More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2378 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  100 
 
 		 289 aa  568  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  56.99 
 
 		 281 aa  323  3e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  52.38 
 
 		 286 aa  278  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  50.7 
 
 		 286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  50.7 
 
 		 286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  46.36 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  48.06 
 
 		 279 aa  255  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  44.52 
 
 		 305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  47 
 
 		 279 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  47.72 
 
 		 294 aa  249  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  47.35 
 
 		 278 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  42.96 
 
 		 282 aa  246  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  45.26 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  44.88 
 
 		 279 aa  241  9e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  45.91 
 
 		 285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  44.44 
 
 		 295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  44.37 
 
 		 302 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  44.76 
 
 		 289 aa  239  5e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  47.18 
 
 		 289 aa  238  5.999999999999999e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  43.23 
 
 		 323 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  40.97 
 
 		 304 aa  234  9e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  43.75 
 
 		 282 aa  231  9e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  44.29 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  43.36 
 
 		 274 aa  228  9e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  47.24 
 
 		 269 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  43.31 
 
 		 283 aa  227  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  40.4 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  44.6 
 
 		 294 aa  224  9e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  44.98 
 
 		 272 aa  224  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  41.9 
 
 		 280 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  42.25 
 
 		 335 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  40.8 
 
 		 312 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  43.1 
 
 		 294 aa  221  9e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  43.9 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  42.66 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  42.62 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  42.25 
 
 		 329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1443  putative transcriptional regulator  40.64 
 
 		 424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  41.99 
 
 		 286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  44.48 
 
 		 287 aa  220  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  42.66 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  41.79 
 
 		 284 aa  219  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  38.85 
 
 		 314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  41.81 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  42.16 
 
 		 286 aa  219  5e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  42.4 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  42.86 
 
 		 282 aa  219  5e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  42.16 
 
 		 283 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  42.31 
 
 		 283 aa  219  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  42.4 
 
 		 283 aa  219  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  40.47 
 
 		 304 aa  218  7e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  40.55 
 
 		 294 aa  218  7.999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  40.47 
 
 		 305 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  38.87 
 
 		 310 aa  217  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  46.07 
 
 		 272 aa  218  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  42.66 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  42.76 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  42.07 
 
 		 283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  43.92 
 
 		 294 aa  216  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  41.5 
 
 		 288 aa  216  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  38.49 
 
 		 306 aa  215  7e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  43.71 
 
 		 283 aa  215  7e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  39.51 
 
 		 280 aa  215  8e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  40.08 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  40 
 
 		 295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  38.87 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  39.46 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  41.03 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  39.86 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  39.86 
 
 		 292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  42.71 
 
 		 290 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  42.71 
 
 		 290 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  40.21 
 
 		 286 aa  212  5.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  43 
 
 		 303 aa  211  9e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  44.19 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  42.16 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  40 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  44.02 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  48.26 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  39.18 
 
 		 292 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  39.73 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  39.53 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  40.61 
 
 		 293 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  42.41 
 
 		 328 aa  209  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  39.73 
 
 		 292 aa  210  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  40.62 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  40.27 
 
 		 303 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  40.56 
 
 		 284 aa  209  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  42.67 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  40.85 
 
 		 331 aa  209  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  39.92 
 
 		 326 aa  209  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  43.4 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  43.4 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  43.4 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  40.96 
 
 		 293 aa  208  8e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  39.93 
 
 		 299 aa  208  9e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  40.07 
 
 		 307 aa  208  9e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  41.3 
 
 		 293 aa  208  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  42.16 
 
 		 290 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  41.3 
 
 		 293 aa  208  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>