More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2086 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  100 
 
 		 839 aa  1716    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  46.47 
 
 		 835 aa  753    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  40.02 
 
 		 847 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  40.31 
 
 		 835 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  39.53 
 
 		 848 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  38.99 
 
 		 838 aa  569  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  39.58 
 
 		 836 aa  542  1e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  37.17 
 
 		 886 aa  538  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  36.01 
 
 		 862 aa  526  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  37.32 
 
 		 783 aa  511  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  36.64 
 
 		 783 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  37.37 
 
 		 810 aa  497  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  37.87 
 
 		 783 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  35.45 
 
 		 837 aa  444  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  33.53 
 
 		 817 aa  430  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  45.47 
 
 		 872 aa  420  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  32.43 
 
 		 835 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  33.18 
 
 		 852 aa  415  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  32.3 
 
 		 823 aa  409  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  33.41 
 
 		 839 aa  388  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  34.11 
 
 		 835 aa  388  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  32.04 
 
 		 828 aa  388  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  35.92 
 
 		 767 aa  386  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  30.33 
 
 		 826 aa  380  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  34.04 
 
 		 783 aa  380  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  31.82 
 
 		 840 aa  376  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  31.76 
 
 		 878 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  31.83 
 
 		 826 aa  370  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  32.36 
 
 		 832 aa  366  1e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  32.65 
 
 		 825 aa  365  2e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  30.84 
 
 		 877 aa  362  2e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  31.47 
 
 		 841 aa  357  3.9999999999999996e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1278  peptidase U32  29.87 
 
 		 847 aa  348  3e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.615717 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  33.49 
 
 		 805 aa  345  2e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  39.74 
 
 		 873 aa  339  9.999999999999999e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  29.59 
 
 		 851 aa  339  9.999999999999999e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  33.86 
 
 		 723 aa  337  5.999999999999999e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  31.13 
 
 		 833 aa  333  9e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  30.02 
 
 		 843 aa  323  7e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  31.23 
 
 		 818 aa  319  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  34.14 
 
 		 834 aa  318  2e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  32.97 
 
 		 822 aa  311  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  31.79 
 
 		 790 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0995  peptidase U32  29.74 
 
 		 876 aa  296  8e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  30.2 
 
 		 716 aa  296  9e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  31.4 
 
 		 790 aa  291  5.0000000000000004e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  36.01 
 
 		 790 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  31.51 
 
 		 792 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  30.68 
 
 		 792 aa  273  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  42.34 
 
 		 790 aa  269  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  30.63 
 
 		 736 aa  269  2e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  28.66 
 
 		 722 aa  269  2e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  38.78 
 
 		 407 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  39.61 
 
 		 411 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1744  peptidase U32  32.5 
 
 		 622 aa  254  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  36.98 
 
 		 696 aa  252  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  48.3 
 
 		 746 aa  249  2e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  38.95 
 
 		 411 aa  248  4.9999999999999997e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0753  protease  32.66 
 
 		 635 aa  246  9.999999999999999e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0800  peptidase U32  32.48 
 
 		 638 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3797  U32 family peptidase  32.43 
 
 		 638 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0828  peptidase U32  32.26 
 
 		 638 aa  244  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00452719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0847  peptidase U32  33.83 
 
 		 638 aa  243  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1033  collagenase  30.58 
 
 		 667 aa  242  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.771528  normal  0.0721423 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3138  peptidase U32  31.86 
 
 		 638 aa  242  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0882  peptidase U32  32.27 
 
 		 652 aa  241  4e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  37.31 
 
 		 403 aa  240  6.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1338  U32 family protease  33.03 
 
 		 621 aa  240  9e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.134167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0949  peptidase U32  33.33 
 
 		 641 aa  239  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0818  peptidase U32  33.08 
 
 		 637 aa  239  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  36.04 
 
 		 406 aa  238  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0835  peptidase U32  32.72 
 
 		 638 aa  237  6e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  35.81 
 
 		 419 aa  236  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0396  peptidase U32  31.65 
 
 		 640 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0764  peptidase U32  31.81 
 
 		 649 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2182  peptidase U32  40.35 
 
 		 805 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0246456  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  31.48 
 
 		 653 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1793  peptidase U32  31.17 
 
 		 655 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  33.68 
 
 		 427 aa  236  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  36.9 
 
 		 430 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  31.58 
 
 		 654 aa  235  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  31.58 
 
 		 654 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  31.58 
 
 		 654 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  31.64 
 
 		 654 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3582  peptidase U32  32.08 
 
 		 638 aa  234  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  31.39 
 
 		 654 aa  234  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  31.11 
 
 		 667 aa  234  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  31.11 
 
 		 667 aa  234  6e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  31.11 
 
 		 667 aa  234  6e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0957  collagenase-like protease  40.72 
 
 		 643 aa  234  7.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0908875  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1796  peptidase U32  31.61 
 
 		 629 aa  233  8.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.191326 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  31.11 
 
 		 653 aa  233  9e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  31.11 
 
 		 653 aa  233  9e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0734  peptidase U32  32.37 
 
 		 638 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  31.11 
 
 		 653 aa  233  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  31.11 
 
 		 667 aa  233  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  36.25 
 
 		 404 aa  233  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3514  peptidase U32  31.91 
 
 		 638 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.163924 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1983  peptidase U32  31.59 
 
 		 654 aa  232  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  41.5 
 
 		 404 aa  232  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>