144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1721 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  100 
 
 
419 aa  870  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  40.16 
 
 
413 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  40.16 
 
 
413 aa  275  1e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  2.75865e-11 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  40.32 
 
 
413 aa  273  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  1.36411e-08 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  37.93 
 
 
421 aa  268  1e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  38.63 
 
 
444 aa  267  3e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  38.65 
 
 
414 aa  256  6e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  38.65 
 
 
414 aa  256  7e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  36.68 
 
 
440 aa  252  9e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  36.41 
 
 
420 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  40.06 
 
 
425 aa  244  2e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  40.06 
 
 
425 aa  244  2e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  40.06 
 
 
425 aa  244  2e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  32.97 
 
 
524 aa  223  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  35.09 
 
 
390 aa  221  2e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  31.51 
 
 
423 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  33.98 
 
 
389 aa  217  3e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  5.55494e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  33.24 
 
 
426 aa  215  1e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  31.95 
 
 
407 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  33.6 
 
 
434 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  6.79414e-05 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  31.94 
 
 
384 aa  198  1e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  31.15 
 
 
424 aa  195  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  30.94 
 
 
436 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  32.73 
 
 
409 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  31.56 
 
 
416 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  29.52 
 
 
407 aa  186  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  32.1 
 
 
434 aa  186  9e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  33.14 
 
 
542 aa  180  3e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  31.22 
 
 
415 aa  179  6e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  31.17 
 
 
434 aa  175  2e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  30.08 
 
 
420 aa  173  6e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  31.58 
 
 
417 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  29.82 
 
 
408 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  31.91 
 
 
432 aa  171  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  30.92 
 
 
412 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  31.06 
 
 
444 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  32.04 
 
 
409 aa  169  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  30.79 
 
 
431 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  6.49364e-05 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  28.3 
 
 
408 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  31.34 
 
 
434 aa  165  1e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  30.21 
 
 
404 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  28.76 
 
 
428 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  26.46 
 
 
416 aa  157  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  28.84 
 
 
473 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  30.85 
 
 
445 aa  154  3e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  6.93474e-09 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  27.79 
 
 
428 aa  152  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  29.44 
 
 
404 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  28.88 
 
 
416 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  28.88 
 
 
416 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  26.49 
 
 
412 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  26.68 
 
 
411 aa  149  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  29.33 
 
 
429 aa  141  2e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  27.1 
 
 
401 aa  141  2e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  27.52 
 
 
429 aa  140  4e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  26.98 
 
 
417 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1968  hypothetical protein  28.28 
 
 
435 aa  136  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  28.26 
 
 
460 aa  135  1e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  24.72 
 
 
395 aa  135  2e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  28.34 
 
 
833 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  6.39413e-05 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  28.34 
 
 
859 aa  134  4e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  1.40812e-05 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  28.34 
 
 
833 aa  134  4e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  26.8 
 
 
408 aa  133  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  26.02 
 
 
398 aa  130  5e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  26.1 
 
 
445 aa  129  1e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  26.98 
 
 
447 aa  129  1e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  26.1 
 
 
445 aa  128  2e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  27.47 
 
 
413 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  25.06 
 
 
393 aa  122  1e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  24.87 
 
 
544 aa  121  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  25.51 
 
 
397 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  26.22 
 
 
433 aa  118  2e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.6128e-12 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1060  HK97 family phage portal protein  26.72 
 
 
412 aa  115  2e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1080  HK97 family phage portal protein  26.72 
 
 
412 aa  115  2e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  25.76 
 
 
417 aa  115  2e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  27.03 
 
 
413 aa  114  4e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  25.96 
 
 
420 aa  113  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  25.82 
 
 
422 aa  113  7e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  26.13 
 
 
406 aa  112  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  27.27 
 
 
392 aa  112  1e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2238  phage portal protein, HK97 family  26.43 
 
 
389 aa  112  1e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0330088  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  22.75 
 
 
407 aa  110  4e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  27.8 
 
 
399 aa  110  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  26.27 
 
 
406 aa  109  8e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  27.2 
 
 
411 aa  108  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2688  phage portal protein, HK97 family  24.53 
 
 
464 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.912505  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  24.52 
 
 
392 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1303  phage portal protein, HK97 family  25.95 
 
 
437 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  26.11 
 
 
441 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4093  hypothetical protein  26.01 
 
 
389 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3805  hypothetical protein  26.01 
 
 
404 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  32.02 
 
 
225 aa  103  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  25.88 
 
 
454 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  25.88 
 
 
454 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  25.73 
 
 
391 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  26.05 
 
 
414 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  22.93 
 
 
455 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  27.15 
 
 
408 aa  97.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1410  Phage portal protein, HK97  26.5 
 
 
391 aa  96.7  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4384  phage portal protein, HK97 family  28.35 
 
 
264 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0903  HK97 family phage portal protein  26.86 
 
 
391 aa  96.3  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.580107 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>