269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2387 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  100 
 
 
423 aa  854  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2377  Gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate peptidase  42.81 
 
 
388 aa  244  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0196  peptidase M14 carboxypeptidase A  41.92 
 
 
386 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  37.92 
 
 
379 aa  185  1e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.21 
 
 
406 aa  147  2e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.58618e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.26 
 
 
433 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.26 
 
 
422 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.3 
 
 
327 aa  89.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.24 
 
 
1074 aa  75.9  1e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  40 
 
 
324 aa  75.5  2e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  56.06 
 
 
554 aa  74.3  4e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  56.45 
 
 
391 aa  71.2  3e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2507  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.88 
 
 
378 aa  70.9  4e-11  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.7 
 
 
1034 aa  69.7  9e-11  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.39 
 
 
453 aa  68.9  2e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.44 
 
 
1089 aa  67.8  4e-10  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.52 
 
 
974 aa  67.4  4e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.77 
 
 
1034 aa  67  7e-10  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.79 
 
 
77 aa  67  7e-10  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4082  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.88 
 
 
626 aa  65.9  1e-09  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221076  normal  0.0678076 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.75 
 
 
300 aa  66.2  1e-09  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8143  hypothetical protein  28.78 
 
 
815 aa  65.9  2e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.797388 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21410  Peptidoglycan-binding LysM  45.45 
 
 
530 aa  64.3  3e-09  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.28 
 
 
266 aa  63.2  8e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1643  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.17 
 
 
440 aa  61.6  3e-08  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.48 
 
 
283 aa  61.6  3e-08  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  46.43 
 
 
462 aa  61.6  3e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.75 
 
 
889 aa  61.2  4e-08  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.77 
 
 
128 aa  60.5  5e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 
266 aa  60.5  5e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.97 
 
 
143 aa  60.1  8e-08  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  29.77 
 
 
387 aa  59.7  9e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  3.80245e-07 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  46.77 
 
 
239 aa  59.3  1e-07  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.3 
 
 
628 aa  59.7  1e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  46.77 
 
 
409 aa  59.3  1e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1791  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.08 
 
 
168 aa  58.9  2e-07  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  34.17 
 
 
383 aa  58.9  2e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2457  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.79 
 
 
294 aa  58.9  2e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156102  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.6 
 
 
321 aa  58.5  2e-07  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  40.74 
 
 
762 aa  58.9  2e-07  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.77 
 
 
500 aa  58.5  2e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  53.73 
 
 
224 aa  58.5  2e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  45.16 
 
 
229 aa  58.5  2e-07  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  43.28 
 
 
232 aa  57.8  3e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.42 
 
 
266 aa  58.2  3e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2916  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  53.45 
 
 
864 aa  58.2  3e-07  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.260808  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2115  SCP-like extracellular  51.72 
 
 
349 aa  57.8  3e-07  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147298  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.43 
 
 
792 aa  57.4  5e-07  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4768  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.75 
 
 
245 aa  56.6  7e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1239  Peptidoglycan-binding LysM  57.45 
 
 
156 aa  56.6  7e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144568  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  46.77 
 
 
438 aa  56.6  8e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  46.03 
 
 
228 aa  56.6  8e-07  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  23.27 
 
 
403 aa  56.6  9e-07  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  55.56 
 
 
289 aa  56.2  1e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  46.67 
 
 
228 aa  55.8  1e-06  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.53 
 
 
428 aa  56.2  1e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.27 
 
 
773 aa  56.2  1e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  29.55 
 
 
392 aa  55.5  2e-06  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2508  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.67 
 
 
256 aa  55.1  2e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0275667  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  43.75 
 
 
358 aa  55.1  2e-06  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.71 
 
 
575 aa  55.1  3e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  47.92 
 
 
179 aa  54.7  3e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26920  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  46.03 
 
 
254 aa  54.7  3e-06  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2664  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.31 
 
 
365 aa  54.7  3e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00317155  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  48.33 
 
 
224 aa  55.1  3e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  2.01814e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1348  peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.19 
 
 
270 aa  54.3  4e-06  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0750  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.67 
 
 
531 aa  54.3  4e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  51.92 
 
 
323 aa  54.3  4e-06  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.78 
 
 
249 aa  54.3  4e-06  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.57 
 
 
508 aa  54.3  4e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5245  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.75 
 
 
432 aa  54.3  5e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.510355 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.62 
 
 
274 aa  53.9  6e-06  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2106  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  48.89 
 
 
509 aa  53.9  6e-06  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.48 
 
 
326 aa  53.5  7e-06  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.66 
 
 
629 aa  53.5  7e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.76 
 
 
382 aa  53.5  7e-06  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1872  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.33 
 
 
268 aa  53.1  8e-06  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.322765  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  48.08 
 
 
395 aa  53.1  9e-06  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.68 
 
 
306 aa  52.8  1e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.67 
 
 
319 aa  52.4  1e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  7.38312e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.67 
 
 
306 aa  52.8  1e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  24.89 
 
 
821 aa  52.8  1e-05  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1183  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.59 
 
 
1061 aa  52.8  1e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  45 
 
 
396 aa  52.8  1e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  50 
 
 
204 aa  52.8  1e-05  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2914  carboxypeptidase A  29.05 
 
 
429 aa  52.4  1e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  4.27177e-05 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  46.15 
 
 
406 aa  51.6  2e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  41.94 
 
 
378 aa  51.6  2e-05  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1939  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.28 
 
 
187 aa  52  2e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.19325 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  58.7 
 
 
307 aa  52.4  2e-05  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  3.33433e-07 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.39 
 
 
182 aa  52.4  2e-05  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  50 
 
 
280 aa  52.4  2e-05  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2792  hypothetical protein  38.46 
 
 
264 aa  51.2  3e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  34.52 
 
 
490 aa  51.6  3e-05  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4396  peptidoglycan binding domain-containing protein  63.64 
 
 
313 aa  51.6  3e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  9.49071e-05 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  50.91 
 
 
225 aa  51.6  3e-05  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  39.24 
 
 
2277 aa  51.6  3e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0101  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.25 
 
 
294 aa  51.2  3e-05  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 
334 aa  51.6  3e-05  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.67 
 
 
160 aa  51.2  4e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>