133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1403 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1403  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  157  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000019966  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3837  FeoA family protein  60.27 
 
 
86 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2718  FeoA family protein  58.33 
 
 
89 aa  83.6  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641042  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02720  Ferrous iron transport protein FeoA  56.52 
 
 
73 aa  79  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1407  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  73.9  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1267  FeoA family protein  50 
 
 
83 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3773  FeoA family protein  48.61 
 
 
82 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0602  FeoA family protein  44.12 
 
 
85 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0749  putative ferrous iron transport protein A  41.18 
 
 
85 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0630  FeoA family protein  41.18 
 
 
85 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0783  ferrous iron transport protein A, putative  39.71 
 
 
85 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0130272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0680  ferrous iron transport protein A  39.71 
 
 
85 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0624  ferrous iron transport protein A  39.71 
 
 
85 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0624  ferrous iron transport protein A  39.71 
 
 
85 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000493594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0714  ferrous iron transport protein A  39.71 
 
 
85 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0843  putative ferrous iron transport protein A  39.71 
 
 
85 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.923464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4588  putative ferrous iron transport protein A  39.71 
 
 
85 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0769  putative ferrous iron transport protein A  39.71 
 
 
85 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000079809 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2075  ferrous iron transport protein A  42.86 
 
 
97 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.874306 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1971  FeoA family protein  47.69 
 
 
86 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0237641  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0109  FeoA family protein  36.62 
 
 
90 aa  61.2  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000157937  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2276  FeoA family protein  40.79 
 
 
84 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0107  FeoA family protein  36.62 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2844  FeoA family protein  42.03 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1016  FeoA family protein  37.66 
 
 
85 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.83545 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0674  FeoA family protein  38.16 
 
 
86 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.548462  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0777  hypothetical protein  39.19 
 
 
82 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.658901  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0972  FeoA family protein  43.28 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0271378 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2465  FeoA family protein  37.68 
 
 
94 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1450  ferrous iron transport protein A  36.62 
 
 
82 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348854  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2670  ferrous iron transport protein A, putative  36.49 
 
 
78 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.501663  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0013  FeoA family protein  39.19 
 
 
85 aa  55.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778712  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2214  FeoA family protein  34.72 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20060  Fe2+ transport system protein A  37.5 
 
 
81 aa  55.1  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.200768  normal  0.638087 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2327  FeoA family protein  40.91 
 
 
93 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0317  FeoA family protein  37.66 
 
 
84 aa  55.1  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000585031  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1044  iron dependent repressor, putative  37.18 
 
 
310 aa  54.3  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156073 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16120  ferrous iron transporter FeoB  37.5 
 
 
785 aa  54.7  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000453744 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4512  iron dependent repressor  38.36 
 
 
336 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0909363  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1138  FeoA family protein  38.89 
 
 
80 aa  52.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000908458  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2435  FeoA family protein  35.71 
 
 
95 aa  53.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1750  FeoA family protein  34.25 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000170753  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3460  FeoA family protein  38.03 
 
 
73 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115859  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1930  ferrous iron transport protein A  36.23 
 
 
74 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000534516  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2697  FeoA family protein  34.72 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0855124  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1740  FeoA family protein  39.44 
 
 
142 aa  52  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0361183  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0570  FeoA family protein  38.57 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157552  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0760  FeoA family protein  38.67 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000119012  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1537  hypothetical protein  40.54 
 
 
78 aa  51.6  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3659  FeoA family protein  35.62 
 
 
75 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0433  FeoA family protein  35.71 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0972  FeoA family protein  37.14 
 
 
81 aa  51.2  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000216007  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1459  FeoA family protein  39.44 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0291796  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0194  Fe2+ transport system protein A  38.03 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000592794  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0972  ferrous iron repressor  35.71 
 
 
72 aa  50.4  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0428442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3766  FeoA family protein  35.62 
 
 
75 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1127  ferrous iron transport protein A  35.71 
 
 
72 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00351255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3411  FeoA family protein  37.5 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1193  FeoA family protein  35.21 
 
 
73 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1953  FeoA family protein  36.99 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0961  FeoA family protein  36.49 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0552  FeoA family protein  36 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4104  FeoA family protein  37.5 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.418864  normal  0.543833 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.89 
 
 
207 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0343  FeoA family protein  37.5 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0183501  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3367  FeoA family protein  36.11 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1210  FeoA family protein  40 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2492  FeoA family protein  35.14 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  32.39 
 
 
848 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  30.99 
 
 
238 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1730  FeoA family protein  34.72 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285273  normal  0.0385083 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1089  FeoA family protein  35.14 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000327089  hitchhiker  0.0000000000000328537 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1786  FeoA family protein  35.53 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0221139  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0622  FeoA family protein  29.17 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.927847 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0653  Fe2+ transport system protein A  36.99 
 
 
158 aa  47.4  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1435  hypothetical protein  35.21 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000347504  normal  0.0226993 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0285  Fe2+ transport system protein A  31.43 
 
 
157 aa  47.4  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.621067  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0107  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.48 
 
 
218 aa  47.4  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000388915  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2257  ferrous iron transport protein FeoA  36.99 
 
 
75 aa  47.4  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  33.8 
 
 
844 aa  47  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1341  hypothetical protein  33.33 
 
 
80 aa  47  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.932772  normal  0.0916633 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3292  hypothetical protein  36.11 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27216  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1621  FeoA family protein  31.51 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.453732  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0902  FeoA family protein  35.94 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0959583  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0792  FeoA family protein  40.35 
 
 
76 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1665  ferrous iron transport protein A  40.68 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0965  FeoA family protein  35.14 
 
 
152 aa  45.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0857  hypothetical protein  31.65 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.577958  normal  0.227068 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  34.33 
 
 
784 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2064  ferrous iron transport protein A  33.33 
 
 
74 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1010  ferrous iron transport protein A  43.48 
 
 
72 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4261  FeoA family protein  34.72 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.609569  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13000  Fe2+ transport system protein A  35.71 
 
 
73 aa  44.7  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0312741  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0874  FeoA family protein  35.62 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000423206  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0896  FeoA family protein  35.62 
 
 
154 aa  43.9  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000698283  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  34.72 
 
 
829 aa  43.9  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2566  FeoA family protein  36.62 
 
 
74 aa  43.9  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01363  hypothetical protein  37.04 
 
 
75 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0745  FeoA family protein  36.11 
 
 
79 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.445851 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2585  ferrous iron transporter A  30.14 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>