More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2355 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  64.45 
 
 		 534 aa  679    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 532 aa  1094    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  47.63 
 
 		 528 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  47.93 
 
 		 538 aa  500  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  48.21 
 
 		 532 aa  488  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  47.66 
 
 		 529 aa  484  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  46.79 
 
 		 533 aa  477  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  47.74 
 
 		 542 aa  472  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  46.88 
 
 		 538 aa  462  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  47.85 
 
 		 515 aa  461  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  47.1 
 
 		 541 aa  458  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  47.46 
 
 		 515 aa  456  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  45.2 
 
 		 531 aa  445  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  45.86 
 
 		 531 aa  444  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  44.53 
 
 		 531 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  44.15 
 
 		 531 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  45.16 
 
 		 531 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  45.68 
 
 		 533 aa  438  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  44.32 
 
 		 537 aa  438  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  44.02 
 
 		 531 aa  437  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  43.71 
 
 		 545 aa  437  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  44.09 
 
 		 532 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  43.85 
 
 		 531 aa  433  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  44.07 
 
 		 534 aa  432  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  43.75 
 
 		 531 aa  428  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  42.78 
 
 		 565 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  44.63 
 
 		 535 aa  425  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  44.44 
 
 		 535 aa  425  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  44.61 
 
 		 535 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  44.36 
 
 		 535 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  43.55 
 
 		 522 aa  427  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  42.7 
 
 		 556 aa  428  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  44.13 
 
 		 531 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2336  L-aspartate oxidase  44.05 
 
 		 533 aa  423  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  43.61 
 
 		 571 aa  424  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  41.98 
 
 		 539 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  42.78 
 
 		 545 aa  422  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  43.94 
 
 		 533 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  43.55 
 
 		 542 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  44.85 
 
 		 847 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  43.33 
 
 		 507 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  42.53 
 
 		 867 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  45.03 
 
 		 532 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1756  L-aspartate oxidase  43.61 
 
 		 502 aa  414  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.863927  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  44.64 
 
 		 532 aa  412  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  42.03 
 
 		 863 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  42.5 
 
 		 531 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  42.16 
 
 		 535 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  43.55 
 
 		 528 aa  411  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  42.94 
 
 		 536 aa  409  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2467  L-aspartate oxidase  43.41 
 
 		 539 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.997427  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  43.08 
 
 		 535 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  41.54 
 
 		 541 aa  409  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  44.81 
 
 		 532 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  41.95 
 
 		 538 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  42.64 
 
 		 542 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  41.41 
 
 		 546 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  42.34 
 
 		 536 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  43.02 
 
 		 538 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  43.02 
 
 		 538 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  42.03 
 
 		 536 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  40.77 
 
 		 534 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  41.46 
 
 		 598 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  41.25 
 
 		 534 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  42.2 
 
 		 537 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  43.9 
 
 		 532 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  43.39 
 
 		 533 aa  402  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  40.38 
 
 		 557 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  42.8 
 
 		 537 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  40.31 
 
 		 534 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  41.09 
 
 		 543 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  41.48 
 
 		 539 aa  402  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  43.66 
 
 		 533 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  42.94 
 
 		 533 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  42.44 
 
 		 532 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  40.86 
 
 		 538 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  40.41 
 
 		 540 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0636  L-aspartate oxidase  41.71 
 
 		 609 aa  401  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  42.2 
 
 		 537 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  41.94 
 
 		 537 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  40.7 
 
 		 535 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  43.19 
 
 		 533 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  41.46 
 
 		 566 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  40.88 
 
 		 555 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  40.66 
 
 		 538 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  43.66 
 
 		 533 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  42.38 
 
 		 523 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  42.2 
 
 		 537 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  42.2 
 
 		 537 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  41.41 
 
 		 537 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  41.22 
 
 		 537 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  40.86 
 
 		 538 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  42 
 
 		 537 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  42.03 
 
 		 579 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  41.35 
 
 		 537 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  42.63 
 
 		 575 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  41.95 
 
 		 534 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  42.46 
 
 		 572 aa  398  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0012  L-aspartate oxidase  43.6 
 
 		 528 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  41.73 
 
 		 543 aa  398  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>