More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1849 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1849  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
499 aa  1009    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  59.15 
 
 
471 aa  537  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2119  heavy metal transport/detoxification protein  50.84 
 
 
621 aa  457  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0800  hypothetical protein  38.52 
 
 
263 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1922  hypothetical protein  32.73 
 
 
226 aa  104  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1245  hypothetical protein  31.58 
 
 
228 aa  103  6e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2297  ferric reductase domain-containing protein protein transmembrane component domain-containing protein  29.54 
 
 
410 aa  92.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2489  integral membrane protein  32.75 
 
 
228 aa  90.5  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0864666 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1959  hypothetical protein  30.67 
 
 
423 aa  87.4  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178526  normal  0.959874 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0238  hypothetical protein  29.11 
 
 
393 aa  85.9  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.563587 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1988  hypothetical protein  31.78 
 
 
249 aa  85.1  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1310  hypothetical protein  28.11 
 
 
235 aa  84  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1831  hypothetical protein  31.17 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0400  hypothetical protein  29.1 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1229  hypothetical protein  31.44 
 
 
219 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2418  hypothetical protein  28.51 
 
 
230 aa  82  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0165025  decreased coverage  0.000000160717 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0467  hypothetical protein  28.57 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2541  hypothetical protein  27.63 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.832454  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0375  hypothetical protein  26.64 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.767045  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2424  hypothetical protein  30.56 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1792  hypothetical protein  28.33 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3048  hypothetical protein  30.93 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1191  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  26.67 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0792  hypothetical protein  27.02 
 
 
288 aa  77  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2213  hypothetical protein  29.15 
 
 
230 aa  77  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.113796  normal  0.262784 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2163  hypothetical protein  29.15 
 
 
230 aa  77  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0373  hypothetical protein  26.94 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2066  integral membrane protein  28.51 
 
 
220 aa  76.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2357  hypothetical protein  29.02 
 
 
234 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2114  hypothetical protein  29.02 
 
 
230 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141432  normal  0.255263 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1992  hypothetical protein  30.26 
 
 
230 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0778906  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2013  hypothetical protein  29.02 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000381426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1962  hypothetical protein  29.02 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00784562 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2221  hypothetical protein  27.27 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157963  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0282  hypothetical protein  28.96 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1224  hypothetical protein  32.31 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.042848  normal  0.766858 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0850  hypothetical protein  26.58 
 
 
211 aa  73.2  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0576  hypothetical protein  28.8 
 
 
279 aa  72.8  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0856861  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1143  hypothetical protein  25.76 
 
 
226 aa  72  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00632883  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4494  hypothetical protein  27.35 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2208  hypothetical protein  27.35 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224679  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2221  hypothetical protein  27.8 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000192671  normal  0.249817 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
889 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1046  hypothetical protein  29.46 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.165842  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0686  hypothetical protein  25.31 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0203  hypothetical protein  27.08 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  32.65 
 
 
889 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1570  membrane protein  30.05 
 
 
224 aa  68.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.403322  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2017  hypothetical protein  25.43 
 
 
229 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2218  hypothetical protein  26.41 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0727  hypothetical protein  27.18 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227366  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0185  hypothetical protein  29.49 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000266535  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1844  hypothetical protein  25.89 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106534  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0899  hypothetical protein  25.98 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2923  hypothetical protein  27.44 
 
 
225 aa  66.6  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1158  hypothetical protein  31.18 
 
 
236 aa  66.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.102701 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1952  hypothetical protein  27.27 
 
 
230 aa  66.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0675  hypothetical protein  26.43 
 
 
226 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1841  hypothetical protein  26.4 
 
 
219 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1666  hypothetical protein  26.94 
 
 
219 aa  64.3  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.809334  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0945  hypothetical protein  30.5 
 
 
272 aa  64.3  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1815  hypothetical protein  25.97 
 
 
228 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.42452  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1290  hypothetical protein  30.21 
 
 
274 aa  64.3  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1485  hypothetical protein  25.91 
 
 
219 aa  64.3  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5319  hypothetical protein  27.46 
 
 
253 aa  63.9  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003474  membrane protein  31.08 
 
 
225 aa  63.9  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.551919  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0771  hypothetical protein  31.05 
 
 
344 aa  63.9  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000418366  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1473  hypothetical protein  30.46 
 
 
273 aa  63.5  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.068517  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5742  hypothetical protein  27.52 
 
 
311 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1338  hypothetical protein  29.36 
 
 
223 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1371  hypothetical protein  26.72 
 
 
225 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.538624  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1236  hypothetical protein  29.36 
 
 
223 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0115  hypothetical protein  24.15 
 
 
259 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1290  hypothetical protein  32.46 
 
 
236 aa  61.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2482  hypothetical protein  26.13 
 
 
221 aa  61.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3376  hypothetical protein  27.35 
 
 
257 aa  60.8  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4081  hypothetical protein  31.25 
 
 
235 aa  60.5  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3785  hypothetical protein  27.61 
 
 
227 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0684997  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  31.82 
 
 
891 aa  60.5  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  35.16 
 
 
734 aa  60.1  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1176  hypothetical protein  28.57 
 
 
223 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.526094  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44460  hypothetical protein  26.88 
 
 
227 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0118688  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0932  hypothetical protein  27.72 
 
 
231 aa  59.7  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.748857  normal  0.699875 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0252  hypothetical protein  27.32 
 
 
223 aa  59.3  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0720  hypothetical protein  28.63 
 
 
214 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0477616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0096  hypothetical protein  23.31 
 
 
259 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000827062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3557  hypothetical protein  27.89 
 
 
232 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0172503  normal  0.774445 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  41.27 
 
 
67 aa  58.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  41.27 
 
 
68 aa  58.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1505  heavy metal translocating P-type ATPase  31.36 
 
 
716 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1798  hypothetical protein  24.89 
 
 
230 aa  58.2  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.442592  normal  0.18393 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  32.04 
 
 
797 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3236  E1-E2 ATPase-associated domain-containing protein  26.61 
 
 
344 aa  57  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1095  hypothetical protein  27.37 
 
 
186 aa  56.2  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.598703  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4626  heavy metal translocating P-type ATPase  25.69 
 
 
754 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.617338  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0577  heavy metal translocating P-type ATPase  29.31 
 
 
842 aa  56.6  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.951619  normal  0.619407 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0689  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
694 aa  55.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  29.49 
 
 
800 aa  55.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02062  integral membrane protein  27.4 
 
 
219 aa  55.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157996  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02296  hypothetical protein  24.57 
 
 
225 aa  55.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>