More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2142 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  100 
 
 		 199 aa  406  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  78.89 
 
 		 199 aa  339  1e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  69.85 
 
 		 199 aa  307  8e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  66.33 
 
 		 198 aa  285  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  65.83 
 
 		 198 aa  283  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  64.29 
 
 		 198 aa  280  8.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  65.82 
 
 		 198 aa  278  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  64.82 
 
 		 198 aa  278  5e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  64.82 
 
 		 198 aa  278  5e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  64.8 
 
 		 198 aa  278  6e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  65.31 
 
 		 198 aa  277  7e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  65.31 
 
 		 198 aa  277  7e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  65.31 
 
 		 198 aa  277  7e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  65.31 
 
 		 198 aa  277  7e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  65.31 
 
 		 198 aa  277  7e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  65.31 
 
 		 198 aa  277  7e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  65.31 
 
 		 198 aa  277  7e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  65.31 
 
 		 198 aa  276  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  65.31 
 
 		 198 aa  276  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  63.32 
 
 		 199 aa  274  7e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  0.00000395528 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  62.31 
 
 		 200 aa  270  7e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  62.24 
 
 		 198 aa  268  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  61.73 
 
 		 198 aa  267  7e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  61.73 
 
 		 198 aa  267  7e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  62.31 
 
 		 199 aa  267  7e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0048  recombination protein RecR  61.81 
 
 		 198 aa  266  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1144  recombination protein RecR  62.5 
 
 		 201 aa  265  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0987935  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  60.91 
 
 		 199 aa  262  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  60.2 
 
 		 198 aa  260  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0386  recombination protein RecR  58.88 
 
 		 198 aa  257  8e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.147094  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  60.8 
 
 		 199 aa  256  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  56.78 
 
 		 199 aa  255  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0052  recombination protein RecR  59.2 
 
 		 198 aa  255  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011836  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  57.36 
 
 		 199 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0766  recombination protein RecR  58.38 
 
 		 198 aa  252  3e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.290455  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  55.33 
 
 		 199 aa  251  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  55.33 
 
 		 199 aa  251  7e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1973  recombination protein RecR  54.77 
 
 		 199 aa  249  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  57.44 
 
 		 199 aa  248  6e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  55.84 
 
 		 199 aa  247  7e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  56.92 
 
 		 199 aa  246  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  55.1 
 
 		 198 aa  246  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3924  recombination protein RecR  56.99 
 
 		 204 aa  243  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00096202  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0663  recombination protein RecR  56.85 
 
 		 198 aa  243  9.999999999999999e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0143934  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  53.33 
 
 		 199 aa  243  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  56.41 
 
 		 200 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  55.9 
 
 		 199 aa  241  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  53.85 
 
 		 199 aa  241  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  55.94 
 
 		 205 aa  240  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  54.08 
 
 		 202 aa  239  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  54.87 
 
 		 204 aa  239  2e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  53.85 
 
 		 199 aa  238  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0376  recombination protein RecR  53.77 
 
 		 199 aa  238  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000959909  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1175  recombination protein RecR  57.21 
 
 		 204 aa  238  4e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000261474  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  51.78 
 
 		 199 aa  238  5.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  50.47 
 
 		 215 aa  237  9e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  55.9 
 
 		 198 aa  237  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  54.31 
 
 		 199 aa  236  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  51.79 
 
 		 198 aa  236  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  54.31 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  56.32 
 
 		 200 aa  236  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  54.31 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0328  recombination protein RecR  55.5 
 
 		 200 aa  235  4e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  54.87 
 
 		 198 aa  234  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  54.82 
 
 		 197 aa  234  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1189  recombination protein RecR  54.73 
 
 		 204 aa  234  6e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00843682  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  54.82 
 
 		 197 aa  234  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  54.87 
 
 		 198 aa  234  7e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  51.52 
 
 		 198 aa  234  8e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1513  recombination protein RecR  55.1 
 
 		 222 aa  234  9e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0279848  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0370  recombination protein RecR  53.81 
 
 		 199 aa  234  9e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133419 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1284  recombination protein RecR  52.94 
 
 		 204 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.722454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0883  recombination protein RecR  56.22 
 
 		 204 aa  233  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254341  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  50.76 
 
 		 199 aa  232  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  53.85 
 
 		 199 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0876  recombination protein RecR  55.12 
 
 		 205 aa  232  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236208  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  52.28 
 
 		 199 aa  232  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  53.85 
 
 		 199 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0583  recombination protein RecR  51.79 
 
 		 204 aa  232  3e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0479  recombination protein RecR  52.28 
 
 		 199 aa  232  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0004265  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  52.02 
 
 		 198 aa  231  5e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0127  recombination protein RecR  51.52 
 
 		 202 aa  231  6e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  50.77 
 
 		 199 aa  231  6e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3760  recombination protein RecR  57.95 
 
 		 198 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0277  recombination protein RecR  54.27 
 
 		 213 aa  230  1e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_522  recombination protein  51.28 
 
 		 204 aa  230  1e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0417916  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0215  recombination protein RecR  50.76 
 
 		 197 aa  229  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  52 
 
 		 202 aa  228  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0557  recombination protein RecR  50.77 
 
 		 204 aa  228  5e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  53.65 
 
 		 203 aa  228  6e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  51.79 
 
 		 199 aa  228  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0254  recombination protein RecR  49.24 
 
 		 197 aa  226  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136191  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0210  recombination protein RecR  50.75 
 
 		 197 aa  226  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00238733  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3420  recombination protein RecR  53.12 
 
 		 197 aa  225  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000418809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5271  recombination protein RecR  50.99 
 
 		 203 aa  225  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1369  recombination protein RecR  53.27 
 
 		 211 aa  225  4e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4903  recombination protein RecR  50.99 
 
 		 203 aa  225  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4992  recombination protein RecR  50.99 
 
 		 203 aa  225  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2291  recombination protein RecR  51.26 
 
 		 205 aa  224  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.967474  normal  0.0406195 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13747  recombination protein RecR  50.5 
 
 		 203 aa  224  7e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.24685  normal  0.507184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>