41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2132 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2132  abortive infection protein, putative  100 
 
 
432 aa  876  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.903649  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0079  abortive infection protein, putative  30.56 
 
 
433 aa  173  6e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2148  hypothetical protein  32 
 
 
431 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61865 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1557  hypothetical protein  29.66 
 
 
422 aa  153  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2208  hypothetical protein  29.41 
 
 
422 aa  148  2e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11638  abortive infection protein, putative  28.76 
 
 
438 aa  145  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0741  putative phage resistance protein  28.41 
 
 
417 aa  140  5e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333006  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0903  hypothetical protein  30.58 
 
 
429 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2064  hypothetical protein  27.72 
 
 
421 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.906065  normal  0.239178 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4361  hypothetical protein  25.89 
 
 
465 aa  132  2e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0995  RloA protein  29.05 
 
 
425 aa  132  2e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12600  hypothetical protein  28.31 
 
 
435 aa  129  1e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0298  putative phage resistance protein  27.59 
 
 
422 aa  129  1e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7388  hypothetical protein  25.11 
 
 
440 aa  126  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0050  hypothetical protein  25.05 
 
 
451 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1041  ATPase-like  27.42 
 
 
447 aa  116  7e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  25.6 
 
 
428 aa  110  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2870  hypothetical protein  23.16 
 
 
435 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.716536  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  27.58 
 
 
459 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3541  ATPase-like protein  24.95 
 
 
426 aa  107  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1948  abortive phage resistance protein-like protein  25.65 
 
 
454 aa  100  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1294  hypothetical protein  23.55 
 
 
456 aa  96.3  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1899  abortive infection protein, internal deletion  23.98 
 
 
394 aa  91.7  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136383  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4229  abortive infection protein  24.2 
 
 
405 aa  90.1  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2991  abortive infection protein  24.02 
 
 
380 aa  85.5  2e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164345  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0493  abortive infection protein  26.65 
 
 
407 aa  83.2  8e-15  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1074  abortive phage resistance protein-like protein  24.74 
 
 
456 aa  81.3  4e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960814  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0054  abortive infection protein  26.64 
 
 
407 aa  79  2e-13  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3791  abortive phage resistance protein-like  23.59 
 
 
448 aa  75.5  2e-12  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.618475  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1616  abortive infection protein, internal deletion  25.17 
 
 
400 aa  74.3  4e-12  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3852  abortive infection protein  23.24 
 
 
394 aa  70.1  8e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  4.25466e-08 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1573  SMC domain-containing protein  25 
 
 
373 aa  58.5  2e-07  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0501523  normal  0.47865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3995  abortive infection protein, internal deletion  32.26 
 
 
388 aa  57  6e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1920  abortive phage resistance protein-like  28.46 
 
 
448 aa  56.6  8e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  3.40563e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0733  hypothetical protein  25.37 
 
 
437 aa  56.2  1e-06  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00594005  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  31.53 
 
 
448 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  31.53 
 
 
448 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2523  abortive infection protein  24.85 
 
 
478 aa  47.8  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.237288  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2275  hypothetical protein  24.59 
 
 
315 aa  47  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.972527  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  21.59 
 
 
419 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  23.85 
 
 
450 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>