157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2109 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  100 
 
 		 845 aa  1709    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1761  hypothetical protein  49.92 
 
 		 680 aa  623  1e-177  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1144  hypothetical protein  47.99 
 
 		 662 aa  592  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3465  secreted protein  46.28 
 
 		 690 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0009  secreted protein  39.97 
 
 		 636 aa  390  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00303672  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0353  hypothetical protein  37.37 
 
 		 635 aa  350  6e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116012  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3362  C-terminal beta- propeller domain-contain secreted protein-like protein  35.38 
 
 		 697 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0179249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1971  hypothetical protein  34.27 
 
 		 644 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0471  copper amine oxidase-like protein  33.99 
 
 		 741 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0141512 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2127  hypothetical protein  29.81 
 
 		 652 aa  249  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3067  putative lipoprotein  26.87 
 
 		 698 aa  241  5e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257296  normal  0.354742 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  32.14 
 
 		 741 aa  224  4e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  30.77 
 
 		 745 aa  220  7e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  30.03 
 
 		 746 aa  210  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  29.33 
 
 		 745 aa  206  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6043  Secreted protein  29.27 
 
 		 635 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.557993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1174  Secreted protein containing C-terminal beta- propeller domain distantly related to WD-40 repeats-like protein  27.06 
 
 		 711 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4531  hypothetical protein  23.98 
 
 		 632 aa  184  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.420063 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1856  hypothetical protein  24.01 
 
 		 690 aa  181  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2091  hypothetical protein  23.76 
 
 		 693 aa  177  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5041  hypothetical protein  24.36 
 
 		 625 aa  174  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2006  hypothetical protein  23.89 
 
 		 691 aa  174  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.747955  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1394  hypothetical protein  24.86 
 
 		 677 aa  154  5e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.46646  normal  0.639448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2884  Beta propeller domain protein  24.11 
 
 		 685 aa  151  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0547  beta-propeller domain-containing protein  28.04 
 
 		 703 aa  148  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000139284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2462  hypothetical protein  37.04 
 
 		 652 aa  135  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2939  ATPase  23.15 
 
 		 787 aa  130  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1498  hypothetical protein  23.71 
 
 		 682 aa  121  7e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1330  hypothetical protein  29.31 
 
 		 608 aa  97.8  6e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.696713 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0818  copper amine oxidase domain-containing protein  42.06 
 
 		 289 aa  94  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  44.21 
 
 		 282 aa  91.3  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1857  copper amine oxidase-like  38.18 
 
 		 214 aa  86.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.021066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43674  predicted protein  28.4 
 
 		 854 aa  85.5  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.300412  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2121  copper amine oxidase domain-containing protein  35.54 
 
 		 704 aa  85.1  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000127816  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  44.57 
 
 		 263 aa  84  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  40.59 
 
 		 414 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  37.93 
 
 		 741 aa  82.8  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  44.32 
 
 		 495 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0939  copper amine oxidase domain-containing protein  31.22 
 
 		 329 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  42.86 
 
 		 451 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  40.19 
 
 		 481 aa  80.1  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0139  hypothetical protein  36.59 
 
 		 758 aa  79.3  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4154  copper amine oxidase domain protein  38.1 
 
 		 781 aa  78.2  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000308518  hitchhiker  0.000000100908 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3142  copper amine oxidase domain-containing protein  40.34 
 
 		 746 aa  77.8  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  40.74 
 
 		 478 aa  77.8  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  42.22 
 
 		 591 aa  77.4  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  42.27 
 
 		 175 aa  77  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  41.3 
 
 		 323 aa  76.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  40.21 
 
 		 514 aa  76.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  45.26 
 
 		 276 aa  75.5  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.62 
 
 		 657 aa  75.1  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  39.42 
 
 		 483 aa  74.3  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  32.98 
 
 		 474 aa  73.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  41.67 
 
 		 450 aa  73.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  34.21 
 
 		 549 aa  72.4  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0744  copper amine oxidase-like protein  35.58 
 
 		 950 aa  71.6  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0284695  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0593  copper amine oxidase-like protein  38.46 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0140  hypothetical protein  32.9 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  35.65 
 
 		 480 aa  71.2  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0045  copper amine oxidase-like protein  36.26 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0523  copper amine oxidase-like  41.94 
 
 		 298 aa  70.5  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000809861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0524  copper amine oxidase domain protein  43.01 
 
 		 304 aa  70.5  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  30.63 
 
 		 1305 aa  70.1  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1575  copper amine oxidase-like  34.38 
 
 		 176 aa  69.7  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000369494  normal  0.0457717 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0786  copper amine oxidase domain protein  37.89 
 
 		 383 aa  69.7  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2788  copper amine oxidase domain-containing protein  36.11 
 
 		 270 aa  70.1  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83437  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2119  copper amine oxidase domain-containing protein  31.71 
 
 		 429 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00100028  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  35.71 
 
 		 521 aa  69.7  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  42.39 
 
 		 113 aa  68.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1055  copper amine oxidase domain-containing protein  35.64 
 
 		 541 aa  68.9  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000877953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  40.7 
 
 		 502 aa  68.6  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1643  copper amine oxidase domain protein  30.65 
 
 		 763 aa  67  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00153148  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  37.23 
 
 		 625 aa  67.4  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  40.22 
 
 		 732 aa  67  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1833  copper amine oxidase-like protein  33.71 
 
 		 269 aa  66.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  34.75 
 
 		 452 aa  66.6  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2286  hypothetical protein  35.94 
 
 		 182 aa  65.9  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1374  copper amine oxidase-like protein  33.71 
 
 		 262 aa  65.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000174509  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1566  copper amine oxidase domain-containing protein  33.65 
 
 		 251 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  38.71 
 
 		 529 aa  65.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  36.21 
 
 		 451 aa  65.5  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  33.64 
 
 		 259 aa  65.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  35.79 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1215  copper amine oxidase domain-containing protein  35.65 
 
 		 784 aa  65.5  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000445409  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  32.54 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1842  copper amine oxidase domain protein  35.11 
 
 		 553 aa  64.7  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  35.56 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2410  copper amine oxidase domain protein  30.71 
 
 		 792 aa  64.7  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.92 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40 
 
 		 907 aa  64.7  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  39.56 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  35.56 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2494  copper amine oxidase domain protein  29.25 
 
 		 784 aa  64.3  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0315716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  30.85 
 
 		 447 aa  63.9  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0757  copper amine oxidase domain protein  36.73 
 
 		 343 aa  63.9  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0901  copper amine oxidase domain protein  36.27 
 
 		 340 aa  63.5  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.948767  normal  0.18587 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2496  copper amine oxidase domain protein  29.92 
 
 		 320 aa  63.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0179938 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0627  copper amine oxidase domain-containing protein  30.58 
 
 		 153 aa  63.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936982  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2496  copper amine oxidase domain protein  32.79 
 
 		 1176 aa  63.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000018364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  26.79 
 
 		 298 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>