More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2238 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2238  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
472 aa  965    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0821  Aldehyde Dehydrogenase  45.61 
 
 
475 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0672695  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0607  aldehyde dehydrogenase  47.59 
 
 
484 aa  451  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549994  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0438  aldehyde dehydrogenase  46.72 
 
 
484 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0433999  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1742  Aldehyde Dehydrogenase  44.02 
 
 
476 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0440  aldehyde dehydrogenase  48.27 
 
 
483 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461443  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5442  aldehyde dehydrogenase  45.99 
 
 
486 aa  434  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274338  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4268  Aldehyde Dehydrogenase  47.43 
 
 
462 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1254  aldehyde dehydrogenase  44.08 
 
 
471 aa  413  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38059  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5303  aldehyde dehydrogenase  41.97 
 
 
485 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0165  Aldehyde Dehydrogenase  44.71 
 
 
459 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0486514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2524  aldehyde dehydrogenase  39.31 
 
 
537 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00255525  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2652  aldehyde dehydrogenase  44.92 
 
 
459 aa  376  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1456  aldehyde dehydrogenase  43.81 
 
 
459 aa  372  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.133276  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2181  Aldehyde Dehydrogenase  43.97 
 
 
456 aa  375  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2010  aldehyde dehydrogenase  44.04 
 
 
459 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3041  aldehyde dehydrogenase  45.91 
 
 
461 aa  371  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0334  Aldehyde Dehydrogenase  42.45 
 
 
465 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1977  aldehyde dehydrogenase  44.04 
 
 
459 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.205682  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0489  aldehyde dehydrogenase  42.56 
 
 
459 aa  368  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0498787 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2358  aldehyde Dehydrogenase  41.76 
 
 
461 aa  363  3e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1200  aldehyde dehydrogenase  44.25 
 
 
455 aa  362  6e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.625274  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3615  aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
460 aa  362  8e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.30982  normal  0.838762 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1197  aldehyde dehydrogenase  40.73 
 
 
448 aa  361  1e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.238764  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0742  aldehyde dehydrogenase  40.95 
 
 
468 aa  361  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0105  aldehyde dehydrogenase  42.05 
 
 
470 aa  360  4e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4713  aldehyde dehydrogenase  43.79 
 
 
442 aa  358  8e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2296  aldehyde dehydrogenase  43.89 
 
 
458 aa  358  8e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.69034  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1918  Aldehyde Dehydrogenase  42.73 
 
 
475 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1336  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  43.14 
 
 
455 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1438  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.7 
 
 
455 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00047952  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1176  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  42.05 
 
 
455 aa  354  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0016  aldehyde dehydrogenase  39.26 
 
 
475 aa  354  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2610  aldehyde dehydrogenase  43.88 
 
 
458 aa  354  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.514086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4008  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.48 
 
 
455 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.148119  hitchhiker  0.00000000000192548 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2512  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  42.63 
 
 
457 aa  353  5e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00297812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1198  aldehyde dehydrogenase  42.89 
 
 
455 aa  352  7e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.869515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1296  aldehyde dehydrogenase  42.89 
 
 
455 aa  352  7e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1397  aldehyde dehydrogenase  43.57 
 
 
455 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1374  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.89 
 
 
455 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0449  Aldehyde Dehydrogenase  38.13 
 
 
456 aa  348  8e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1178  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  43.12 
 
 
455 aa  347  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.198851  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04810  putative aldehyde dehydrogenase  39.14 
 
 
476 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3572  aldehyde dehydrogenase  39.18 
 
 
481 aa  347  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.072637  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2579  aldehyde dehydrogenase  39 
 
 
478 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00587  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  41.04 
 
 
468 aa  345  1e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0460  putative aldehyde dehydrogenase  38.92 
 
 
476 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0080  aldehyde dehydrogenase  38.1 
 
 
470 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0099  aldehyde dehydrogenase  39.09 
 
 
470 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0090  aldehyde dehydrogenase  39.09 
 
 
470 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3103  aldehyde dehydrogenase  38.03 
 
 
474 aa  343  5e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2547  Aldehyde Dehydrogenase  38.66 
 
