More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2181 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2181  ATPase  100 
 
 		 237 aa  488  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000263465  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3405  PP-loop domain protein  72.15 
 
 		 239 aa  369  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1810  PP-loop domain-containing protein  57.21 
 
 		 235 aa  281  9e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657331  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2259  PP-loop domain-containing protein  52.54 
 
 		 242 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000140384  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  52.4 
 
 		 235 aa  262  3e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  52.4 
 
 		 244 aa  247  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  52.4 
 
 		 244 aa  247  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  51.74 
 
 		 252 aa  234  7e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2367  PP-loop domain protein  48.05 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  41.45 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1011  PP family ATPase  48.31 
 
 		 240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0407194  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  44.28 
 
 		 244 aa  188  5.999999999999999e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20940  PP-loop domain protein  40.68 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000433533  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  39.09 
 
 		 247 aa  175  7e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  39.04 
 
 		 282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1391  hypothetical protein  37.27 
 
 		 260 aa  158  7e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.738362  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  36.24 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  37.99 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  39.55 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3479  C32 tRNA thiolase  37.9 
 
 		 258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0182  PP-loop  36.68 
 
 		 279 aa  151  7e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  37.44 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  37.44 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3499  C32 tRNA thiolase  38.7 
 
 		 269 aa  149  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00810912  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1773  C32 tRNA thiolase  38.7 
 
 		 313 aa  148  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  39.21 
 
 		 252 aa  148  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  37.73 
 
 		 292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0928  PP-loop family protein  35.83 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2075  PP-loop domain protein  35.45 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  37.72 
 
 		 311 aa  146  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0182  PP-loop domain-containing protein  33.76 
 
 		 288 aa  146  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  37 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  37 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0731  PP-loop domain protein  36.99 
 
 		 286 aa  146  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1238  PP-loop domain protein  36.89 
 
 		 283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2316  C32 tRNA thiolase  38.16 
 
 		 311 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0527  PP-loop domain protein  35.81 
 
 		 250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2142  C32 tRNA thiolase  38.6 
 
 		 311 aa  145  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.614557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0125  PP-loop family protein  33.77 
 
 		 253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.658918  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1746  PP-loop family protein  33.47 
 
 		 345 aa  145  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0604543  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1477  PP-loop family protein  33.47 
 
 		 345 aa  145  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170101  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01321  predicted C32 tRNA thiolase  38.16 
 
 		 311 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01331  hypothetical protein  38.16 
 
 		 311 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1558  C32 tRNA thiolase  38.16 
 
 		 311 aa  145  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2281  C32 tRNA thiolase  38.16 
 
 		 311 aa  145  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.787518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1461  C32 tRNA thiolase  38.16 
 
 		 311 aa  145  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1514  PP-loop family protein  35 
 
 		 250 aa  145  6e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1993  C32 tRNA thiolase  38.16 
 
 		 311 aa  145  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800343 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2299  PP-loop domain protein  38.16 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00162169  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0113  PP-loop family protein  33.77 
 
 		 251 aa  144  8.000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0227  C32 tRNA thiolase  36.12 
 
 		 312 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384347  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4143  C32 tRNA thiolase  37.72 
 
 		 287 aa  144  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  37.83 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  36.96 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1778  C32 tRNA thiolase  38.16 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1698  PP-loop domain protein  37.61 
 
 		 284 aa  143  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0206  conserved hypothetical protein, putative ATPase (PP-loop superfamily)  32.51 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0153  PP-loop family protein  33.77 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0100242  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0228  C32 tRNA thiolase  36.44 
 
 		 303 aa  142  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.608428 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1738  C32 tRNA thiolase  37.28 
 
 		 313 aa  143  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2354  C32 tRNA thiolase  37.18 
 
 		 310 aa  142  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1589  C32 tRNA thiolase  39.39 
 
 		 311 aa  142  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2020  C32 tRNA thiolase  36.36 
 
 		 312 aa  142  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1247  C32 tRNA thiolase  37.39 
 
 		 313 aa  141  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  37.72 
 
 		 311 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  37.72 
 
 		 311 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  37.72 
 
 		 311 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  37.72 
 
 		 311 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1130  PP-loop domain protein  37.91 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1407  PP-loop family protein  37.67 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  37.72 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  37.72 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2223  PP-loop domain-containing protein  34.98 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  36.56 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0184  C32 tRNA thiolase  35.68 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  35.9 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2016  C32 tRNA thiolase  35.93 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1959  C32 tRNA thiolase  35.93 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791076 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1613  PP-loop domain-containing protein  36.28 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2117  C32 tRNA thiolase  35.93 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0387293 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  40.47 
 
 		 307 aa  139  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1949  C32 tRNA thiolase  35.9 
 
 		 310 aa  139  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2211  C32 tRNA thiolase  35.06 
 
 		 310 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000587998  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  35.37 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4497  C32 tRNA thiolase  35.06 
 
 		 310 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  35.37 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  35.22 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  35.22 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2210  C32 tRNA thiolase  35.06 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  35.65 
 
 		 323 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  35.65 
 
 		 290 aa  138  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1912  C32 tRNA thiolase  38.1 
 
 		 313 aa  138  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1802  C32 tRNA thiolase  38.1 
 
 		 313 aa  138  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2206  C32 tRNA thiolase  38.1 
 
 		 313 aa  138  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.840796 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1167  C32 tRNA thiolase  35.5 
 
 		 256 aa  138  7e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.958339  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2225  C32 tRNA thiolase  35.37 
 
 		 310 aa  138  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28353 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1749  PP-loop family protein  32.92 
 
 		 256 aa  138  8.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.10614  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2160  C32 tRNA thiolase  34.63 
 
 		 322 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00960533  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2224  C32 tRNA thiolase  34.63 
 
 		 322 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000167986  normal  0.0826377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  36.09 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>