274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1859 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1859  cell division protein FtsX  100 
 
 
294 aa  594  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000215986  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2906  protein of unknown function DUF214  46.71 
 
 
304 aa  270  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1047  hypothetical protein  41.69 
 
 
295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0188433  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0406  protein of unknown function DUF214  31.83 
 
 
296 aa  169  7e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00446449  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3072  hypothetical protein  30.51 
 
 
295 aa  168  9e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000809977  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1800  protein of unknown function DUF214  31.53 
 
 
294 aa  166  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00238139  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0297  putative cell division protein  30.72 
 
 
302 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000570278  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3722  hypothetical protein  29.87 
 
 
297 aa  155  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0246  hypothetical protein  31.54 
 
 
294 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.261285  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5033  cell division ABC transporter permease FtsX  29.55 
 
 
297 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4863  cell division ABC transporter, permease  29.55 
 
 
297 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4878  cell division ABC transporter, permease  29.55 
 
 
297 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5415  cell division ABC transporter permease protein FtsX  29.55 
 
 
297 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5271  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  29.55 
 
 
297 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5289  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  29.22 
 
 
297 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4977  hypothetical protein  29.55 
 
 
297 aa  153  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5346  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  29.22 
 
 
297 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5301  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  29.22 
 
 
297 aa  152  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2195  protein of unknown function DUF214  31.76 
 
 
296 aa  151  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000249037  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0245  cell division protein FtsX  31.65 
 
 
295 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3965  protein of unknown function DUF214  34.12 
 
 
296 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000721724  hitchhiker  0.00000000316711 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3608  hypothetical protein  31.21 
 
 
303 aa  149  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4741  protein of unknown function DUF214  29.63 
 
 
294 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0472  protein of unknown function DUF214  29 
 
 
296 aa  140  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.840554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5655  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  28.67 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0292  cell division protein, putative  30.72 
 
 
302 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000194286  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3188  protein of unknown function DUF214  29.67 
 
 
297 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0285  hypothetical protein  31.15 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1605  cell division protein FtsX  30.93 
 
 
295 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.081685  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2411  hypothetical protein  27.65 
 
 
321 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0464721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1855  cell division protein FtsX  27.3 
 
 
316 aa  122  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.393875  normal  0.417325 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1774  cell division ABC transporter, permease protein FtsX, putative  28.45 
 
 
316 aa  122  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0919  hypothetical protein  27.65 
 
 
291 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1760  protein of unknown function DUF214  28.95 
 
 
294 aa  120  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4586  protein of unknown function DUF214  24.75 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.331228  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2477  cell division protein FtsX  24.34 
 
 
302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.680753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1675  cell division protein  26.67 
 
 
298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1278  cell division protein FtsX  30.43 
 
 
311 aa  119  6e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3003  protein of unknown function DUF214  29.33 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00163354  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1059  cell division protein FtsX  25.24 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2451  hypothetical protein  25.52 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000143098  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0983  hypothetical protein  27.95 
 
 
291 aa  116  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62484  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1867  hypothetical protein  25.4 
 
 
296 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581756  normal  0.135344 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1933  hypothetical protein  28.62 
 
 
314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912892  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3607  cell division protein FtsX  27.04 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00806007  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05510  cell division protein  25 
 
 
304 aa  109  6e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1288  protein of unknown function DUF214  26.78 
 
 
314 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1454  Cell division protein-like protein  25.16 
 
 
301 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.805507 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2995  protein of unknown function DUF214  26.78 
 
 
314 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000062578 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3722  protein of unknown function DUF214  25.31 
 
 
303 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.233251  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4005  protein of unknown function DUF214  25.9 
 
 
301 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09060  cell division protein  24.33 
 
 
305 aa  105  8e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0921919 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20320  cell division protein  27.51 
 
 
305 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2914  protein of unknown function DUF214  28.15 
 
 
341 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1922  protein of unknown function DUF214  28.38 
 
 
316 aa  102  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000281289  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0794  hypothetical protein  26.28 
 
 
299 aa  99.8  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.580506  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1100  cell division ABC transporter, permease  24.67 
 
 
309 aa  99.8  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0179229  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1408  cell division protein FtsX  24.9 
 
 
310 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00140955  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0634  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 
293 aa  98.6  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3021  protein of unknown function DUF214  22.26 
 
 
301 aa  95.9  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.418875  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2723  hypothetical protein  26.44 
 
 
299 aa  95.9  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0135  protein insertion permease FtsX, putative  28.94 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108648  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1235  protein of unknown function DUF214  23.81 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.43736  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1995  protein of unknown function DUF214  27.31 
 
 
301 aa  94  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  normal  0.0157399 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4584  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  25.09 
 
 
321 aa  93.2  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4162  hypothetical protein  25.09 
 
 
321 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000013492  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4447  hypothetical protein  24.9 
 
 
298 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3604  hypothetical protein  25.18 
 
 
321 aa  92.4  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001088  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3772  cell division protein FtsX  24.65 
 
 
321 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000178624  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1915  hypothetical protein  24.07 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4092  protein of unknown function DUF214  24.73 
 
 
321 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000420483  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2740  hypothetical protein  25.54 
 
 
302 aa  91.3  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.266796  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3845  cell division protein FtsX  24.65 
 
 
321 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000185349  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0173  hypothetical protein  24.73 
 
 
321 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000303587  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1759  protein of unknown function DUF214  24.48 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.899046  normal  0.32093 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2399  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
304 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0296581 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2664  cell division protein FtsX  27.44 
 
 
304 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.131472  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3970  cell division protein FtsX  25.43 
 
 
321 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000192163  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4293  hypothetical protein  24.38 
 
 
321 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0279  cell division protein FtsX  25.17 
 
 
300 aa  89.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0277  hypothetical protein  25.35 
 
 
321 aa  89.4  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000163126  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1612  cell division protein FtsX  21.36 
 
 
297 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1730  cell division protein FtsX  26.78 
 
 
306 aa  89  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1637  cell division protein FtsX  21.36 
 
 
297 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0736883  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1583  cell division protein FtsX  21.36 
 
 
297 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.799502  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3978  hypothetical protein  23.96 
 
 
321 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000353238  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2751  cell division protein FtsX, putative  25.75 
 
 
301 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0219043  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2371  protein of unknown function DUF214  25.75 
 
 
301 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111261  hitchhiker  0.0000736942 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3503  hypothetical protein  26.3 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107838  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0291  hypothetical protein  24.83 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000447855  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0203  hypothetical protein  23.4 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000250844  decreased coverage  0.00000260823 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0221  hypothetical protein  24.11 
 
 
321 aa  87  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.114522  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07710  cell division protein FtsX  22.74 
 
 
299 aa  87  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0946  cell division protein FtsX  22.33 
 
 
300 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.607127  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1883  protein of unknown function DUF214  23.41 
 
 
290 aa  86.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00298742 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0731  cell division protein FtsX  29.47 
 
 
299 aa  86.3  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1269  cell division protein FtsX  30.65 
 
 
303 aa  85.9  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.318969  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4063  cell division protein FtsX  23.81 
 
 
321 aa  85.9  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0023  hypothetical protein  24.03 
 
 
291 aa  85.5  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0520  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  26.71 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>