More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2102 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  100 
 
 
251 aa  512  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  63.37 
 
 
260 aa  321  7e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  55.74 
 
 
249 aa  277  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  54.51 
 
 
249 aa  275  5e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  55.42 
 
 
256 aa  274  8e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  52.28 
 
 
248 aa  255  5e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  50.41 
 
 
249 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  48.79 
 
 
246 aa  228  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  48.79 
 
 
246 aa  228  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  48.39 
 
 
246 aa  227  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  48.39 
 
 
246 aa  227  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  48.39 
 
 
246 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  48.39 
 
 
246 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  48.39 
 
 
246 aa  226  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  48.39 
 
 
246 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  48.39 
 
 
246 aa  226  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  47.98 
 
 
246 aa  223  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  48.39 
 
 
246 aa  223  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  50 
 
 
249 aa  222  6e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  42.11 
 
 
249 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  41.49 
 
 
254 aa  193  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  40.17 
 
 
241 aa  192  4e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  38.49 
 
 
241 aa  188  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  38.49 
 
 
241 aa  188  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  38.49 
 
 
243 aa  187  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  36.4 
 
 
251 aa  186  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  39.42 
 
 
254 aa  184  9e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  37.56 
 
 
241 aa  176  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  41.35 
 
 
246 aa  175  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  38.64 
 
 
240 aa  174  8e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  38.62 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  35.83 
 
 
255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  35.9 
 
 
256 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  38.39 
 
 
240 aa  153  2e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  36.18 
 
 
251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  35.74 
 
 
258 aa  152  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  32.49 
 
 
258 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  34.76 
 
 
245 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  39.53 
 
 
220 aa  149  5e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  37.21 
 
 
228 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  34.84 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  36.33 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  35.74 
 
 
266 aa  143  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  30.62 
 
 
211 aa  141  9e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  31.2 
 
 
268 aa  128  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  31.02 
 
 
330 aa  127  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  31.2 
 
 
233 aa  122  8e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  31.06 
 
 
262 aa  117  9.999999999999999e-26  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  32.98 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  29.09 
 
 
249 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  25.79 
 
 
260 aa  102  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  32.26 
 
 
222 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  29.31 
 
 
235 aa  101  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  27.93 
 
 
250 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  27.85 
 
 
262 aa  98.6  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  27.06 
 
 
268 aa  96.7  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  26.89 
 
 
237 aa  96.3  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  27.54 
 
 
237 aa  95.1  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1649  methyltransferase small  33.69 
 
 
223 aa  94.7  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  25.53 
 
 
250 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  29 
 
 
233 aa  91.7  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  25.68 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  28.57 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  28.19 
 
 
233 aa  89.7  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  25.89 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  28.81 
 
 
255 aa  89  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  28.02 
 
 
235 aa  89  7e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  26.98 
 
 
233 aa  88.6  8e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  27.6 
 
 
252 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  25.89 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  27.47 
 
 
259 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  25.45 
 
 
253 aa  85.1  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  28.72 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  25.33 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  27.27 
 
 
271 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  26.2 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  25 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0237  methyltransferase type 11  29.24 
 
 
216 aa  81.6  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  33.14 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3377  methyltransferase small  28.92 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  28.63 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  27.16 
 
 
288 aa  78.6  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  24.64 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0330  O-methyltransferase-like protein  29.26 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0239  methyltransferase type 11  28.82 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0661  methyltransferase small  26.09 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  24.57 
 
 
231 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  25.15 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  25.77 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  25.13 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  25.77 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  29.49 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  26.32 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3451  methyltransferase type 12  25.77 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  25.77 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  21.79 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0803  methyltransferase small  24.14 
 
 
264 aa  72  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  27.04 
 
 
235 aa  72  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  24.85 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0650188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>