175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2369 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  100 
 
 		 126 aa  249  9.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  52 
 
 		 121 aa  133  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  43.12 
 
 		 116 aa  94.4  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  44.64 
 
 		 115 aa  94  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  45.3 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  45.3 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  42.99 
 
 		 116 aa  90.9  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  42.86 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  36.84 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  37.96 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  34.21 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  37.72 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  32 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  32.41 
 
 		 117 aa  67  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  32.41 
 
 		 117 aa  67  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  31.25 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  37.61 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  33.96 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  33.64 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  30.48 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  28.7 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  31.25 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  33.64 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5745  ribonuclease P  50.79 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936025  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  35.29 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  26.89 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  33.64 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  33.64 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  33.64 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  33.64 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  33.64 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  33.64 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  33.64 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  33.64 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  43.04 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5614  ribonuclease P protein component  49.21 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5136  ribonuclease P  49.21 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  33.06 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  43.84 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  31 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  32.38 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  34.91 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  32.99 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  38.71 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  32.73 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52470  ribonuclease P  42.86 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  30 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3155  ribonuclease P protein component  41.03 
 
 		 87 aa  57  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0217012  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  31.78 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  38.27 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  32.08 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0821  ribonuclease P protein component  30.91 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  34.69 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1040  ribonuclease P protein component  30.91 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0513155  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  31.25 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  32.99 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6370  ribonuclease P  46.77 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2237  ribonuclease P protein component  37.78 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  46.03 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0983  ribonuclease P protein component  30 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.162194  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0008  ribonuclease P  44.44 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255186 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  29.25 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5311  ribonuclease P  44.44 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346243 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0552  ribonuclease P protein component  30.1 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  34.62 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  32.74 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  36.71 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  31.43 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0001  ribonuclease P  45.16 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  34.15 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  39.58 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  33.73 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  33.73 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  33.68 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  44.44 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  27.05 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  27.05 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  46.03 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  27.43 
 
 		 117 aa  51.2  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  31.71 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1863  RNase P protein component  36.14 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.546361  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  31.71 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  42.68 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  34.15 
 
 		 180 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  31.58 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0708  ribonuclease P protein component  31.25 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  31.07 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  36.54 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0004  ribonuclease P  32.32 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000936038  unclonable  0.0000000000697895 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  30.21 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  31.51 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  34.57 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3868  ribonuclease P  30.48 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000277263  unclonable  0.00000245558 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2760  ribonuclease P  30.77 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000461705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  33.77 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4486  ribonuclease P protein component  42.65 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000175876  hitchhiker  0.00000000129187 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4259  ribonuclease P  33.77 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000742435  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  27.62 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0447  ribonuclease P protein component  29.09 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>