More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1350 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  100 
 
 		 134 aa  281  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  55.71 
 
 		 138 aa  157  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  52.45 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  58.1 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  40.67 
 
 		 150 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  49.56 
 
 		 148 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  49.5 
 
 		 150 aa  110  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  44.93 
 
 		 136 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  40 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  40.15 
 
 		 137 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  42.28 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3087  single-strand binding protein  44.83 
 
 		 140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619635  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  50 
 
 		 140 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  41.89 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  41.13 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  39.72 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  40.29 
 
 		 139 aa  103  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  40.41 
 
 		 146 aa  103  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  41.53 
 
 		 164 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0484  single-strand binding protein  45 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759205  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  37.31 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  50 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  41.74 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  44.34 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  41.73 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  46.67 
 
 		 192 aa  101  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  39.44 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  37.58 
 
 		 161 aa  100  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  46.6 
 
 		 186 aa  100  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  41.8 
 
 		 164 aa  100  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  41.8 
 
 		 172 aa  100  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  41.8 
 
 		 173 aa  100  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  41.8 
 
 		 173 aa  100  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  41.8 
 
 		 173 aa  100  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  41.8 
 
 		 173 aa  100  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  41.8 
 
 		 173 aa  100  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  41.8 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  41.8 
 
 		 169 aa  100  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  41.8 
 
 		 172 aa  100  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  41.8 
 
 		 172 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  39.68 
 
 		 187 aa  100  9e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  41.44 
 
 		 156 aa  99.4  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  45.95 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  45.95 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  45.95 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  47.75 
 
 		 176 aa  99.4  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  43.64 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  45.28 
 
 		 119 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  45.95 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  40.28 
 
 		 136 aa  98.6  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  45.69 
 
 		 175 aa  98.2  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  43.22 
 
 		 175 aa  97.8  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  42.74 
 
 		 165 aa  97.1  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  44.55 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  48 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  35.25 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 166 aa  94.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  41.32 
 
 		 169 aa  94.4  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  37.04 
 
 		 129 aa  94  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  38.1 
 
 		 172 aa  94  7e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  36.92 
 
 		 172 aa  93.6  9e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 163 aa  92.8  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  37.91 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  40.3 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 		 166 aa  93.2  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  43.48 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  36.96 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  43.48 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  37.6 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  44.34 
 
 		 142 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  41.82 
 
 		 166 aa  92  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  41.12 
 
 		 188 aa  92.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  42.45 
 
 		 167 aa  92  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  44.34 
 
 		 142 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  42.45 
 
 		 167 aa  92  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 224 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  40.19 
 
 		 160 aa  90.9  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  36.88 
 
 		 143 aa  91.3  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01895  Single-strand binding protein  45.1 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326894  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  46.46 
 
 		 168 aa  90.5  7e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 150 aa  90.5  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 150 aa  90.5  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  39.25 
 
 		 112 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  40.91 
 
 		 171 aa  90.5  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  40.19 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0811  single-strand binding protein  41.46 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000022437  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  43.52 
 
 		 160 aa  89  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  42.11 
 
 		 114 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  42.11 
 
 		 114 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  42.42 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 151 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  35.21 
 
 		 164 aa  88.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  32.5 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  43.56 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  42.27 
 
 		 185 aa  88.6  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2013  single-stranded DNA-binding protein  38.32 
 
 		 112 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1967  single-stranded DNA-binding protein  38.32 
 
 		 112 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000581138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2168  single-stranded DNA-binding protein  38.32 
 
 		 112 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000365477  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  40.74 
 
 		 133 aa  87.8  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  37.61 
 
 		 114 aa  88.2  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>