77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2410 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2410  hypothetical protein  100 
 
 
530 aa  1062    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0028  protein of unknown function DUF342  50.57 
 
 
525 aa  538  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3178  hypothetical protein  46.02 
 
 
529 aa  473  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1511  hypothetical protein  31.06 
 
 
527 aa  183  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0498  hypothetical protein  30.49 
 
 
542 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.578621  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16620  predicted polymerase, contains PALM domain, HD hydrolase domain and Zn-ribbon domain  30.9 
 
 
611 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2021  protein of unknown function DUF342  29.54 
 
 
463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0657  hypothetical protein  30.25 
 
 
509 aa  156  9e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0879  hypothetical protein  31.4 
 
 
467 aa  153  8e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00425584  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2143  protein of unknown function DUF342  30.67 
 
 
461 aa  153  8.999999999999999e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0160634  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2682  hypothetical protein  28.66 
 
 
656 aa  150  4e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254687  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1305  protein of unknown function DUF342  29.59 
 
 
530 aa  151  4e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.431943  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1423  protein of unknown function DUF342  27.63 
 
 
622 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000579847  normal  0.370296 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3025  hypothetical protein  26.42 
 
 
546 aa  140  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.487513  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0512  hypothetical protein  26.49 
 
 
546 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2246  protein of unknown function DUF342  28.91 
 
 
520 aa  130  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0881  hypothetical protein  34.46 
 
 
462 aa  129  9.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000540176  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0176  protein of unknown function DUF342  29.87 
 
 
660 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000513292  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2684  hypothetical protein  28.42 
 
 
532 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0194  hypothetical protein  29.24 
 
 
455 aa  127  6e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1534  hypothetical protein  28.9 
 
 
456 aa  127  6e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.196772  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0192  hypothetical protein  30.21 
 
 
455 aa  127  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1663  hypothetical protein  28.54 
 
 
459 aa  127  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2234  hypothetical protein  32.51 
 
 
484 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260747  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1231  hypothetical protein  28.23 
 
 
462 aa  123  7e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0872  hypothetical protein  26.9 
 
 
541 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262539  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0219  protein of unknown function DUF342  25.24 
 
 
501 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.102298  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0273  hypothetical protein  26.05 
 
 
634 aa  109  1e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1709  hypothetical protein  27.85 
 
 
534 aa  109  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0473  hypothetical protein  25.64 
 
 
467 aa  107  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1361  polymerase  24.24 
 
 
653 aa  107  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0671  protein of unknown function DUF342  25.36 
 
 
545 aa  103  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.38243e-32 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3642  hypothetical protein  26.39 
 
 
544 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000393022  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2455  hypothetical protein  26.81 
 
 
538 aa  99.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0568  hypothetical protein  25.45 
 
 
556 aa  97.8  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0452  protein of unknown function DUF342  30.04 
 
 
603 aa  92.8  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0389  protein of unknown function DUF342  25.61 
 
 
578 aa  92  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2173  hypothetical protein  21.6 
 
 
552 aa  87.8  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.819375  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0090  protein of unknown function DUF342  23.83 
 
 
565 aa  85.5  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0805  hypothetical protein  24.51 
 
 
562 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3684  hypothetical protein  27.1 
 
 
562 aa  84  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0830  protein of unknown function DUF342  24.3 
 
 
562 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000204321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0837  hypothetical protein  24.3 
 
 
562 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3531  hypothetical protein  24.3 
 
 
562 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3979  hypothetical protein  23.8 
 
 
556 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3273  hypothetical protein  24.02 
 
 
563 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3451  hypothetical protein  24.59 
 
 
563 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0113855 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0823  hypothetical protein  30.97 
 
 
691 aa  81.3  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00604121  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4099  protein of unknown function DUF342  27.72 
 
 
598 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000308473  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1695  hypothetical protein  25.88 
 
 
562 aa  80.5  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0674  hypothetical protein  24.36 
 
 
563 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1534  polymerase  24.38 
 
 
629 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.451593  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3165  hypothetical protein  23.16 
 
 
562 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1398  hypothetical protein  27.17 
 
 
728 aa  77.4  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0826  hypothetical protein  23.41 
 
 
563 aa  77  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3231  hypothetical protein  23.25 
 
 
556 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2978  hypothetical protein  22.93 
 
 
555 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4141  hypothetical protein  24 
 
 
556 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.5265 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1631  hypothetical protein  23.16 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.83823  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02406  hypothetical protein  23.38 
 
 
551 aa  72  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.122562  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0539  hypothetical protein  24.42 
 
 
555 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0596  hypothetical protein  21.95 
 
 
554 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0158  hypothetical protein  25.31 
 
 
556 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000996  predicted polymerase  24.37 
 
 
559 aa  67.4  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717686  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07053  hypothetical protein  24.19 
 
 
566 aa  67  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0251  protein of unknown function DUF342  23.62 
 
 
381 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0226778 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1718  hypothetical protein  23.2 
 
 
371 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0679747  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0010  hypothetical protein  23.48 
 
 
547 aa  62  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.736924  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1859  hypothetical protein  24.72 
 
 
603 aa  60.5  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1256  protein of unknown function DUF342  24.79 
 
 
378 aa  58.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.912515  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0429  hypothetical protein  25.09 
 
 
574 aa  53.5  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1210  hypothetical protein  30.04 
 
 
634 aa  52.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1052  protein of unknown function DUF342  22.55 
 
 
642 aa  52  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.929442  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2318  hypothetical protein  23.18 
 
 
371 aa  51.6  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575561 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0806  hypothetical protein  24.42 
 
 
626 aa  50.4  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00357901  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0394  hypothetical protein  25.99 
 
 
543 aa  50.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000249945  normal  0.153411 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1150  hypothetical protein  24.32 
 
 
638 aa  47.4  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.216644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>