More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2172 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  100 
 
 		 70 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  70.15 
 
 		 69 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  67.69 
 
 		 71 aa  102  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  64.62 
 
 		 65 aa  100  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  64.62 
 
 		 66 aa  100  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  66.67 
 
 		 76 aa  100  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 72 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  64.62 
 
 		 65 aa  99.8  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  65.62 
 
 		 66 aa  99.8  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1068  50S ribosomal protein L31  67.16 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.113765  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 73 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2179  50S ribosomal protein L31  64.18 
 
 		 82 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00985809  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0090  50S ribosomal protein L31  64.71 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141122  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  65.67 
 
 		 67 aa  98.2  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  63.08 
 
 		 66 aa  98.2  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2469  50S ribosomal protein L31  64.18 
 
 		 68 aa  98.6  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  67.19 
 
 		 66 aa  97.4  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 74 aa  96.3  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  60.94 
 
 		 73 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1910  ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 67 aa  94.4  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1235  ribosomal protein L31  63.64 
 
 		 76 aa  94.7  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.803826  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  66.15 
 
 		 75 aa  94.4  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3438  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 66 aa  94  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4835  50S ribosomal protein L31  64.62 
 
 		 65 aa  93.6  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18000  ribosomal protein L31  59.7 
 
 		 68 aa  92.8  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000315531  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2399  ribosomal protein L31  64.18 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00761276  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  61.19 
 
 		 75 aa  92.8  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3328  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410329  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1908  ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 75 aa  91.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  63.08 
 
 		 72 aa  91.7  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  59.7 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140602  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4340  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 74 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0385  50S ribosomal protein L31  59.7 
 
 		 75 aa  90.9  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143362  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3172  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 66 aa  90.9  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2073  50S ribosomal protein L31  58.21 
 
 		 75 aa  90.5  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000264126  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04660  ribosomal protein L31  59.38 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  hitchhiker  0.0000489926 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3074  ribosomal protein L31  54.41 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000909466  unclonable  0.0000000191791 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2306  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 70 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09270  ribosomal protein L31  56.25 
 
 		 175 aa  89  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0668884 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1117  ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000320944  hitchhiker  0.000000000000256974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6151  ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 70 aa  89.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.77799  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1009  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 78 aa  88.6  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.622612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29920  LSU ribosomal protein L31P  60.61 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.568534 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0062  ribosomal protein L31  58.21 
 
 		 68 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000350095  hitchhiker  0.00194298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3874  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 81 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0952306 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0801  ribosomal protein L31  62.5 
 
 		 68 aa  88.6  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000158788  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3888  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 81 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3962  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 81 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845671  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  58.21 
 
 		 75 aa  88.2  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0453  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 71 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0724  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0490  ribosomal protein L31  53.97 
 
 		 94 aa  87.4  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0725  ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2100  ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 70 aa  87.4  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185823  normal  0.0569563 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3721  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 78 aa  87.4  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1472  50S ribosomal protein L31P  56.72 
 
 		 77 aa  87  7e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025459  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6576  ribosomal protein L31  62.71 
 
 		 70 aa  87  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4636  ribosomal protein L31  60 
 
 		 73 aa  87  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_002936  DET1327  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 68 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00511873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1204  ribosomal protein L31  56.52 
 
 		 72 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3793  ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 71 aa  86.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1256  ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 82 aa  86.3  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0693718  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001744  LSU ribosomal protein L31p  57.58 
 
 		 73 aa  86.3  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2084  ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 74 aa  86.3  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000294546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 69 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00728  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 72 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 79 aa  86.3  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1138  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 68 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1109  ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 68 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000439538  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 79 aa  86.3  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 71 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 65 aa  85.5  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11325  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 80 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0128784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1087  ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 70 aa  85.5  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 70 aa  85.9  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2982  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3932  ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 73 aa  85.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0604  50S ribosomal protein L31P  56.72 
 
 		 71 aa  86.3  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4149  ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 74 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 66 aa  85.5  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0061  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000149068  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2967  ribosomal protein L31  50.75 
 
 		 67 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000717812  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 66 aa  85.5  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03520  50S ribosomal subunit protein L31  60 
 
 		 70 aa  85.1  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1786  ribosomal protein L31  53.62 
 
 		 69 aa  85.1  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09910  LSU ribosomal protein L31P  56.06 
 
 		 69 aa  85.1  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2003  ribosomal protein L31  52.24 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14904  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0114  ribosomal protein L31  51.56 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.434874  normal  0.146385 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0640  50S ribosomal protein L31P  56.06 
 
 		 86 aa  85.1  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.045358 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2420  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 69 aa  84.7  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.534743  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  52.24 
 
 		 68 aa  84.7  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  54.41 
 
 		 74 aa  84.3  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0823  ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 73 aa  84.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.013762  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2460  ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 71 aa  84.3  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2301  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 70 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2792  ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 69 aa  84  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>