245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1508 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1508  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  241  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2269  arsenate reductase and related  65.18 
 
 		 118 aa  158  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.81941e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10960  hypothetical protein  56.41 
 
 		 120 aa  155  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.262634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0206  arsenate reductase and related  66.36 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2504  arsenate reductase and related  57.52 
 
 		 120 aa  153  9e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0237  arsenate reductase and related  62.83 
 
 		 119 aa  150  5e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.323435 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2357  ArsC family protein  62.73 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2672  ArsC family protein  62.73 
 
 		 118 aa  147  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15090  hypothetical protein  55.65 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.737886  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1109  arsenate reductase and related  50.44 
 
 		 122 aa  134  4e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0920  arsenate reductase-like protein  58.56 
 
 		 114 aa  133  9e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4815  arsenate reductase and related  56.64 
 
 		 121 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000608235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5131  hypothetical protein  56.64 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000307731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4860  hypothetical protein  56.64 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00587583  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4701  arsenate reductase  56.64 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000403452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4717  arsenate reductase  56.64 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000794506  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5229  hypothetical protein  56.64 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000111635  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0104  hypothetical protein  56.64 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000725895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5098  hypothetical protein  56.64 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5134  hypothetical protein  56.64 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5136  hypothetical protein  56.64 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00116769  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3587  arsenate reductase and related  56.64 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000181597  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1058  arsenate reductase and related  54.72 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115844  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3085  arsenate reductase and related protein  55.56 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2934  arsenate reductase and related  57.66 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0130498  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0484  hypothetical protein  49.09 
 
 		 117 aa  114  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0838  arsenate reductase  48.65 
 
 		 116 aa  114  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0227147  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5135  arsenate reductase related protein  46.85 
 
 		 134 aa  114  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1227  arsenate reductase-like protein  49.55 
 
 		 116 aa  110  9e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0377226  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2269  arsenate reductase and related  48.6 
 
 		 122 aa  107  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0831  hypothetical protein  45.54 
 
 		 118 aa  107  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0222832  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0848  hypothetical protein  45.54 
 
 		 118 aa  107  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000170157  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1485  arsenate reductase  53.77 
 
 		 117 aa  107  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000184523  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1564  hypothetical protein  49.06 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2009  arsenate reductase and related  40.54 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000123591  normal  0.186875 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07481  putative arsenate reductase  43.52 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0744  arsenate reductase  37.38 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000148038  hitchhiker  0.000145224 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05691  putative arsenate reductase  38.39 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05761  putative arsenate reductase  36.21 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05131  putative arsenate reductase  43.12 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.129229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1264  arsenate reductase and related  34 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447038  normal  0.406086 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0011  hypothetical protein  32.41 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0513  hypothetical protein  34.82 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.752698  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1328  arsenate reductase and related  31.78 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0697  hypothetical protein  34.55 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2687  hypothetical protein  39.42 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0736  arsenate reductase and related  37.86 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.127695 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1661  hypothetical protein  37.61 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1421  hypothetical protein  32.71 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000321646  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1894  hypothetical protein  30.84 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.169993  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2417  hypothetical protein  30.09 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156213  decreased coverage  0.000000935977 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0576  transcriptional regulator Spx  29.25 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.926413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1309  transcriptional regulator Spx  31.13 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516979  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1347  transcriptional regulator Spx  31.13 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0109883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1109  transcriptional regulator Spx  31.13 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1091  transcriptional regulator Spx  31.13 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1085  transcriptional regulator Spx  31.13 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0904  transcriptional regulator Spx  31.13 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.873656  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1200  transcriptional regulator Spx  31.13 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4100  transcriptional regulator Spx  31.13 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1242  transcriptional regulator Spx  31.13 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1270  transcriptional regulator Spx  31.13 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05391  putative arsenate reductase  37.17 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01143  ArsC family protein  33.04 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.013195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3423  transcriptional regulator Spx  26.79 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126084  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0763  transcriptional regulator Spx  30.19 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1097  transcriptional regulator Spx  30.19 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0996  transcriptional regulator Spx  28.3 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.444698  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1015  transcriptional regulator Spx  28.3 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000679905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1618  transcriptional regulator Spx  29.25 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05701  putative arsenate reductase  35.51 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1290  hypothetical protein  35.19 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1391  hypothetical protein  30.48 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3422  transcriptional regulator Spx  25.89 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3202  transcriptional regulator Spx  25.89 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0489409  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3181  transcriptional regulator Spx  25.89 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3109  transcriptional regulator Spx  25.89 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2189  arsenate reductase and related  32.46 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00825632 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1845  hypothetical protein  33.93 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.404763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3456  transcriptional regulator Spx  25.89 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4559  putative arsenate reductase  31.43 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.720566  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1992  arsenate reductase and related  31.43 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.788879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3434  transcriptional regulator Spx  25.89 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3411  transcriptional regulator Spx  26.79 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000835539  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2552  arsenate reductase and related  29.36 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0688567  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1835  transcriptional regulator Spx  26.79 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.27338  normal  0.376442 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1815  hypothetical protein  31.43 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.832814  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1359  arsenate reductase  30.19 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00176431  normal  0.0126888 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1868  hypothetical protein  29.81 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51980  putative arsenate reductase  31.43 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00081226 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0094  hypothetical protein  31.53 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1017  arsenate reductase and related  28.3 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2595  ArsC family transcription regulator  28.3 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.613021  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1602  hypothetical protein  24.78 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2070  hypothetical protein  28.3 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.764259  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1342  hypothetical protein  28.3 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.976086  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3242  hypothetical protein  28.3 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2506  ArsC family protein  28.3 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1087  arsenate reductase and related  24.32 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.95059 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0134  hypothetical protein  31.43 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>