More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1760 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2876  glycosyl transferase family 51  51.34 
 
 		 861 aa  710    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.186058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 		 824 aa  1704    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  40.81 
 
 		 814 aa  502  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  41.43 
 
 		 829 aa  479  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  37.74 
 
 		 905 aa  430  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  36.1 
 
 		 765 aa  412  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  33.8 
 
 		 843 aa  396  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  33.54 
 
 		 941 aa  396  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2218  1A family penicillin-binding protein  35.1 
 
 		 830 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  35.36 
 
 		 761 aa  388  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  34.7 
 
 		 795 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  35.72 
 
 		 880 aa  382  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1930  membrane carboxypeptidase mrcB  35.25 
 
 		 820 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  34.94 
 
 		 828 aa  379  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  35.6 
 
 		 806 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  36.57 
 
 		 727 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  35.43 
 
 		 727 aa  369  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  34.67 
 
 		 661 aa  344  4e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  33.98 
 
 		 705 aa  334  4e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  36.08 
 
 		 649 aa  331  3e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  34.98 
 
 		 643 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  33.63 
 
 		 668 aa  330  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2107  penicillin-binding protein, 1A family  35.01 
 
 		 912 aa  329  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  32.38 
 
 		 640 aa  327  5e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  36.74 
 
 		 683 aa  325  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  36.74 
 
 		 683 aa  324  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  36.34 
 
 		 681 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  36.59 
 
 		 683 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  35.06 
 
 		 646 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  36.55 
 
 		 761 aa  321  3.9999999999999996e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  34.75 
 
 		 643 aa  320  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  33.54 
 
 		 640 aa  320  5e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  34.75 
 
 		 643 aa  320  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  36.59 
 
 		 683 aa  319  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0511  penicillin-binding protein, 1A family  36.04 
 
 		 901 aa  319  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  36.59 
 
 		 683 aa  319  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  36.59 
 
 		 683 aa  318  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  36.59 
 
 		 683 aa  317  4e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  36.59 
 
 		 683 aa  317  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  36.59 
 
 		 683 aa  317  5e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  36.43 
 
 		 683 aa  317  6e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  35.96 
 
 		 776 aa  316  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  32.91 
 
 		 618 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  37.02 
 
 		 709 aa  314  4.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  34.96 
 
 		 683 aa  313  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  35.09 
 
 		 648 aa  312  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  34 
 
 		 706 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  35.77 
 
 		 683 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  32.32 
 
 		 625 aa  308  3e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2124  glycosyl transferase family 51  31.09 
 
 		 934 aa  308  4.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.563834  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  33.13 
 
 		 705 aa  306  9.000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  33.38 
 
 		 701 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  33.7 
 
 		 679 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  33.93 
 
 		 837 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  34.03 
 
 		 820 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  33.83 
 
 		 837 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  34.03 
 
 		 846 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  34.03 
 
 		 834 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  33.18 
 
 		 830 aa  299  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  33.86 
 
 		 676 aa  299  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  33.23 
 
 		 839 aa  298  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  33.24 
 
 		 744 aa  297  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  32.85 
 
 		 654 aa  297  5e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  33.78 
 
 		 835 aa  296  7e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  33.43 
 
 		 662 aa  296  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  33.58 
 
 		 834 aa  296  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  35.84 
 
 		 680 aa  295  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  32.23 
 
 		 836 aa  295  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  35.48 
 
 		 667 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  35.3 
 
 		 680 aa  295  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  35.48 
 
 		 680 aa  295  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  35.48 
 
 		 680 aa  295  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  35.3 
 
 		 680 aa  294  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  35.3 
 
 		 673 aa  294  5e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  35.3 
 
 		 673 aa  294  5e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  35.22 
 
 		 712 aa  294  5e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  35.13 
 
 		 680 aa  293  6e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 794 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  36.04 
 
 		 746 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  32.59 
 
 		 832 aa  290  6e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  33.07 
 
 		 774 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  33.11 
 
 		 679 aa  288  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  34.42 
 
 		 665 aa  289  2e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  35.2 
 
 		 705 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  31.81 
 
 		 762 aa  287  7e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  35.14 
 
 		 746 aa  286  8e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  31.46 
 
 		 693 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  34.48 
 
 		 705 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  32.98 
 
 		 656 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  32.84 
 
 		 861 aa  285  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  32.54 
 
 		 667 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  35.03 
 
 		 705 aa  285  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1025  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.15 
 
 		 791 aa  282  1e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  34.48 
 
 		 705 aa  282  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  34.48 
 
 		 705 aa  282  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  34.48 
 
 		 705 aa  282  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  33.33 
 
 		 750 aa  282  2e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  31.67 
 
 		 720 aa  281  5e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  34.17 
 
 		 705 aa  280  8e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0920  1A family penicillin-binding protein  30.47 
 
 		 754 aa  280  1e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>