More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1961 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  42.75 
 
 		 842 aa  707    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  46.78 
 
 		 828 aa  807    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  42.11 
 
 		 842 aa  694    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  48.49 
 
 		 830 aa  826    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  40.58 
 
 		 821 aa  652    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  60.93 
 
 		 810 aa  1045    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  42.36 
 
 		 840 aa  702    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  41.65 
 
 		 841 aa  702    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  42.52 
 
 		 843 aa  686    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  43.07 
 
 		 842 aa  696    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  47.14 
 
 		 818 aa  804    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  47.27 
 
 		 818 aa  818    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  41.33 
 
 		 820 aa  639    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  40.39 
 
 		 827 aa  637    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  51.52 
 
 		 820 aa  892    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 816 aa  1661    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  39.52 
 
 		 832 aa  634  1e-180  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  39.76 
 
 		 832 aa  630  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  38.61 
 
 		 830 aa  629  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  38.19 
 
 		 835 aa  612  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  36.48 
 
 		 833 aa  598  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  35.92 
 
 		 832 aa  591  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  35.32 
 
 		 834 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  36.25 
 
 		 836 aa  571  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  35.92 
 
 		 837 aa  570  1e-161  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  34.06 
 
 		 827 aa  570  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  33.86 
 
 		 841 aa  570  1e-161  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  36.79 
 
 		 835 aa  571  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  34.07 
 
 		 828 aa  568  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  38.75 
 
 		 776 aa  568  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  34.18 
 
 		 828 aa  564  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  36.13 
 
 		 835 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  36.31 
 
 		 836 aa  561  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  36 
 
 		 835 aa  558  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  35.73 
 
 		 836 aa  546  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  35.09 
 
 		 836 aa  548  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  33.91 
 
 		 843 aa  543  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  33.81 
 
 		 842 aa  531  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  35.43 
 
 		 833 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  36.2 
 
 		 712 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  35.47 
 
 		 854 aa  483  1e-135  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  31.65 
 
 		 784 aa  473  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  31.38 
 
 		 784 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  31.49 
 
 		 784 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  31.69 
 
 		 784 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  31.53 
 
 		 784 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  31.38 
 
 		 784 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  31.9 
 
 		 784 aa  464  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  31.9 
 
 		 784 aa  465  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  31.57 
 
 		 784 aa  465  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  31.98 
 
 		 784 aa  464  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  34.06 
 
 		 828 aa  460  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  30.25 
 
 		 785 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  39.67 
 
 		 370 aa  300  7e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  39.4 
 
 		 370 aa  299  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  37.5 
 
 		 370 aa  282  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  40.31 
 
 		 347 aa  272  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  39.06 
 
 		 361 aa  264  4.999999999999999e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  38.23 
 
 		 361 aa  260  6e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  38.5 
 
 		 361 aa  260  7e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  35.96 
 
 		 392 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  38.64 
 
 		 347 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  40.43 
 
 		 346 aa  256  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  39.2 
 
 		 348 aa  252  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  40.87 
 
 		 349 aa  251  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  35.7 
 
 		 399 aa  248  4.9999999999999997e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  38.27 
 
 		 329 aa  246  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  38.27 
 
 		 343 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  39.94 
 
 		 389 aa  244  5e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  34.86 
 
 		 367 aa  242  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  35.42 
 
 		 392 aa  240  9e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  39.6 
 
 		 392 aa  237  7e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  39.02 
 
 		 392 aa  237  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  39.94 
 
 		 388 aa  236  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  38.51 
 
 		 381 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  38.73 
 
 		 392 aa  233  1e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  39.08 
 
 		 392 aa  233  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.94 
 
 		 392 aa  232  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  38.62 
 
 		 392 aa  232  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  33.94 
 
 		 366 aa  230  7e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01691  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.65 
 
 		 392 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.28 
 
 		 392 aa  229  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.28 
 
 		 392 aa  229  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26731  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.57 
 
 		 392 aa  228  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0925  Nucleotidyl transferase  37.75 
 
 		 388 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0952  Nucleotidyl transferase  37.75 
 
 		 388 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  33.6 
 
 		 392 aa  226  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3422  nucleotidyl transferase  36.68 
 
 		 389 aa  225  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  33.25 
 
 		 387 aa  225  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  37.75 
 
 		 388 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0300  nucleotidyl transferase  35.16 
 
 		 397 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  33.78 
 
 		 387 aa  217  7e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0327  putative nucleotidyl transferase  35.6 
 
 		 381 aa  217  7e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1847  nucleotidyl transferase  36.96 
 
 		 389 aa  216  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0712  nucleotidyl transferase  38.39 
 
 		 376 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0827  nucleotidyl transferase  31.65 
 
 		 388 aa  209  2e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  33.07 
 
 		 387 aa  207  5e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  30.6 
 
 		 365 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  31.39 
 
 		 357 aa  200  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  29.22 
 
 		 364 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>