105  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  37.16 
 
 
685 aa  103  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  31.19 
 
 
1495 aa  103  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  52 
 
 
830 aa  103  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1257  carbohydrate-binding, CenC-like protein  34.29 
 
 
1050 aa  102  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.12 
 
 
6885 aa  102  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  32.22 
 
 
1260 aa  102  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3111  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.67 
 
 
539 aa  102  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  6.35651e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  32.14 
 
 
920 aa  102  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  32.46 
 
 
575 aa  100  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  33.69 
 
 
4630 aa  100  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  36.87 
 
 
629 aa  100  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  33.7 
 
 
733 aa  100  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  33.33 
 
 
880 aa  99.4  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  35.96 
 
 
729 aa  99.4  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  8.0624e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  33.89 
 
 
618 aa  99  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  32.77 
 
 
548 aa  98.6  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  33.33 
 
 
1710 aa  98.6  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0704  Fibronectin type III domain protein  40.96 
 
 
718 aa  98.6  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.62 
 
 
919 aa  98.6  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  32.93 
 
 
531 aa  98.6  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  34.95 
 
 
935 aa  98.6  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3449  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.15 
 
 
843 aa  97.8  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  34.3 
 
 
754 aa  97.8  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  31.38 
 
 
2207 aa  97.8  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  35.59 
 
 
710 aa  97.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  4.86639e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0271  type 3a, cellulose-binding  33.13 
 
 
308 aa  97.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.817907  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3446  S-layer domain-containing protein  31.05 
 
 
876 aa  97.1  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2877  S-layer-like domain-containing protein  32.09 
 
 
585 aa  97.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  31.4 
 
 
693 aa  96.7  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  32.97 
 
 
2286 aa  97.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  29.7 
 
 
552 aa  96.3  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.29 
 
 
887 aa  95.5  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.18 
 
 
1328 aa  95.5  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  35.29 
 
 
218 aa  95.5  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.52 
 
 
985 aa  95.1  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0925  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.37 
 
 
572 aa  94.7  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.85 
 
 
567 aa  94.7  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.2251e-06 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1979  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.59 
 
 
599 aa  94.4  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase and S-layer protein fusion  35.59 
 
 
599 aa  94.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3710  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.2 
 
 
575 aa  94  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  31.46 
 
 
693 aa  94.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3716  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.2 
 
 
575 aa  94  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.597701  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  33.52 
 
 
524 aa  94  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3019  S-layer domain protein  31.84 
 
 
609 aa  92.8  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  31.03 
 
 
1081 aa  92.8  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0788  S-layer protein, peptidoglycan endo-beta-N-acetylglucosaminidase and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion  33.33 
 
 
615 aa  92.8  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.56588e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  29.55 
 
 
413 aa  92.8  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  34.62 
 
 
3320 aa  92.4  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0777  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.37 
 
 
567 aa  92.4  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  35.76 
 
 
857 aa  92.4  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3077  cellulosome anchoring protein, cohesin region  35.37 
 
 
1853 aa  92  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  29.24 
 
 
624 aa  92  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2341  hypothetical protein  30.46 
 
 
554 aa  91.7  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.920789 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.97 
 
 
995 aa  91.3  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  31.43 
 
 
671 aa  89.7  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3463  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.52 
 
 
575 aa  88.6  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.219832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3737  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.52 
 
 
575 aa  88.6  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3692  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.52 
 
 
575 aa  87.8  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00650388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>