More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1486 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 131 aa  267  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  55.93 
 
 		 129 aa  140  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  50.4 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  41.98 
 
 		 137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 		 133 aa  103  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  39.39 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 		 138 aa  100  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  36.8 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  41.54 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  36.8 
 
 		 136 aa  97.1  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  39.68 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  35.94 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.5 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 		 129 aa  94.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 		 129 aa  94.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 138 aa  90.9  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  38.84 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11430  ADP-ribose pyrophosphatase  44.44 
 
 		 129 aa  90.1  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.250404  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  40.98 
 
 		 316 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  36.72 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3528  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321169  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  39.02 
 
 		 128 aa  89.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  36.15 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  36.59 
 
 		 138 aa  88.2  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  36.59 
 
 		 138 aa  88.2  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  38.84 
 
 		 134 aa  87.8  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  35.2 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 169 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  38.52 
 
 		 314 aa  87  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0153  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.89 
 
 		 131 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 154 aa  87  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.36 
 
 		 135 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.36 
 
 		 135 aa  87  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.36 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.36 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  36.36 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0154  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.1 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000120622  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.36 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.1 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0349436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.36 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  37.82 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  35.94 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  32.28 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.71 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.71 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.71 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  38.66 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  38.52 
 
 		 316 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  36.72 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  35.94 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  40.16 
 
 		 314 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  37.19 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  40.16 
 
 		 314 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  35.94 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  39.34 
 
 		 314 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  39.06 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  36.8 
 
 		 316 aa  84  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.35 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 		 151 aa  83.6  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.3 
 
 		 131 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  37.82 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  42.28 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  38.66 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  34.13 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  39.34 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  35.16 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  34.35 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  34.35 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  35.16 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  32.28 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  35.94 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  35.94 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  35.94 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.51 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  36.97 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  37.1 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  38.05 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  36.36 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  34.96 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>