230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1838 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 619 aa  1274    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  69.31 
 
 		 756 aa  778    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  36.84 
 
 		 1077 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  37.25 
 
 		 1059 aa  323  8e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  37.25 
 
 		 1059 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  37.17 
 
 		 1041 aa  286  8e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  34.55 
 
 		 1037 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  34.06 
 
 		 1018 aa  274  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.68 
 
 		 697 aa  271  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  30 
 
 		 1019 aa  260  4e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  33.97 
 
 		 1020 aa  257  4e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  38.15 
 
 		 1478 aa  226  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  30.37 
 
 		 689 aa  224  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  31.62 
 
 		 912 aa  221  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  30.73 
 
 		 1050 aa  212  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  29.66 
 
 		 690 aa  207  6e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  30.61 
 
 		 1495 aa  204  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  36.9 
 
 		 423 aa  204  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  34.88 
 
 		 331 aa  204  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  30.78 
 
 		 1780 aa  201  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.89 
 
 		 1146 aa  192  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  33.96 
 
 		 366 aa  191  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  35.03 
 
 		 337 aa  189  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  28.23 
 
 		 806 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  33.92 
 
 		 520 aa  179  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  33.97 
 
 		 323 aa  179  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  32.24 
 
 		 321 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  29 
 
 		 1215 aa  172  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  34.05 
 
 		 338 aa  172  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  34.59 
 
 		 359 aa  171  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  26.63 
 
 		 639 aa  169  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  31.92 
 
 		 324 aa  166  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  28.57 
 
 		 1331 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  34.77 
 
 		 837 aa  161  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  29.87 
 
 		 407 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  34.8 
 
 		 347 aa  159  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  32.56 
 
 		 370 aa  158  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  31.44 
 
 		 374 aa  157  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  31.07 
 
 		 423 aa  156  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  34.46 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  26.23 
 
 		 1242 aa  155  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  29.21 
 
 		 371 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  32.42 
 
 		 491 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  29.8 
 
 		 678 aa  138  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  29.24 
 
 		 369 aa  136  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  28.7 
 
 		 815 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  30.65 
 
 		 328 aa  134  5e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  29.57 
 
 		 477 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  35.23 
 
 		 333 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  29.41 
 
 		 376 aa  131  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  30.17 
 
 		 474 aa  132  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  29.36 
 
 		 820 aa  130  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  29.03 
 
 		 373 aa  130  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  30.74 
 
 		 495 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  30.22 
 
 		 472 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  29.21 
 
 		 382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  30.45 
 
 		 398 aa  127  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  31.72 
 
 		 383 aa  127  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  28.78 
 
 		 497 aa  127  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  28.68 
 
 		 628 aa  126  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  28.05 
 
 		 457 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  31.34 
 
 		 317 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  29.01 
 
 		 490 aa  125  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  30.63 
 
 		 829 aa  125  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  31.49 
 
 		 457 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  29.24 
 
 		 2457 aa  124  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  28.78 
 
 		 1001 aa  123  9e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  28.77 
 
 		 389 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  30.75 
 
 		 543 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  29.62 
 
 		 488 aa  123  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  29.92 
 
 		 487 aa  121  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  29.78 
 
 		 503 aa  121  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  29.91 
 
 		 451 aa  121  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  31.65 
 
 		 474 aa  120  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  26.99 
 
 		 1186 aa  120  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  31.37 
 
 		 364 aa  120  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  30.52 
 
 		 454 aa  120  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  31.51 
 
 		 778 aa  120  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  30.1 
 
 		 399 aa  118  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  29.33 
 
 		 756 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  31.18 
 
 		 451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  31.01 
 
 		 463 aa  114  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  29.79 
 
 		 394 aa  110  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  28.62 
 
 		 370 aa  109  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  28.47 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  25.62 
 
 		 770 aa  106  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  27.22 
 
 		 619 aa  105  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  27.02 
 
 		 465 aa  102  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  27.81 
 
 		 541 aa  100  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  29.13 
 
 		 401 aa  97.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  28.46 
 
 		 309 aa  97.1  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  28.9 
 
 		 388 aa  96.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  25.5 
 
 		 375 aa  94.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  25.73 
 
 		 486 aa  94.4  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2253  glycoside hydrolase family 10  28.57 
 
 		 381 aa  94  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  59.46 
 
 		 707 aa  92.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  49.44 
 
 		 582 aa  89.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0809  glycoside hydrolase family 10  24.38 
 
 		 627 aa  88.6  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  27.05 
 
 		 357 aa  87.8  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  53.33 
 
 		 526 aa  87.8  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>