More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1766 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1766  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 277 aa  557  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000141606  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2904  gamma-glutamyl kinase  67.16 
 
 		 269 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2583  gamma-glutamyl kinase  66.79 
 
 		 269 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2877  gamma-glutamyl kinase  65.67 
 
 		 272 aa  363  2e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.518001  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1645  glutamate 5-kinase  56.06 
 
 		 266 aa  285  4e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2603  glutamate 5-kinase  53.51 
 
 		 282 aa  278  9e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  51.92 
 
 		 372 aa  265  7e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  48.51 
 
 		 373 aa  263  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1717  gamma-glutamyl kinase  49.24 
 
 		 270 aa  259  3e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  50.19 
 
 		 375 aa  258  6e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0283  gamma-glutamyl kinase  47.58 
 
 		 267 aa  256  4e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  47.45 
 
 		 378 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  50.74 
 
 		 374 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1676  gamma-glutamyl kinase  47.92 
 
 		 267 aa  253  3e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0346  glutamate 5-kinase  47.47 
 
 		 262 aa  245  6e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  48.3 
 
 		 373 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  47.19 
 
 		 373 aa  240  2e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  50.19 
 
 		 373 aa  239  5e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0481  gamma-glutamyl kinase  44.89 
 
 		 406 aa  236  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  43.54 
 
 		 376 aa  230  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  49.81 
 
 		 373 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  48.58 
 
 		 387 aa  229  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  46.99 
 
 		 373 aa  229  5e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2415  gamma-glutamyl kinase  43.54 
 
 		 375 aa  228  6e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0941339  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  46.56 
 
 		 373 aa  226  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  46.74 
 
 		 363 aa  225  6e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  47.27 
 
 		 370 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  46.01 
 
 		 367 aa  223  3e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0947  glutamate 5-kinase  44.49 
 
 		 268 aa  223  3e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0230243  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  46.42 
 
 		 373 aa  223  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  46.04 
 
 		 369 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  46.04 
 
 		 369 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  45.19 
 
 		 390 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  45.49 
 
 		 373 aa  219  3e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  45.11 
 
 		 373 aa  218  8.999999999999998e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  44.66 
 
 		 367 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0294  glutamate 5-kinase  44.44 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.144372  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  44.36 
 
 		 383 aa  216  5e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  46.36 
 
 		 369 aa  215  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  45.17 
 
 		 372 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  45.17 
 
 		 372 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  45.17 
 
 		 372 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  45.17 
 
 		 372 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  41.83 
 
 		 374 aa  210  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  43.23 
 
 		 367 aa  209  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  45.83 
 
 		 369 aa  208  7e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  44.06 
 
 		 366 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  42.09 
 
 		 382 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2010  glutamate 5-kinase  38.32 
 
 		 382 aa  207  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00026672  hitchhiker  0.000000000000558815 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  41.48 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  44.79 
 
 		 374 aa  206  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  40.74 
 
 		 392 aa  205  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  46.95 
 
 		 371 aa  205  8e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  41.85 
 
 		 372 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  42.26 
 
 		 376 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  40.45 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  45.38 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  44.84 
 
 		 379 aa  203  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  44.02 
 
 		 369 aa  203  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  43.63 
 
 		 372 aa  203  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  42.97 
 
 		 369 aa  202  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  42.75 
 
 		 393 aa  202  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  43.51 
 
 		 379 aa  202  7e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  41.48 
 
 		 372 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2872  gamma-glutamyl kinase  42.35 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  42.48 
 
 		 367 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  42.48 
 
 		 367 aa  199  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  42.48 
 
 		 367 aa  199  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  41.67 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  42.48 
 
 		 367 aa  199  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  42.48 
 
 		 367 aa  199  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  42.48 
 
 		 367 aa  199  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  42.48 
 
 		 367 aa  199  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  41.85 
 
 		 372 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  42.48 
 
 		 367 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  41.85 
 
 		 372 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  41.85 
 
 		 372 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  42.48 
 
 		 367 aa  199  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1538  glutamate 5-kinase  41.73 
 
 		 393 aa  199  3.9999999999999996e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  44.72 
 
 		 379 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0197  glutamate 5-kinase  41.13 
 
 		 260 aa  198  6e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.670063  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  44.02 
 
 		 372 aa  198  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  42.37 
 
 		 376 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  42.37 
 
 		 376 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  43.28 
 
 		 376 aa  198  7.999999999999999e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  41.35 
 
 		 367 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  41.35 
 
 		 367 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  41.35 
 
 		 367 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  41.35 
 
 		 367 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  41.35 
 
 		 367 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  41.11 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  44.62 
 
 		 376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0158  gamma-glutamyl kinase  46.61 
 
 		 376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.169328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  41.11 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  43.63 
 
 		 372 aa  196  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05817  glutamate 5-kinase (Eurofung)  42.69 
 
 		 419 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.278378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7269  glutamate 5-kinase  43.91 
 
 		 375 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  41.73 
 
 		 367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  41.11 
 
 		 372 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  40.37 
 
 		 372 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>