209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2138 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
580 aa  1194  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  61.36 
 
 
648 aa  432  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  60.95 
 
 
505 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.84 
 
 
316 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  54.98 
 
 
316 aa  364  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  54.98 
 
 
316 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  54.66 
 
 
316 aa  363  5e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  54.66 
 
 
316 aa  362  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  54.66 
 
 
316 aa  362  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  55.23 
 
 
315 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.66 
 
 
315 aa  360  4e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.75 
 
 
378 aa  360  5e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.38 
 
 
316 aa  358  2e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.43 
 
 
378 aa  358  2e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  51.25 
 
 
377 aa  354  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.83532e-06 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  50 
 
 
392 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  53.42 
 
 
362 aa  353  4e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  2.45228e-11  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.77 
 
 
315 aa  352  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  53.31 
 
 
344 aa  348  2e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  6.31807e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  53.29 
 
 
340 aa  344  3e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.62 
 
 
314 aa  340  3e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.31 
 
 
369 aa  338  2e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.6 
 
 
426 aa  333  4e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  48.77 
 
 
333 aa  333  7e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.71617e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.08 
 
 
333 aa  332  8e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.08 
 
 
333 aa  332  8e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  51.27 
 
 
341 aa  332  1e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  72.46 
 
 
707 aa  246  7e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.57 
 
 
350 aa  230  7e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.43 
 
 
340 aa  227  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  39.56 
 
 
982 aa  223  7e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.01 
 
 
376 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.4 
 
 
347 aa  206  9e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.46 
 
 
466 aa  202  1e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.79 
 
 
355 aa  189  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997912 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  39.94 
 
 
329 aa  186  7e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  33.5 
 
 
607 aa  184  5e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.76 
 
 
353 aa  176  1e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.64 
 
 
628 aa  174  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.71 
 
 
507 aa  174  6e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  34.01 
 
 
355 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  33.33 
 
 
2073 aa  170  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  34.25 
 
 
627 aa  166  2e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  4.34172e-05  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  34.06 
 
 
502 aa  156  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  31.55 
 
 
634 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  7.18487e-06  hitchhiker  3.98389e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  31.55 
 
 
634 aa  156  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  3.21687e-08 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  31.55 
 
 
634 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  33.23 
 
 
349 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.69 
 
 
517 aa  144  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1273  alpha-L-arabinofuranosidase B  47.86 
 
 
481 aa  125  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1971  alpha-L-arabinofuranosidase B  51.13 
 
 
478 aa  124  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  5.5654e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0062  alpha-L-arabinofuranosidase B  44.2 
 
 
854 aa  110  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.649597  normal  0.531326 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  30.1 
 
 
315 aa  90.9  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  47.13 
 
 
554 aa  89.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  64 
 
 
415 aa  87.4  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  47.42 
 
 
710 aa  83.6  9e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5160  Xylan 1,4-beta-xylosidase  47.13 
 
 
519 aa  82.4  2e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0027116 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  45.54 
 
 
736 aa  81.3  5e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  58.57 
 
 
730 aa  78.2  4e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01571  Alpha-L-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74288]  45.05 
 
 
510 aa  77.8  6e-13  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.611829 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  60.56 
 
 
484 aa  77.4  6e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  48.86 
 
 
922 aa  77.4  7e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  45.19 
 
 
563 aa  77.4  7e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.15938e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  31.28 
 
 
842 aa  77  9e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  45 
 
 
477 aa  77  9e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1544  putative beta-xylosidase  26.95 
 
 
710 aa  76.3  1e-12  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.099307  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  25.47 
 
 
1278 aa  75.9  2e-12  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  38.93 
 
 
831 aa  75.5  3e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  58.46 
 
 
630 aa  74.7  4e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  52.38 
 
 
591 aa  74.3  6e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  46.46 
 
 
741 aa  73.6  9e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.24 
 
 
537 aa  73.6  9e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  51.32 
 
 
619 aa  72.4  2e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  51.9 
 
 
900 aa  72.4  2e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  55.38 
 
 
961 aa  72.4  2e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  40.82 
 
 
707 aa  72.4  2e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  2.61631e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  44.64 
 
 
582 aa  72  2e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  48.15 
 
 
600 aa  72.4  2e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  49.41 
 
 
611 aa  71.6  4e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  24.91 
 
 
304 aa  70.9  7e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  49.37 
 
 
895 aa  70.5  7e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  24.92 
 
 
334 aa  70.5  8e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  55.88 
 
 
742 aa  70.1  9e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  56.16 
 
 
566 aa  70.1  1e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.99 
 
 
1051 aa  69.3  2e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  50.7 
 
 
649 aa  69.3  2e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  25.2 
 
 
393 aa  68.9  2e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  48.19 
 
 
526 aa  68.9  3e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  50.72 
 
 
1224 aa  68.2  4e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  47.14 
 
 
814 aa  67.8  5e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  60 
 
 
679 aa  67.8  5e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  46.25 
 
 
928 aa  67.8  6e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  53.03 
 
 
571 aa  67.4  7e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  37.7 
 
 
773 aa  67  8e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  43.53 
 
 
334 aa  67  1e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  39.39 
 
 
1601 aa  66.6  1e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
683 aa  65.9  2e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  41.35 
 
 
1077 aa  65.5  2e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  47.89 
 
 
789 aa  65.5  3e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.75 
 
 
790 aa  65.1  3e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>