235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2339 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2339  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 347 aa  714    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5391  glycosyl transferase, group 1 family protein  47.08 
 
 		 345 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0110  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.01 
 
 		 346 aa  138  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000484936 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0080  hypothetical protein  22.45 
 
 		 513 aa  65.1  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.03 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  22.77 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.03 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1448  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.92 
 
 		 502 aa  59.3  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.622489  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 		 410 aa  59.3  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0193  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2598  glycosyl transferase group 1  23.95 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5854  putative glycosyl transferase  22.08 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3180  glycosyl transferase, group 1  22.54 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.780891  normal  0.107104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14750  glycosyltransferase  26.74 
 
 		 743 aa  57  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041718 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 		 385 aa  57  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 392 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0384  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1499  glycosyl transferase, group 1  24.63 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 412 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1588  glycosyltransferase  23.6 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  23.01 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000347461 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 		 410 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  21.79 
 
 		 426 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 		 380 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  35.8 
 
 		 536 aa  53.9  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  22.5 
 
 		 452 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  21.24 
 
 		 396 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0894  glycosyl transferase group 1  42.25 
 
 		 381 aa  53.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.346832  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 		 377 aa  53.1  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 		 380 aa  52.8  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3427  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 435 aa  52.8  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000419175  normal  0.0303582 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2275  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.58 
 
 		 502 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1005  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 357 aa  52.4  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.105019  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  24.18 
 
 		 803 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1256  hypothetical protein  25.54 
 
 		 500 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1727  glycosyl transferase group 1  23.95 
 
 		 389 aa  50.8  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00570551  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1608  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 		 380 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372835  normal  0.872915 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 		 391 aa  50.4  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0598  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 385 aa  50.1  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 		 412 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0452  glycosyltransferase, putative teichoic acid biosynthesis protein  29.3 
 
 		 503 aa  50.1  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 		 412 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 		 412 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1322  glycosyl transferase, group 1  23.74 
 
 		 342 aa  50.1  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  24.17 
 
 		 819 aa  49.7  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1955  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 		 768 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.303263  normal  0.277598 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1121  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 		 386 aa  49.7  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.606067  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 		 382 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  32 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 408 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1833  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.84 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0326  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  33.65 
 
 		 371 aa  48.1  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0416  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 		 355 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.552553  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  24.66 
 
 		 420 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2859  glycosyl transferase, group 1  21.85 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1108  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 357 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0280638  normal  0.0326528 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 		 439 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 		 689 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  24.09 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 		 410 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0012  a-glycosyltransferase  29.41 
 
 		 379 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0922  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 		 365 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  23.91 
 
 		 402 aa  47  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2867  glycosyl transferase group 1  23.2 
 
 		 378 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 		 370 aa  47  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  21.88 
 
 		 386 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  23.49 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 389 aa  47.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.53 
 
 		 365 aa  47  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0696  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 378 aa  47  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 		 370 aa  47  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  24.14 
 
 		 433 aa  47  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  36.25 
 
 		 411 aa  47  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 400 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  26.42 
 
 		 376 aa  46.6  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0766  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 		 339 aa  46.6  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3209  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 		 355 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  22.13 
 
 		 348 aa  46.6  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  21.82 
 
 		 380 aa  46.6  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  26.42 
 
 		 376 aa  46.6  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 		 812 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  22.62 
 
 		 409 aa  46.6  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 		 360 aa  46.6  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>