36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1399 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1399  C_GCAxxG_C_C family protein  100 
 
 		 172 aa  352  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0718926  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  60.96 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0747  C_GCAxxG_C_C family protein  49.67 
 
 		 327 aa  152  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2054  hypothetical protein  44.14 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1937  C_GCAxxG_C_C family protein  44.83 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  43.15 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  39.04 
 
 		 146 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0465  C_GCAxxG_C_C family protein  36.36 
 
 		 146 aa  108  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00655553 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0460  hypothetical protein  38.73 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4296  C_GCAxxG_C_C family protein  41.48 
 
 		 143 aa  94.4  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000101878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  34.06 
 
 		 148 aa  87  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  31.91 
 
 		 148 aa  85.1  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  29.79 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0477  C_GCAxxG_C_C family protein  33.11 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0035  C_GCAxxG_C_C family protein  30.28 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2296  C_GCAxxG_C_C family protein  39.25 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01840  C_GCAxxG_C_C family probable redox protein  39.6 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  29.2 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  34.58 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0510  C_GCAxxG_C_C family protein  29.73 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00782418 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1302  C_GCAxxG_C_C family protein  33.64 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2965  hypothetical protein  25.87 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  28.57 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2280  hypothetical protein  27.27 
 
 		 134 aa  48.1  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2578  hypothetical protein  26.57 
 
 		 134 aa  47.4  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  28.43 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2887  C_GCAxxG_C_C family protein  29.41 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  28.78 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1476  C_GCAxxG_C_C family protein  28.95 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342381  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1719  hypothetical protein  28.06 
 
 		 121 aa  44.7  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408454  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  25 
 
 		 153 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  29.66 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1471  C_GCAxxG_C_C family protein  27.27 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3605  C_GCAxxG_C_C family protein  26.76 
 
 		 148 aa  42  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3781  C_GCAxxG_C_C family protein  26.76 
 
 		 146 aa  41.6  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018786  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1171  C_GCAxxG_C_C family protein  30 
 
 		 257 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.592413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>