More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2428 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  100 
 
 		 302 aa  619  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  47.14 
 
 		 285 aa  259  4e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  41.14 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  39.26 
 
 		 289 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  41.53 
 
 		 283 aa  215  8e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  43.51 
 
 		 284 aa  209  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  43.97 
 
 		 288 aa  209  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  40.4 
 
 		 289 aa  208  8e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  43.46 
 
 		 284 aa  205  9e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0166  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.95 
 
 		 291 aa  200  3e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  41.7 
 
 		 284 aa  199  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  42.7 
 
 		 287 aa  199  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  40.48 
 
 		 287 aa  199  6e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.88 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  39.66 
 
 		 280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  38.21 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  42.42 
 
 		 282 aa  196  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.72 
 
 		 289 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.27 
 
 		 286 aa  195  7e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  41.81 
 
 		 279 aa  193  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  40.07 
 
 		 587 aa  192  6e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.89 
 
 		 279 aa  192  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.84 
 
 		 283 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  40.07 
 
 		 587 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  38.62 
 
 		 295 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.46 
 
 		 287 aa  189  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  36.54 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  37.37 
 
 		 283 aa  189  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.42 
 
 		 299 aa  187  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  36.7 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.88 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.04 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  37.04 
 
 		 283 aa  186  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.75 
 
 		 285 aa  185  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  36.7 
 
 		 283 aa  185  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  36.7 
 
 		 283 aa  185  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.7 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.49 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.79 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  40.55 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  36.49 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5126  HemK family modification methylase  36.49 
 
 		 283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0481456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  43.15 
 
 		 285 aa  182  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  37.42 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  37.07 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  35.74 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  43.4 
 
 		 319 aa  180  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  39.44 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  36.86 
 
 		 304 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  37.63 
 
 		 291 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.86 
 
 		 288 aa  175  8e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  35.71 
 
 		 297 aa  175  9e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  37.28 
 
 		 317 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  39.56 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  40.07 
 
 		 288 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  37.92 
 
 		 361 aa  172  5.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  36.82 
 
 		 284 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.59 
 
 		 293 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  35.12 
 
 		 325 aa  169  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  35.56 
 
 		 292 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  35.15 
 
 		 283 aa  169  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  33.78 
 
 		 289 aa  169  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  37.73 
 
 		 276 aa  169  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.09 
 
 		 285 aa  168  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2082  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.33 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000794612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  34.71 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  36.69 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3434  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.35 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  36.39 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  36.49 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  35.23 
 
 		 279 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2779  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.13 
 
 		 313 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.159929  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  35.35 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.2 
 
 		 277 aa  166  5e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  40 
 
 		 274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  37.94 
 
 		 284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  36.27 
 
 		 288 aa  165  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  36.88 
 
 		 286 aa  165  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  36.86 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  37.41 
 
 		 289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  35.35 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.97 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  37.1 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1037  HemK family modification methylase  35.56 
 
 		 287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2871  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.08 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000102093  hitchhiker  0.0000000000956396 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  37.16 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.56 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.08 
 
 		 299 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  35.38 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  36.69 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_994  modification methylase, HemK family  36.27 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0917  modification methylase, HemK family  42.8 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  36.33 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.86 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  35.09 
 
 		 280 aa  159  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  33.93 
 
 		 298 aa  159  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  35.25 
 
 		 277 aa  159  7e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0954  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.37 
 
 		 296 aa  159  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00257436  normal  0.0446983 
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  34.51 
 
 		 283 aa  159  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>