More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2236 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2236  flagellin-like protein  100 
 
 
272 aa  540  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  85.82 
 
 
273 aa  447  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  66.79 
 
 
272 aa  337  1e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  56.13 
 
 
327 aa  319  2e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  57.09 
 
 
282 aa  303  2e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  58.91 
 
 
277 aa  295  4e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  60.14 
 
 
275 aa  293  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  56.46 
 
 
263 aa  282  5e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0315  flagellin domain-containing protein  55.96 
 
 
278 aa  281  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  56.46 
 
 
263 aa  279  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  57.14 
 
 
266 aa  278  9e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4305  flagellin domain protein  55.35 
 
 
262 aa  277  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0943523  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4306  flagellin domain protein  55.72 
 
 
263 aa  277  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240686  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2038  flagellin domain protein  53.77 
 
 
295 aa  275  4e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.416457 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2035  flagellin domain protein  54.27 
 
 
295 aa  275  8e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.546619 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2036  flagellin domain protein  51.99 
 
 
304 aa  273  2e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.391359 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2037  flagellin domain protein  51.89 
 
 
293 aa  268  6e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  55.68 
 
 
265 aa  266  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0100  flagellin domain protein  58.7 
 
 
273 aa  256  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0102  flagellin domain protein  58.7 
 
 
276 aa  256  4e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  50.55 
 
 
276 aa  254  9e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0101  flagellin domain protein  56.32 
 
 
273 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1004  flagellar filament core protein  49.47 
 
 
286 aa  247  1e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1039  flagellin domain protein  48.2 
 
 
278 aa  246  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  50 
 
 
280 aa  245  5e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  47.64 
 
 
274 aa  242  4e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0623  flagellin domain protein  48.79 
 
 
290 aa  242  5e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  50.18 
 
 
276 aa  241  8e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1477  flagellar filament core protein  47.72 
 
 
286 aa  239  4e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  48.71 
 
 
271 aa  238  8e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  48.71 
 
 
271 aa  238  8e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  55.51 
 
 
420 aa  233  2e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  46.32 
 
 
272 aa  233  2e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  47.97 
 
 
271 aa  233  2e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  46.32 
 
 
272 aa  233  2e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  47.97 
 
 
271 aa  233  2e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3088  flagellin-like  45.82 
 
 
274 aa  233  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  50 
 
 
271 aa  233  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  50 
 
 
271 aa  233  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1475  flagellar filament core protein  47.89 
 
 
285 aa  233  3e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  50 
 
 
271 aa  232  4e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2519  flagellin domain protein  47.1 
 
 
279 aa  232  6e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000201488  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  47.23 
 
 
271 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  45.96 
 
 
274 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2615  flagellin domain protein  46.74 
 
 
279 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  1.13225e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  47.23 
 
 
271 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  50.18 
 
 
271 aa  231  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1792  flagellin domain protein  48.9 
 
 
285 aa  230  2e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  47.04 
 
 
272 aa  228  9e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  43.34 
 
 
294 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  50.18 
 
 
271 aa  227  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0456  flagellin domain-containing protein  69.23 
 
 
404 aa  226  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  45.65 
 
 
279 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  49.82 
 
 
271 aa  226  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  49.82 
 
 
271 aa  226  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  43.84 
 
 
294 aa  225  5e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  47.21 
 
 
270 aa  225  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  49.08 
 
 
271 aa  225  7e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  45.59 
 
 
274 aa  224  9e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  45.42 
 
 
273 aa  223  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  45.42 
 
 
273 aa  222  5e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  46.13 
 
 
273 aa  222  5e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2611  flagellin domain protein  45.29 
 
 
278 aa  221  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409959  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2515  flagellin domain protein  45.29 
 
 
278 aa  221  1e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0378301  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  44.65 
 
 
273 aa  220  2e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1342  flagellin-like  45.29 
 
 
278 aa  220  2e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308098  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  43.96 
 
 
275 aa  220  2e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  45.79 
 
 
276 aa  219  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  43.59 
 
 
275 aa  218  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  45.93 
 
 
272 aa  217  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0630  flagellin domain protein  47.01 
 
 
281 aa  217  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.892831  hitchhiker  4.86769e-06 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  45.76 
 
 
273 aa  217  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  47.04 
 
 
271 aa  216  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0618  flagellin domain-containing protein  44.76 
 
 
290 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2938  flagellin-like protein  47.78 
 
 
272 aa  215  7e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1375  flagellin  44.85 
 
 
271 aa  214  1e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.44656e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  46.36 
 
 
272 aa  214  1e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  45.65 
 
 
278 aa  213  2e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  44.65 
 
 
273 aa  214  2e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  45.19 
 
 
272 aa  213  2e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  45.07 
 
 
283 aa  213  2e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  65.87 
 
 
380 aa  213  2e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  45.65 
 
 
279 aa  213  2e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0631  flagellin domain protein  47.39 
 
 
281 aa  211  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  5.36021e-06 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3076  flagellin  42.86 
 
 
273 aa  209  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2429  flagellin domain-containing protein  72.67 
 
 
713 aa  208  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  43.7 
 
 
272 aa  207  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  46.35 
 
 
275 aa  206  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  43.33 
 
 
272 aa  206  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  44.77 
 
 
279 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  63.31 
 
 
383 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.59197e-07 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1608  flagellin domain-containing protein  43.54 
 
 
273 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2887  flagellin domain protein  45.29 
 
 
278 aa  206  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  46.52 
 
 
314 aa  206  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0071  flagellin domain-containing protein  47.71 
 
 
377 aa  206  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0550639 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3024  flagellin domain protein  73.38 
 
 
339 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  44.88 
 
 
287 aa  206  5e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0062  flagellin domain-containing protein  45.9 
 
 
256 aa  205  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1986  flagellin-like protein  45.88 
 
 
285 aa  204  9e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.462318  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1709  flagellin  45.89 
 
 
297 aa  204  9e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00621943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>