More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2092 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
284 aa  571  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  62.46 
 
 
290 aa  359  4e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  52.13 
 
 
291 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  50 
 
 
305 aa  275  8e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  52.31 
 
 
293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  54.12 
 
 
292 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  50.92 
 
 
285 aa  270  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  50.92 
 
 
285 aa  270  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  51.97 
 
 
292 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  50.18 
 
 
290 aa  269  5e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  48.92 
 
 
301 aa  268  8.999999999999999e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  51.61 
 
 
292 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  51.61 
 
 
292 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  51.61 
 
 
292 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  51.61 
 
 
292 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  51.97 
 
 
292 aa  267  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  51.61 
 
 
292 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  51.61 
 
 
292 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  49.3 
 
 
293 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  51.97 
 
 
292 aa  267  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  51.61 
 
 
292 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  49.29 
 
 
288 aa  256  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  48.18 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  46.79 
 
 
290 aa  240  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  44.41 
 
 
297 aa  237  1e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  44.4 
 
 
299 aa  236  3e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  48.91 
 
 
297 aa  236  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  48.91 
 
 
297 aa  236  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  46.04 
 
 
290 aa  235  5.0000000000000005e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  43.06 
 
 
294 aa  231  1e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  46.72 
 
 
280 aa  229  5e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  47.13 
 
 
273 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000661842  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  45.32 
 
 
278 aa  223  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  43.84 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  41.3 
 
 
284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  46.64 
 
 
291 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  42.6 
 
 
295 aa  214  9.999999999999999e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  42.91 
 
 
276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  41.95 
 
 
275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  42.75 
 
 
292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  40.59 
 
 
279 aa  212  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  42.42 
 
 
275 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_347  dimethyladenosine transferase  41.33 
 
 
291 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0404  dimethyladenosine transferase  40.22 
 
 
291 aa  206  3e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0383  dimethyladenosine transferase  40.96 
 
 
291 aa  202  7e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  36.33 
 
 
302 aa  201  9e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2292  dimethyladenosine transferase  37.96 
 
 
290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.777325  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  40.73 
 
 
294 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1492  dimethyladenosine transferase  40.88 
 
 
279 aa  196  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  42.53 
 
 
271 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0633  dimethyladenosine transferase  36.4 
 
 
277 aa  194  2e-48  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  38.32 
 
 
276 aa  193  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1171  dimethyladenosine transferase  39.55 
 
 
276 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00874938  normal  0.712777 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  40.46 
 
 
271 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0456  dimethyladenosine transferase  39.85 
 
 
261 aa  191  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.45275  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  41.46 
 
 
298 aa  190  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07480  dimethyladenosine transferase  35.82 
 
 
296 aa  183  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.962879 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1867  dimethyladenosine transferase  38.71 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  37.31 
 
 
275 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  37.45 
 
 
275 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  39.78 
 
 
260 aa  181  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2047  dimethyladenosine transferase  40.23 
 
 
276 aa  181  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  36.84 
 
 
297 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  36.84 
 
 
297 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5229  dimethyladenosine transferase  37.77 
 
 
293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0245049  hitchhiker  0.00538295 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3348  dimethyladenosine transferase  38.52 
 
 
285 aa  178  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.908407  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1357  dimethyladenosine transferase  39.07 
 
 
260 aa  178  8e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735455  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0985  dimethyladenosine transferase  36.3 
 
 
316 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1636  dimethyladenosine transferase  35.42 
 
 
289 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199976  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1672  dimethyladenosine transferase  40.3 
 
 
263 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0228  dimethyladenosine transferase  40.3 
 
 
263 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  37.59 
 
 
275 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6886  dimethyladenosine transferase  38.79 
 
 
295 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  38.95 
 
 
272 aa  176  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  37.41 
 
 
268 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0313  dimethyladenosine transferase  39.55 
 
 
267 aa  176  5e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  39.46 
 
 
268 aa  176  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 
265 aa  175  7e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  36.82 
 
 
267 aa  175  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  37.36 
 
 
266 aa  175  9e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  37.04 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4556  dimethyladenosine transferase  35.66 
 
 
302 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  36.84 
 
 
274 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0285  dimethyladenosine transferase  37.1 
 
 
302 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11029  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 
317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  37.55 
 
 
272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1513  dimethyladenosine transferase  36 
 
 
305 aa  172  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  36.67 
 
 
272 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0760  dimethyladenosine transferase  39.43 
 
 
274 aa  172  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676822  normal  0.117293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0645  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 
298 aa  172  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0806  dimethyladenosine transferase  40.3 
 
 
263 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68016  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  36.63 
 
 
267 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  37.31 
 
 
267 aa  171  9e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  37.98 
 
 
267 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  36.63 
 
 
267 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3234  dimethyladenosine transferase  39.48 
 
 
287 aa  170  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690544  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2833  dimethyladenosine transferase  38.18 
 
 
288 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137486  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  35.32 
 
 
269 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0726  dimethyladenosine transferase  37.41 
 
 
289 aa  170  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.810967  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  36.94 
 
 
266 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>