 
481 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.975135  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4187  aldehyde dehydrogenase  37.64 
 
 
476 aa  342  8e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1028  Aldehyde Dehydrogenase  37.82 
 
 
474 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.889075 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21711  putative aldehyde dehydrogenase  38.57 
 
 
459 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0450332 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3195  aldehyde dehydrogenase  38.88 
 
 
496 aa  341  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3332  aldehyde dehydrogenase  37.82 
 
 
474 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1040  aldehyde dehydrogenase  37.82 
 
 
474 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.820564 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0988  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  37.53 
 
 
475 aa  340  4e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1007  aldehyde dehydrogenase  37.82 
 
 
474 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5205  aldehyde dehydrogenase  36.95 
 
 
498 aa  338  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08936  aldehyde dehydrogenase  39.26 
 
 
457 aa  337  2.9999999999999997e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.539716  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3150  aldehyde dehydrogenase  39.43 
 
 
474 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14840  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  37.85 
 
 
481 aa  337  3.9999999999999995e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0170872  normal  0.129561 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3253  aldehyde dehydrogenase  37.74 
 
 
487 aa  336  5e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0133422  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5170  aldehyde dehydrogenase  37.23 
 
 
476 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0872  aldehyde dehydrogenase  39.21 
 
 
474 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0345  aldehyde dehydrogenase  37.14 
 
 
480 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.403687  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5345  aldehyde dehydrogenase  37.04 
 
 
476 aa  335  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3683  coniferyl aldehyde dehydrogenase  39.61 
 
 
474 aa  334  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0497  putative aldehyde dehydrogenase  38.8 
 
 
459 aa  335  2e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0365666 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2982  aldehyde dehydrogenase  36.75 
 
 
474 aa  333  5e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4064  aldehyde dehydrogenase  40.27 
 
 
479 aa  333  5e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2218  aldehyde dehydrogenase  37.47 
 
 
474 aa  332  6e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0696851 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04241  putative aldehyde dehydrogenase  40.98 
 
 
459 aa  332  7.000000000000001e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.844488 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000269  aldehyde dehydrogenase  42.14 
 
 
470 aa  332  9e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2151  coniferyl aldehyde dehydrogenase  37.5 
 
 
472 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3273  coniferyl aldehyde dehydrogenase  37.5 
 
 
472 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  37.5 
 
 
472 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0214  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  37.5 
 
 
472 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  37.5 
 
 
472 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2938  coniferyl aldehyde dehydrogenase  37.5 
 
 
472 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0226  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  37.28 
 
 
472 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3716  coniferyl aldehyde dehydrogenase  38.74 
 
 
476 aa  330  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425789  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1636  aldehyde dehydrogenase  37.98 
 
 
473 aa  330  4e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.290647  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3251  aldehyde dehydrogenase  40.38 
 
 
474 aa  330  4e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2855  coniferyl aldehyde dehydrogenase  39 
 
 
479 aa  329  6e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0841165  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7472  aldehyde dehydrogenase  36.81 
 
 
491 aa  329  6e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1709  putative aldehyde dehydrogenase  41.1 
 
 
459 aa  329  7e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0791372  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4994  aldehyde dehydrogenase  37.44 
 
 
474 aa  329  8e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2304  aldehyde dehydrogenase  37.98 
 
 
476 aa  328  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0418  coniferyl aldehyde dehydrogenase  38.73 
 
 
475 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1251  aldehyde dehydrogenase  38.1 
 
 
478 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.502305  hitchhiker  0.0082854 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01050  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  38.99 
 
 
504 aa  327  2.0000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.958772  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0937  aldehyde dehydrogenase  37.74 
 
 
473 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0300  aldehyde dehydrogenase  38.86 
 
 
458 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0223565  hitchhiker  0.0000134902 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5226  aldehyde dehydrogenase  35.86 
 
 
479 aa  326  5e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1838  putative aldehyde dehydrogenase  38.66 
 
 
459 aa  326  7e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2479  Aldehyde Dehydrogenase  39.73 
 
 
469 aa  326  7e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.410895  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1058  aldehyde dehydrogenase family protein  37.47 
 
 
466 aa  325  8.000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0704571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>