39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1792 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1792  Firmicute transcriptional repressor of class III stress genes  100 
 
 		 153 aa  316  7e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0324  transcriptional repressor, CtsR  69.93 
 
 		 152 aa  221  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0151565  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0832  transcriptional repressor, CtsR  52.67 
 
 		 152 aa  160  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0126757  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1828  transcriptional repressor, CtsR  48.7 
 
 		 152 aa  152  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000526756  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0252  transcriptional repressor, CtsR  47.1 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.393745 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00840  transcriptional repressor, CtsR  45.39 
 
 		 157 aa  136  7.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.292684  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0558  Firmicute transcriptional repressor of class III stress genes  44.3 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0544  transcriptional repressor, CtsR  44.3 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0076  transcriptional repressor, CtsR  44.08 
 
 		 153 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0143  transcriptional repressor, CtsR  43.79 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0162  transcriptional regulator CtsR  42.76 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0108  transcriptional regulator CtsR  43.42 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000174069  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5227  transcriptional regulator CtsR  43.42 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000820485  hitchhiker  5.82448e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0073  transcriptional repressor, CtsR  43.42 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00398786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0088  transcriptional regulator CtsR  43.42 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24686e-40 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2440  transcriptional repressor  44.81 
 
 		 151 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2754  transcriptional repressor  45.45 
 
 		 151 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0495199  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0077  transcriptional regulator CtsR  43.42 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00235802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0074  transcriptional regulator  43.42 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.633336  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0075  transcriptional regulator  43.42 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0078  transcriptional regulator CtsR  43.42 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0078  transcriptional regulator CtsR  43.42 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0080  transcriptional repressor, CtsR  42.21 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000901486  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2743  transcriptional repressor, CtsR  47.41 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.280232  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0073  transcriptional repressor, CtsR  43.42 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.173946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0099  transcriptional regulator CtsR  42.76 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00122977  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0124  transcriptional repressor, CtsR  40.65 
 
 		 155 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.407779  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1495  transcriptional repressor, CtsR  43.45 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000151028  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0177  Firmicute transcriptional repressor of class III stress genes  41.61 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0513  transcriptional repressor of class III stress genes  43.54 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.162127  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0665  transcriptional repressor of class III stress genes  42.07 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0178  Firmicute transcriptional repressor of class III stress genes  38 
 
 		 174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.791  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0108  class III stress gene transcriptional regulator  46.56 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00387323  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1829  transcriptional regulator CtsR  42.18 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0244225  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0386  transcriptional repressor, CtsR  34.87 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000276143  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1405  transcriptional repressor, CtsR  35.67 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1951  transcriptional repressor, CtsR  35.04 
 
 		 155 aa  100  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0224178  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0159  transcriptional regulator  45 
 
 		 122 aa  98.6  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2370  transcriptional repressor of class III stress genes-like protein  38.69 
 
 		 142 aa  93.6  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000351373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>