More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1352 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
443 aa  903    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.53 
 
 
460 aa  589  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.14 
 
 
440 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3094  nucleotide sugar dehydrogenase  59.1 
 
 
440 aa  526  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  54.55 
 
 
438 aa  496  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  53.18 
 
 
434 aa  485  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  52.95 
 
 
434 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  52.95 
 
 
434 aa  482  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  52.16 
 
 
438 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  52.73 
 
 
433 aa  481  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  52.16 
 
 
438 aa  479  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.9 
 
 
434 aa  476  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  51.71 
 
 
440 aa  475  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.48 
 
 
438 aa  475  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  51.94 
 
 
438 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.83 
 
 
438 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.39 
 
 
436 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.85 
 
 
436 aa  474  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  51.36 
 
 
442 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.85 
 
 
435 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.39 
 
 
436 aa  470  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.57 
 
 
453 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2380  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  53.76 
 
 
436 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289477  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  50.8 
 
 
441 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  50.57 
 
 
440 aa  467  9.999999999999999e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  53.08 
 
 
436 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.41 
 
 
438 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.96 
 
 
434 aa  466  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  51.03 
 
 
463 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.47 
 
 
439 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1142  nucleotide sugar dehydrogenase  51.24 
 
 
451 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  52.16 
 
 
434 aa  462  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  50.11 
 
 
447 aa  461  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.57 
 
 
438 aa  458  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2287  nucleotide sugar dehydrogenase  52.26 
 
 
450 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  51.94 
 
 
433 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  50.8 
 
 
452 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1936  nucleotide sugar dehydrogenase  52.04 
 
 
450 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  49.09 
 
 
456 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  51.94 
 
 
434 aa  460  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  50.92 
 
 
427 aa  460  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.25 
 
 
437 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.8 
 
 
440 aa  461  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.8 
 
 
440 aa  461  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.43 
 
 
434 aa  455  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.25 
 
 
433 aa  457  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  50.68 
 
 
439 aa  457  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.86 
 
 
448 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.02 
 
 
450 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.23 
 
 
434 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.55 
 
 
450 aa  448  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  50.45 
 
 
435 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  49.54 
 
 
446 aa  451  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.23 
 
 
434 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.77 
 
 
439 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  48.19 
 
 
449 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.96 
 
 
434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.49 
 
 
447 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.78 
 
 
473 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  50.11 
 
 
435 aa  448  1.0000000000000001e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  49.22 
 
 
473 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  47.52 
 
 
470 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.97 
 
 
470 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  47.97 
 
 
470 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  50.11 
 
 
440 aa  443  1e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.52 
 
 
470 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.88 
 
 
473 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  47.75 
 
 
470 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2477  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.16 
 
 
471 aa  444  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.2 
 
 
470 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.52 
 
 
470 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  48.93 
 
 
522 aa  440  9.999999999999999e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.4 
 
 
450 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  48.31 
 
 
466 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  46.95 
 
 
450 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0578  nucleotide sugar dehydrogenase  46.22 
 
 
453 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.21 
 
 
452 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0785  nucleotide sugar dehydrogenase  47.87 
 
 
449 aa  438  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180354  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.81 
 
 
437 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.65 
 
 
457 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  48.85 
 
 
436 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  46.8 
 
 
440 aa  437  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  47.54 
 
 
454 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.62 
 
 
436 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.77 
 
 
482 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  48.85 
 
 
435 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  48.41 
 
 
450 aa  438  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.72 
 
 
442 aa  433  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.27 
 
 
467 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  47.05 
 
 
447 aa  434  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.21 
 
 
473 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  46.8 
 
 
445 aa  434  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  47.1 
 
 
454 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0726  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.11 
 
 
457 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132255  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.24 
 
 
466 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  47.61 
 
 
448 aa  432  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.91 
 
 
447 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.48 
 
 
467 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1761  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.26 
 
 
446 aa  428  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385474  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1058  nucleotide sugar dehydrogenase  46.65 
 
 
476 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>