42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2398 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2398  putative spore coat protein  100 
 
 
329 aa  674    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0017  spore coat protein, CotS family  42.81 
 
 
327 aa  293  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2482  spore coat protein CotS  39.88 
 
 
334 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.915972  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2192  spore coat protein CotS  39.56 
 
 
333 aa  259  4e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00336173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0543  spore coat protein, CotS family  34.24 
 
 
330 aa  238  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2196  spore coat protein, putative  30.28 
 
 
335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0443073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2486  putative spore coat protein  28.08 
 
 
335 aa  146  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000540962  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3824  CotS family spore coat protein  26.51 
 
 
347 aa  135  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2081  spore coat protein CotS  29.14 
 
 
355 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5429  spore coat protein CotS  27.18 
 
 
352 aa  125  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.917959  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1083  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  27.33 
 
 
349 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2194  spore coat protein, putative  25.38 
 
 
342 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00168617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2484  putative spore coat protein  25.97 
 
 
342 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0028881  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1978  hypothetical protein  24.75 
 
 
359 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2267  putative spore coat protein  25.51 
 
 
359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1084  spore coat protein  24.91 
 
 
345 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1090  spore coat protein, CotS family  28.52 
 
 
331 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.26177  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1130  spore coat protein, CotS family  27.65 
 
 
333 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5431  spore coat protein CotS  24.66 
 
 
372 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.472752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2083  spore coat protein CotS  24.44 
 
 
350 aa  99.8  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.694942  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1639  spore coat protein, CotS family  26.42 
 
 
364 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0449  aminoglycoside phosphotransferase  26.03 
 
 
351 aa  92.4  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1091  spore coat protein, CotS family  25 
 
 
331 aa  86.3  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0541  spore coat protein, CotS family  25.33 
 
 
337 aa  84  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0542  hypothetical protein  24.38 
 
 
322 aa  59.7  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1892  aminoglycoside phosphotransferase  22.27 
 
 
344 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3823  aminoglycoside phosphotransferase  22.5 
 
 
344 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3043  spore coat protein YutH  22.61 
 
 
333 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4773  spore coat protein YutH  21.37 
 
 
333 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4680  spore coat protein  21.4 
 
 
333 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5094  spore coat protein cotS  21.01 
 
 
333 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5096  spore coat protein cotS  21.01 
 
 
333 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5088  spore coat protein cotS  21.01 
 
 
333 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2898  spore coat protein YutH  22.17 
 
 
336 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0693926  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5188  spore coat protein cotS  21.01 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.518825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4661  spore coat protein  21.4 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4823  spore coat protein cotS  21.01 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0146  spore coat protein cotS  21.01 
 
 
333 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5058  spore coat protein cotS  21.01 
 
 
333 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0151  aminoglycoside phosphotransferase  23.68 
 
 
374 aa  43.5  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1066  homoserine kinase  25.32 
 
 
302 aa  43.1  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0153497  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1164  hypothetical protein  25.32 
 
 
339 aa  42.7  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>