More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2368 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2368  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  148  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495838  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  71.83 
 
 		 71 aa  116  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  57.97 
 
 		 70 aa  100  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  67.16 
 
 		 80 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4368  protein of unknown function DUF37  65.67 
 
 		 68 aa  99.4  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.330154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  62.86 
 
 		 69 aa  99.4  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  64.71 
 
 		 77 aa  97.4  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  55.71 
 
 		 74 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  59.15 
 
 		 70 aa  92.8  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  57.14 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  61.76 
 
 		 79 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  63.08 
 
 		 82 aa  92  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  61.76 
 
 		 79 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2761  protein of unknown function DUF37  62.5 
 
 		 75 aa  92.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000958136  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  57.75 
 
 		 85 aa  91.7  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  59.42 
 
 		 69 aa  92  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  59.42 
 
 		 69 aa  92  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3467  hypothetical protein  60.29 
 
 		 69 aa  90.9  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.034874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  58.57 
 
 		 70 aa  90.9  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  54.29 
 
 		 83 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  60.29 
 
 		 75 aa  90.1  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  63.77 
 
 		 86 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  58.82 
 
 		 78 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  58.82 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  58.82 
 
 		 78 aa  89.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  58.82 
 
 		 78 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  51.43 
 
 		 76 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3214  hypothetical protein  60.56 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  58.82 
 
 		 78 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  62.69 
 
 		 85 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6076  hypothetical protein  56.72 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0967401  normal  0.14341 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  62.69 
 
 		 85 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  58.82 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  58.82 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  58.82 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  62.69 
 
 		 85 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  58.82 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  58.82 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  62.69 
 
 		 85 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  62.69 
 
 		 85 aa  87.8  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  64.62 
 
 		 75 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2948  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 		 72 aa  87  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000335775  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3144  hypothetical protein  57.14 
 
 		 69 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000206652  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  61.54 
 
 		 81 aa  86.3  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  56.34 
 
 		 74 aa  86.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2933  protein of unknown function DUF37  66.13 
 
 		 70 aa  86.7  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000803999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  54.41 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0006  hypothetical protein  58.46 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814058  normal  0.0634451 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  61.19 
 
 		 85 aa  85.9  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5411  hypothetical protein  58.46 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  57.58 
 
 		 72 aa  85.9  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5787  hypothetical protein  58.46 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.702755  normal  0.0165657 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4430  hypothetical protein  59.68 
 
 		 70 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0830  hypothetical protein  55.22 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.854673 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0094  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 		 69 aa  85.1  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  51.43 
 
 		 84 aa  85.5  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  55.88 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  55.88 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6898  protein of unknown function DUF37  55.71 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  52.94 
 
 		 82 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 		 69 aa  84.3  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  58.57 
 
 		 80 aa  84.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  55.22 
 
 		 69 aa  84.3  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  48.57 
 
 		 76 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  48.57 
 
 		 76 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2236  hypothetical protein  55.07 
 
 		 71 aa  84  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660527  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  57.35 
 
 		 82 aa  83.6  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  50.72 
 
 		 75 aa  83.2  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  64.52 
 
 		 64 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  56.92 
 
 		 69 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  52.94 
 
 		 85 aa  83.6  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  52.94 
 
 		 85 aa  83.6  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  55.07 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  58.82 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  58.21 
 
 		 85 aa  82.8  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1566  hypothetical protein  50.75 
 
 		 93 aa  82.8  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154589  normal  0.985446 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  59.42 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4862  protein of unknown function DUF37  52.94 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  57.81 
 
 		 78 aa  82  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3075  hypothetical protein  55.71 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2931  hypothetical protein  55.71 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  54.29 
 
 		 70 aa  81.6  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3643  protein of unknown function DUF37  55.56 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00362393  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  60 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  58.46 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  54.29 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3562  hypothetical protein  61.02 
 
 		 69 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  59.7 
 
 		 86 aa  80.9  0.000000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  62.9 
 
 		 84 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0029  hypothetical protein  60.32 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0101085  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  53.85 
 
 		 86 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4222  hypothetical protein  65.45 
 
 		 69 aa  80.5  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  57.63 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0132  hypothetical protein  61.02 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  61.54 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3624  hypothetical protein  51.43 
 
 		 70 aa  80.1  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.687064  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  55.38 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  54.29 
 
 		 87 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  58.21 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  57.81 
 
 		 69 aa  79.7  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>