241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2452 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A1352  oligoendopeptidase F  56.79 
 
 
608 aa  685    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1314  oligoendopeptidase F  56.62 
 
 
608 aa  682    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1102  oligoendopeptidase F  56.24 
 
 
608 aa  681    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1114  oligoendopeptidase F  57.12 
 
 
608 aa  686    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4094  oligoendopeptidase F  56.57 
 
 
608 aa  682    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3460  oligoendopeptidase F  68.3 
 
 
601 aa  848    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1096  oligoendopeptidase F  57.12 
 
 
608 aa  686    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0909  oligoendopeptidase F  56.72 
 
 
608 aa  697    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1623  oligoendopeptidase F  54.62 
 
 
607 aa  667    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1090  oligoendopeptidase F  56.95 
 
 
608 aa  686    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08170  Oligoendopeptidase F  57 
 
 
598 aa  719    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1206  oligoendopeptidase F  57.12 
 
 
608 aa  686    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1247  oligoendopeptidase F  57.07 
 
 
608 aa  686    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1920  oligoendopeptidase F  58.78 
 
 
600 aa  750    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1422  oligoendopeptidase F  61.18 
 
 
596 aa  764    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0811423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0768  oligoendopeptidase F  55.39 
 
 
604 aa  682    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1276  oligoendopeptidase F  57.12 
 
 
608 aa  686    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2452  oligopeptidase F  100 
 
 
602 aa  1232    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3050  oligoendopeptidase F  56.4 
 
 
599 aa  704    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2457  oligoendopeptidase F  52.14 
 
 
595 aa  628  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0101459  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3699  oligoendopeptidase F  52.19 
 
 
597 aa  627  1e-178  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1706  oligoendopeptidase F  49.17 
 
 
599 aa  610  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.615745  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1439  oligoendopeptidase F  49.33 
 
 
599 aa  610  1e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0099  oligoendopeptidase F  48.65 
 
 
619 aa  608  1e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.893555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1255  oligoendopeptidase F  47.66 
 
 
600 aa  606  9.999999999999999e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012526 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3585  oligoendopeptidase F  48.74 
 
 
605 aa  597  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0738  oligoendopeptidase F  48.22 
 
 
609 aa  588  1e-167  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1310  oligoendopeptidase F  46.57 
 
 
602 aa  569  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0118183  hitchhiker  0.00000404795 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1205  oligoendopeptidase F  44.93 
 
 
597 aa  548  1e-155  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1716  oligoendopeptidase F  43.81 
 
 
603 aa  550  1e-155  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1306  oligoendopeptidase F  44.87 
 
 
596 aa  545  1e-154  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479307  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3366  oligoendopeptidase F  43.14 
 
 
606 aa  546  1e-154  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0580  oligoendopeptidase F  46.42 
 
 
602 aa  539  9.999999999999999e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.970451  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0999  oligoendopeptidase F  45.73 
 
 
602 aa  536  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3115  oligoendopeptidase F  42.59 
 
 
603 aa  538  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111844  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1018  oligoendopeptidase F  45.73 
 
 
602 aa  536  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0179915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3489  oligoendopeptidase F  45.36 
 
 
595 aa  525  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3293  oligoendopeptidase F  45.19 
 
 
595 aa  528  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3263  oligoendopeptidase F  45.36 
 
 
595 aa  527  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.967808  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1756  oligoendopeptidase F  45.36 
 
 
595 aa  526  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254988  normal  0.855584 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3553  oligoendopeptidase F  45.19 
 
 
595 aa  528  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3517  oligoendopeptidase F  45.36 
 
 
595 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1161  oligoendopeptidase F  43.29 
 
 
596 aa  525  1e-148  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1361  oligoendopeptidase F  42.6 
 
 
613 aa  525  1e-148  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3510  oligoendopeptidase F  45.19 
 
 
595 aa  528  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3502  oligoendopeptidase F  44.86 
 
 
595 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.967377  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2201  oligoendopeptidase F  44.92 
 
 
595 aa  521  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.110852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3202  oligoendopeptidase F  45.19 
 
 
595 aa  524  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3207  oligoendopeptidase F  45.19 
 
 
595 aa  525  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.918473  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0489  oligopeptidase  44.67 
 
