More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1428 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 442 aa  921    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  51.76 
 
 		 432 aa  480  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  41.4 
 
 		 427 aa  349  6e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  40.74 
 
 		 418 aa  343  4e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  39.81 
 
 		 427 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  36.6 
 
 		 431 aa  300  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 		 431 aa  295  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  37.1 
 
 		 417 aa  283  5.000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  34.92 
 
 		 443 aa  272  8.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  31.63 
 
 		 450 aa  248  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  33.88 
 
 		 439 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  36.53 
 
 		 399 aa  245  9.999999999999999e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  32.17 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  31.55 
 
 		 436 aa  239  9e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  31.7 
 
 		 446 aa  233  5e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  31.7 
 
 		 446 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  33.48 
 
 		 465 aa  227  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  33.33 
 
 		 446 aa  224  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  31.33 
 
 		 453 aa  223  7e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  30.84 
 
 		 451 aa  223  7e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  30.47 
 
 		 447 aa  216  8e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  31 
 
 		 472 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  29.77 
 
 		 446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  31.06 
 
 		 479 aa  213  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  30.7 
 
 		 471 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  30.91 
 
 		 458 aa  212  9e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  30.66 
 
 		 438 aa  210  4e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  29.19 
 
 		 478 aa  209  8e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  29.66 
 
 		 435 aa  209  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  0.0000345699 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  30.59 
 
 		 444 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  33.02 
 
 		 446 aa  207  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  31.04 
 
 		 474 aa  207  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  29.73 
 
 		 452 aa  206  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  30.67 
 
 		 447 aa  206  9e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  31.24 
 
 		 482 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  30.61 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  30.57 
 
 		 455 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2977  glycoside hydrolase family protein  30.26 
 
 		 473 aa  204  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  30.42 
 
 		 457 aa  203  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  29.47 
 
 		 475 aa  202  9.999999999999999e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  29.89 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  30.05 
 
 		 456 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  28.2 
 
 		 478 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  31.1 
 
 		 457 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  30.18 
 
 		 448 aa  199  7e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  28.28 
 
 		 444 aa  199  7.999999999999999e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  28.35 
 
 		 448 aa  199  7.999999999999999e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  30.21 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  29.65 
 
 		 447 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  31.38 
 
 		 457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  30.8 
 
 		 454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  30.45 
 
 		 443 aa  197  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  31.51 
 
 		 443 aa  197  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  30.96 
 
 		 450 aa  197  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  28.89 
 
 		 452 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  31.35 
 
 		 468 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  30.37 
 
 		 436 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  30.23 
 
 		 443 aa  196  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0421  glycoside hydrolase family 1  29.2 
 
 		 419 aa  195  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  31.15 
 
 		 909 aa  194  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  30.48 
 
 		 456 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  30.47 
 
 		 451 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  28.85 
 
 		 484 aa  194  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  29.12 
 
 		 460 aa  193  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  30.72 
 
 		 470 aa  193  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  29.8 
 
 		 452 aa  193  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  29.98 
 
 		 443 aa  193  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  28.89 
 
 		 463 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  28.76 
 
 		 476 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  30.47 
 
 		 451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  30.02 
 
 		 451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  31.05 
 
 		 458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  30.11 
 
 		 449 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  28.18 
 
 		 478 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  28.82 
 
 		 465 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3254  glycoside hydrolase family protein  28.3 
 
 		 447 aa  190  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0374  beta-galactosidase  29.74 
 
 		 450 aa  190  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  29.61 
 
 		 451 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4868  beta-galactosidase  29.07 
 
 		 467 aa  189  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  27.74 
 
 		 440 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  29.33 
 
 		 437 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  27.52 
 
 		 440 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5280  glycoside hydrolase family protein  29.29 
 
 		 411 aa  186  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0160415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  28.54 
 
 		 453 aa  186  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1146  Beta-glucosidase  27.03 
 
 		 440 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  29.33 
 
 		 451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  29.71 
 
 		 448 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  28.96 
 
 		 440 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  27.77 
 
 		 470 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4086  beta-galactosidase  29.89 
 
 		 486 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  28.3 
 
 		 487 aa  183  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  29.4 
 
 		 462 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  29.66 
 
 		 445 aa  184  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  30.54 
 
 		 472 aa  183  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  27.5 
 
 		 467 aa  182  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  29.35 
 
 		 467 aa  182  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3603  TonB-like  29.31 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70293  hitchhiker  0.00573623 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0408  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 		 489 aa  182  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0125143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  29.1 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1675  glycoside hydrolase family protein  28.24 
 
 		 513 aa  182  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.256832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>