28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2400 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2400  peptidase U57, YabG  100 
 
 
291 aa  593  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00211457  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2481  peptidase family protein  48.81 
 
 
295 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2191  peptidase family protein  48.81 
 
 
293 aa  301  8.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0306906  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0113  sporulation peptidase YabG  49.65 
 
 
293 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.1965  hitchhiker  0.00402818 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0082  sporulation peptidase YabG  48.95 
 
 
277 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0168  sporulation peptidase YabG  47.04 
 
 
286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.866553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0596  peptidase U57, YabG  51.72 
 
 
284 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0079  peptidase U57, YabG  48.82 
 
 
303 aa  268  8e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183475  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0048  peptidase U57, YabG  49.65 
 
 
286 aa  267  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.403765  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2108  sporulation peptidase YabG  48.24 
 
 
283 aa  262  4.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0056  hypothetical protein  46.28 
 
 
291 aa  257  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000326834 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0038  sporulation peptidase YabG  45.14 
 
 
294 aa  245  8e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.344942  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0036  sporulation peptidase YabG  43.46 
 
 
299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0237  peptidase U57 YabG  44.17 
 
 
269 aa  237  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000495853  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0037  peptidase U57 YabG  44.71 
 
 
287 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0051  yabG protein  45.39 
 
 
287 aa  235  7e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0047  yabG protein  45.39 
 
 
287 aa  235  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0040  yabG protein  45.39 
 
 
287 aa  235  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0038  sporulation-specific protease  45.39 
 
 
287 aa  235  7e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0041  yabG protein  45.39 
 
 
287 aa  235  7e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.369539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0040  yabG protein  45.39 
 
 
287 aa  235  7e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0038  sporulation-specific protease  45.39 
 
 
287 aa  235  8e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0037  peptidase U57 YabG  45.24 
 
 
287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0047  yabG protein  45.61 
 
 
279 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5269  yabG protein  45.61 
 
 
279 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.923999  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2507  peptidase U57, YabG  45.13 
 
 
271 aa  214  9e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21700  peptidase U57 YabG  39.44 
 
 
269 aa  206  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.416284  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0019  hypothetical protein  58 
 
 
67 aa  57  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>