157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2297 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 		 330 aa  672    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  63.86 
 
 		 331 aa  429  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  60.3 
 
 		 330 aa  424  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  57.96 
 
 		 333 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  58.18 
 
 		 330 aa  418  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  57.96 
 
 		 333 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  58.61 
 
 		 331 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  57.27 
 
 		 330 aa  409  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  58.48 
 
 		 330 aa  410  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  58.79 
 
 		 330 aa  406  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  58.18 
 
 		 330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  52.87 
 
 		 331 aa  388  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  51.66 
 
 		 331 aa  382  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  52.73 
 
 		 330 aa  381  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  53.78 
 
 		 331 aa  375  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  52.27 
 
 		 331 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  51.4 
 
 		 319 aa  345  7e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  50.76 
 
 		 330 aa  335  9e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  48.95 
 
 		 333 aa  332  6e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  45.81 
 
 		 333 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.18 
 
 		 338 aa  296  3e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.26 
 
 		 327 aa  295  8e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  45.62 
 
 		 326 aa  295  8e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  45.32 
 
 		 330 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.38 
 
 		 321 aa  293  4e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.73 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  43.5 
 
 		 326 aa  277  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  39.27 
 
 		 360 aa  261  8e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  37.16 
 
 		 330 aa  261  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.16 
 
 		 328 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  37.67 
 
 		 384 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0303  hypothetical protein  49.03 
 
 		 259 aa  255  7e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00506761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  36.25 
 
 		 330 aa  248  7e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3000  CRISPR-associated protein Cas1  39.04 
 
 		 335 aa  245  6e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0143403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1803  hypothetical protein  39.45 
 
 		 333 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0665  CRISPR-associated protein Cas1  40.13 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100069  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  35.15 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0903  CRISPR-associated protein Cas1  37.92 
 
 		 334 aa  232  8.000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.019611  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1019  CRISPR-associated protein Cas1  35.17 
 
 		 321 aa  210  2e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000325858  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1287  CRISPR-associated protein Cas1  33.43 
 
 		 332 aa  189  4e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0188131  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1425  CRISPR-associated protein Cas1  33.53 
 
 		 332 aa  189  4e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00327845  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0999  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.18 
 
 		 326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  31.23 
 
 		 545 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.85 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0937  CRISPR-associated protein Cas1  27.52 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  26.38 
 
 		 598 aa  150  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  26.71 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  29.33 
 
 		 594 aa  139  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  28.26 
 
 		 325 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  28.26 
 
 		 325 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  28.28 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.71 
 
 		 544 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.74 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  25.79 
 
 		 553 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  27.19 
 
 		 334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.59 
 
 		 343 aa  133  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  24.92 
 
 		 550 aa  130  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.22 
 
 		 339 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  25.64 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.33 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  28.32 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.03 
 
 		 330 aa  123  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  23.46 
 
 		 580 aa  123  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  24.91 
 
 		 570 aa  123  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.08 
 
 		 347 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  24.31 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  25.53 
 
 		 339 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  25 
 
 		 341 aa  119  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.71 
 
 		 333 aa  119  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  25.38 
 
 		 344 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  22.36 
 
 		 346 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.08 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  26.6 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.05 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.4 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  24.26 
 
 		 343 aa  116  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.2 
 
 		 344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  27.57 
 
 		 333 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  24.56 
 
 		 346 aa  112  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  25.86 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  24.05 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  28.47 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  25.17 
 
 		 559 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.48 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  25.95 
 
 		 344 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  24.85 
 
 		 343 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  24.68 
 
 		 525 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.15 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  23.21 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  24.44 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  26.89 
 
 		 336 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.35 
 
 		 344 aa  106  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.22 
 
 		 344 aa  106  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.42 
 
 		 347 aa  106  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  24.4 
 
 		 727 aa  105  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  25.78 
 
 		 344 aa  102  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  25.74 
 
 		 342 aa  102  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  24.05 
 
 		 346 aa  102  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.86 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.75 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>