29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1553 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1553  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  394  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2559  hypothetical protein  29.65 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  26.78 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.62 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.48 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  26.76 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  29.1 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  25.43 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.06 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  26.52 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  24.06 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  26.52 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  30.08 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.85 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  24.5 
 
 		 191 aa  51.2  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.1 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  26.75 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.87 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  23.3 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  26.49 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  27.06 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.34 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.55 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  22.99 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  22.34 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  20.74 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  20.74 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.87 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  21.92 
 
 		 190 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>