More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1956 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  100 
 
 
310 aa  624  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  39.68 
 
 
315 aa  229  4e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  37.58 
 
 
307 aa  218  7e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  39.04 
 
 
308 aa  218  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  37.91 
 
 
307 aa  216  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  43.4 
 
 
311 aa  216  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  39.56 
 
 
310 aa  203  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  36.22 
 
 
311 aa  196  3e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
318 aa  196  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  38.54 
 
 
310 aa  194  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  38.55 
 
 
308 aa  188  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  34.5 
 
 
310 aa  185  7e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  36.57 
 
 
310 aa  185  8e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D04  tagatose-6-phosphate kinase  38.54 
 
 
286 aa  185  9e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0175284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  37.06 
 
 
311 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  34.52 
 
 
310 aa  183  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  36.99 
 
 
316 aa  180  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  33.87 
 
 
310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  34.39 
 
 
320 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  34.62 
 
 
310 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0661  1-phosphofructokinase  37.83 
 
 
314 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0132953  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  34.62 
 
 
310 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  33.66 
 
 
311 aa  177  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0824  1-phosphofructokinase  30.42 
 
 
310 aa  177  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0866  1-phosphofructokinase  30.77 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00871601  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  35.69 
 
 
303 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  35.09 
 
 
303 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  35.09 
 
 
303 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  35.09 
 
 
303 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  34.74 
 
 
303 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  34.74 
 
 
303 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  35.44 
 
 
303 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  35.09 
 
 
303 aa  170  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  35.09 
 
 
303 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  37.1 
 
 
306 aa  169  7e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  33.92 
 
 
305 aa  169  8e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  35.09 
 
 
303 aa  169  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  35.09 
 
 
303 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  35.69 
 
 
324 aa  168  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  35.16 
 
 
309 aa  167  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  35.82 
 
 
312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  35.23 
 
 
322 aa  166  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  32.43 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  34.96 
 
 
315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0078  1-phosphofructokinase  33.44 
 
 
308 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6208  1-phosphofructokinase  32.8 
 
 
312 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  31.97 
 
 
302 aa  161  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  35.21 
 
 
303 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  32.63 
 
 
308 aa  159  7e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  32.69 
 
 
302 aa  155  7e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  31.76 
 
 
313 aa  155  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0744  1-phosphofructokinase  32.67 
 
 
315 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0611075  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
306 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  30.43 
 
 
315 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  29.58 
 
 
306 aa  153  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  30.1 
 
 
315 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  32.69 
 
 
304 aa  152  8e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  29.87 
 
 
317 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  32.66 
 
 
306 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  32.04 
 
 
303 aa  150  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  30.23 
 
 
306 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  31.17 
 
 
323 aa  150  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  34.6 
 
 
314 aa  149  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  31.85 
 
 
311 aa  147  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  28.43 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  28.43 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  31.39 
 
 
304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  32.03 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  32.06 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2458  1-phosphofructokinase  31.76 
 
 
323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00298217  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  32.14 
 
 
318 aa  146  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  32.75 
 
 
311 aa  145  9e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  30.94 
 
 
312 aa  145  9e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  29.41 
 
 
312 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  29.41 
 
 
312 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  31.1 
 
 
315 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  30.33 
 
 
315 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.904747 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  30.94 
 
 
312 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  30.94 
 
 
312 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  30.94 
 
 
312 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  31.27 
 
 
327 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  30.94 
 
 
312 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  30.94 
 
 
312 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  30.94 
 
 
312 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  31.07 
 
 
324 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  30.94 
 
 
312 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  30.94 
 
 
312 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3229  1-phosphofructokinase  31.92 
 
 
313 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  30.94 
 
 
312 aa  144  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  31.72 
 
 
303 aa  143  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  32.16 
 
 
312 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  32.75 
 
 
312 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0099  ribokinase-like domain-containing protein  33.12 
 
 
319 aa  142  6e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  30.62 
 
 
312 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  30.62 
 
 
312 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  30.62 
 
 
312 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  30.62 
 
 
312 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  30.62 
 
 
312 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  29.74 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  29.82 
 
 
307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>