25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1913 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1913  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  536  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312193  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08350  hypothetical protein  54.68 
 
 		 265 aa  297  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0617  hypothetical protein  49.63 
 
 		 273 aa  268  5.9999999999999995e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3042  hypothetical protein  41.09 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000144784  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1426  hypothetical protein  40.96 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0181  hypothetical protein  36.98 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000193703 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0198  hypothetical protein  36.98 
 
 		 261 aa  199  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2901  hypothetical protein  34.71 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  30.28 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  28.47 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  35.78 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0066  rhomboid family protein  27.34 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167584  normal  0.0382417 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  33.94 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  35.45 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0064  rhomboid-like protein  27.34 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646008  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  31.48 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0082  Rhomboid family protein  25.78 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  29.58 
 
 		 264 aa  53.5  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  32.74 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  28.93 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  28.81 
 
 		 228 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  28.46 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0070  Rhomboid family protein  26.36 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.645934  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  25.21 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  25.86 
 
 		 291 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>