16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2275 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2275  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  634    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.972527  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0741  putative phage resistance protein  23.29 
 
 		 417 aa  56.2  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333006  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0493  abortive infection protein  24.4 
 
 		 407 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2064  hypothetical protein  23.84 
 
 		 421 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.906065  normal  0.239178 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1118  SMC domain-containing protein  24.48 
 
 		 368 aa  51.2  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.266234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1948  abortive phage resistance protein-like protein  27.37 
 
 		 454 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1557  hypothetical protein  22.44 
 
 		 422 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2132  abortive infection protein, putative  24.93 
 
 		 432 aa  49.7  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.903649  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0903  hypothetical protein  24.59 
 
 		 429 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4229  abortive infection protein  30 
 
 		 405 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0079  abortive infection protein, putative  38.71 
 
 		 433 aa  44.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2014  hypothetical protein  22.4 
 
 		 449 aa  44.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  34.33 
 
 		 1209 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0050  hypothetical protein  23.61 
 
 		 451 aa  43.1  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1573  SMC domain-containing protein  43.33 
 
 		 373 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0501523  normal  0.47865 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2870  hypothetical protein  31.58 
 
 		 435 aa  43.1  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.716536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>