More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2194 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  100 
 
 		 501 aa  1025    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  69.7 
 
 		 837 aa  684    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  59.15 
 
 		 490 aa  558  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  68.4 
 
 		 965 aa  312  7.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  64.45 
 
 		 928 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1407  putative esterase  47.78 
 
 		 640 aa  259  8e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00376031  normal  0.509577 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0708  putative esterase  47.31 
 
 		 285 aa  255  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  48.31 
 
 		 536 aa  242  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  46.82 
 
 		 780 aa  238  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  62.26 
 
 		 533 aa  238  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  52.91 
 
 		 541 aa  233  5e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4242  putative esterase  44.06 
 
 		 638 aa  233  7.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.630883  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  56.59 
 
 		 1015 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3878  putative esterase  47.81 
 
 		 560 aa  231  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  52.63 
 
 		 1122 aa  230  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  54.29 
 
 		 604 aa  229  9e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  56.06 
 
 		 951 aa  228  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  49.18 
 
 		 746 aa  227  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  55.66 
 
 		 1164 aa  227  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0345  putative esterase  46.22 
 
 		 305 aa  221  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  51.26 
 
 		 524 aa  213  9e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  51.98 
 
 		 509 aa  210  6e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  52.66 
 
 		 629 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  49.76 
 
 		 683 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  52.4 
 
 		 679 aa  189  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  48.51 
 
 		 535 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  59.09 
 
 		 912 aa  163  9e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  53.73 
 
 		 464 aa  159  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  41.86 
 
 		 630 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  54.07 
 
 		 618 aa  156  8e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1859  putative esterase  38.06 
 
 		 383 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1408  putative esterase  38.08 
 
 		 388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0188455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3222  putative esterase  35.88 
 
 		 376 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.349427  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3245  putative esterase  35.25 
 
 		 392 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.458402  normal  0.0540976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0331  putative esterase  36.95 
 
 		 392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101321 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0108  putative esterase  37.9 
 
 		 369 aa  131  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1911  carbohydrate-binding family 6 protein  46.53 
 
 		 1290 aa  130  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.374482  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1412  putative esterase  41.8 
 
 		 359 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1256  putative esterase  37.71 
 
 		 375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1413  putative esterase  35.04 
 
 		 388 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1414  putative esterase  37.39 
 
 		 375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1254  putative esterase  31.25 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  46.27 
 
 		 479 aa  118  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  44.36 
 
 		 469 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1411  putative esterase  34.6 
 
 		 372 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0835  putative esterase  33.6 
 
 		 401 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4248  glycoside hydrolase family 13 domain protein  31.46 
 
 		 389 aa  110  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0298  putative esterase  32.34 
 
 		 286 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777822  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  42.96 
 
 		 566 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  46.27 
 
 		 479 aa  110  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1707  putative esterase  30.83 
 
 		 394 aa  109  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4275  glycoside hydrolase family 13 protein  31.09 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1670  putative esterase  30.71 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03603  predicted xylanase  31.23 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03547  hypothetical protein  31.23 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4228  putative esterase  31.23 
 
 		 364 aa  107  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  42.97 
 
 		 470 aa  106  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  41.96 
 
 		 1186 aa  106  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0091  putative esterase  30.28 
 
 		 882 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2433  glycoside hydrolase family 13 domain protein  30.95 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2738  glycoside hydrolase family 13 domain protein  30.56 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3614  putative esterase  29.07 
 
 		 315 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  35.76 
 
 		 630 aa  98.6  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  28.48 
 
 		 391 aa  98.2  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  31.34 
 
 		 1077 aa  98.2  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  64.86 
 
 		 948 aa  94.4  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  40.71 
 
 		 541 aa  92  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1741  esterase/lipase-like protein  30.34 
 
 		 631 aa  92  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0611967  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  40.15 
 
 		 464 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.46 
 
 		 945 aa  91.3  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0297  putative esterase  27.38 
 
 		 342 aa  90.5  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.203768  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  38.35 
 
 		 536 aa  90.5  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2669  Carbohydrate-binding family 9  33.7 
 
 		 535 aa  90.5  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3463  Carbohydrate-binding family 9  31.27 
 
 		 691 aa  90.1  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0207696  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1456  esterase, putative  30.16 
 
 		 281 aa  90.1  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.52 
 
 		 953 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3201  putative esterase  28.96 
 
 		 312 aa  87.4  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  39.13 
 
 		 884 aa  86.7  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4497  putative esterase  30.5 
 
 		 314 aa  86.7  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1370  putative esterase  29.76 
 
 		 281 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1289  putative esterase  29.76 
 
 		 290 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2544  putative esterase  29.76 
 
 		 290 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110736  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1030  putative esterase  29.76 
 
 		 281 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0267  putative esterase  29.76 
 
 		 281 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0537  putative esterase  29.76 
 
 		 281 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1290  putative esterase  29.76 
 
 		 281 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601203  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1232  putative esterase  31.12 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5695  putative esterase  31.12 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712363 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3759  putative esterase  31.12 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4039  putative esterase  31.12 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4609  putative esterase  31.12 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.006335 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  28.57 
 
 		 640 aa  84.3  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4037  putative esterase  30.74 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.205002 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0523  putative esterase  29.52 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00718904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4946  putative esterase  34.68 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580943  normal  0.169227 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  29.25 
 
 		 401 aa  83.2  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  38.28 
 
 		 1444 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1701  hypothetical protein  34.68 
 
 		 291 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.202768  normal  0.542752 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2879  cellulosome enzyme, dockerin type I  58.73 
 
 		 511 aa  82  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42565  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3530  putative esterase  28.98 
 
 		 302 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>