 
601 aa  524  1e-147  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1121  oligoendopeptidase F  42.76 
 
 
600 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0805  group B oligopeptidase PepB  43.65 
 
 
601 aa  507  9.999999999999999e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.036965  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1160  oligopeptidase F  43.69 
 
 
603 aa  501  1e-140  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.167862  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2686  oligoendopeptidase F  39.6 
 
 
599 aa  496  1e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1539  oligoendopeptidase F  42.33 
 
 
622 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0058  oligoendopeptidase F  41.55 
 
 
592 aa  487  1e-136  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1890  oligopeptidase F  42.57 
 
 
601 aa  486  1e-136  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D12  oligopeptidase F  42.06 
 
 
604 aa  478  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2002  oligoendopeptidase F  41.37 
 
 
594 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000655164  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2639  oligoendopeptidase F  40.73 
 
 
629 aa  469  1.0000000000000001e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.306383  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0442  oligopeptidase F  41.79 
 
 
597 aa  470  1.0000000000000001e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2626  oligoendopeptidase F  41.54 
 
 
618 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2755  oligoendopeptidase F  40.07 
 
 
606 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000210431  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0130  oligoendopeptidase F  35.4 
 
 
604 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000121565  hitchhiker  0.000025846 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4751  oligoendopeptidase F  35.51 
 
 
605 aa  399  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1902  oligoendopeptidase F  36.23 
 
 
649 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1169  oligoendopeptidase F  35.14 
 
 
644 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.325773 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2055  oligopeptidase F  35.56 
 
 
646 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.443818  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0388  oligoendopeptidase F  36.59 
 
 
608 aa  394  1e-108  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0196949  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1115  oligoendopeptidase F  35.55 
 
 
604 aa  395  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.648956 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3095  oligoendopeptidase F  37.03 
 
 
618 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.27359 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1823  oligoendopeptidase F  36.06 
 
 
654 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0253  oligoendopeptidase F  35.81 
 
 
590 aa  370  1e-101  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1090  oligoendopeptidase F  37.46 
 
 
631 aa  362  1e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0919891  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5250  oligoendopeptidase F  33.73 
 
 
605 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5641  oligoendopeptidase F  33.56 
 
 
605 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000270778  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1081  oligoendopeptidase F  33.17 
 
 
611 aa  353  4e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.142935 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5368  putative oligoendopeptidase F  33.56 
 
 
605 aa  350  5e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288334  hitchhiker  0.00000401253 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5138  oligoendopeptidase F  33.39 
 
 
605 aa  348  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5551  putative oligoendopeptidase F  33.39 
 
 
605 aa  348  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000923632 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5310  oligoendopeptidase F  33.22 
 
 
605 aa  346  8e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5152  oligoendopeptidase F  33.05 
 
 
605 aa  346  8e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0490597  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5706  oligoendopeptidase F  33.22 
 
 
605 aa  346  8e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5579  putative oligoendopeptidase F  33 
 
 
605 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0757693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5596  oligoendopeptidase F, putative  32.71 
 
 
605 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1084  oligoendopeptidase F  30.79 
 
 
605 aa  288  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.450155  normal  0.585135 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1445  oligoendopeptidase F  28.03 
 
 
604 aa  270  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.898527  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1474  oligoendopeptidase F  28.03 
 
 
604 aa  270  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0757651  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0955  oligoendopeptidase F, putative  27.2 
 
 
603 aa  262  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.660316  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0193  oligoendopeptidase F  31.33 
 
 
597 aa  262  2e-68  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.798288  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1648  oligoendopeptidase F  27.67 
 
 
599 aa  260  6e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2177  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  26.32 
 
 
605 aa  247  4.9999999999999997e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2359  oligoendopeptidase F  28.38 
 
 
603 aa  243  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0071  oligoendopeptidase F  31.23 
 
 
608 aa  233  7.000000000000001e-60  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.257415  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf611  oligoendopeptidase F  28.57 
 
 
611 aa  224  3e-57  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.354763  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  29.9 
 
 
603 aa  215  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2081  oligoendopeptidase F  27.14 
 
 
598 aa  211  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.210841  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.95 
 
 
601 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.84 
 
 
591 aa  198  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.77 
 
 
616 aa  197  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>