More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1355 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
310 aa  637    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  36.13 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 
362 aa  123  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  38.54 
 
 
297 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  37.19 
 
 
326 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 
374 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  37.69 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.68 
 
 
326 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  34.52 
 
 
305 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.5 
 
 
310 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1700  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 
318 aa  112  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
398 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2885  glycosyl transferase family protein  31.95 
 
 
300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418881  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  35.68 
 
 
326 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
289 aa  109  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  34.83 
 
 
326 aa  109  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  33.05 
 
 
380 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1130  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 
332 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  32.72 
 
 
397 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
276 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  32.55 
 
 
390 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
310 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 
321 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  35.42 
 
 
303 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  34.12 
 
 
344 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 
300 aa  106  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 
310 aa  105  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
1035 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  34.14 
 
 
390 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2652  glycosyl transferase family protein  27.22 
 
 
372 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.689444  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  35.57 
 
 
581 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 
305 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
318 aa  102  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 
386 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  35.38 
 
 
347 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  36.22 
 
 
746 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
597 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
847 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 
402 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 
337 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  34.69 
 
 
320 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.51 
 
 
321 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 
313 aa  100  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 
373 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 
1250 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  48.57 
 
 
327 aa  99.4  7e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  34.39 
 
 
318 aa  99  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
333 aa  99  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 
349 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 
341 aa  96.7  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.43 
 
 
317 aa  96.3  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.7 
 
 
327 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  32.7 
 
 
327 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
314 aa  95.9  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 
347 aa  95.9  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 
333 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.23 
 
 
327 aa  95.1  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.23 
 
 
327 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  32.23 
 
 
327 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5156  family 2 glycosyl transferase  35.12 
 
 
216 aa  94.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.23 
 
 
327 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  32.23 
 
 
327 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.41 
 
 
312 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2653  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 
332 aa  94.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106292  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 
347 aa  94  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.15 
 
 
266 aa  94  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  48.51 
 
 
102 aa  93.6  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  32.45 
 
 
352 aa  93.2  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7004  glycosyl transferase family 2  41.67 
 
 
155 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  31.61 
 
 
333 aa  92.8  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3024  putative glycosyl transferase  33.18 
 
 
292 aa  92.8  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
261 aa  92.8  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  28.91 
 
 
672 aa  92.4  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
357 aa  92.4  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
294 aa  92.4  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  33 
 
 
1038 aa  92.4  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2347  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 
295 aa  92.4  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 
235 aa  92.4  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 
299 aa  92.4  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.15 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
351 aa  92  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.32 
 
 
324 aa  90.9  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.15 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.15 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  35.15 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2494  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 
322 aa  91.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0194335  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2506  b-glycosyltransferase  28.64 
 
 
309 aa  90.9  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
337 aa  90.5  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.55 
 
 
266 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 
308 aa  90.5  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.95 
 
 
251 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2822  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
317 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  39.55 
 
 
249 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 
323 aa  90.1  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  27 
 
 
327 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
250 aa  89.7  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 
324 aa  89.4  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 
309 aa  89  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 
307 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>