More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1345 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 171 aa  339  9e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  72.51 
 
 		 171 aa  257  6e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1952  adenine phosphoribosyltransferase  71.35 
 
 		 175 aa  245  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000331539  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  57.99 
 
 		 174 aa  206  9e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  58.24 
 
 		 173 aa  201  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 		 170 aa  200  8e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  58.96 
 
 		 172 aa  200  9e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  58.96 
 
 		 172 aa  200  9e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  56.14 
 
 		 170 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 		 174 aa  198  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  54.39 
 
 		 170 aa  197  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1686  adenine phosphoribosyltransferase  56.14 
 
 		 172 aa  194  7e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0227  adenine phosphoribosyltransferase  56.73 
 
 		 172 aa  194  7e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  56.14 
 
 		 170 aa  193  8.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 		 173 aa  193  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0915  adenine phosphoribosyltransferase  56.73 
 
 		 172 aa  193  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361097  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 		 170 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1531  adenine phosphoribosyltransferase  54.97 
 
 		 173 aa  192  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  54.97 
 
 		 172 aa  190  9e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 		 170 aa  189  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  54.65 
 
 		 172 aa  189  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  55.23 
 
 		 172 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  55.23 
 
 		 172 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  54.07 
 
 		 172 aa  187  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  55.03 
 
 		 182 aa  187  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 		 173 aa  187  7e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  53.8 
 
 		 172 aa  187  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  53.8 
 
 		 172 aa  187  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1198  adenine phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 		 172 aa  186  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.484506  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 		 172 aa  184  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  56.29 
 
 		 172 aa  184  6e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  54.71 
 
 		 170 aa  183  9e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 		 175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  51.79 
 
 		 174 aa  182  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4255  adenine phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 		 170 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0732  adenine phosphoribosyltransferase  50.59 
 
 		 172 aa  181  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171863  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 		 172 aa  181  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 		 177 aa  180  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 180 aa  179  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  55.35 
 
 		 424 aa  179  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4152  adenine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 		 170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4527  adenine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 		 170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0708  adenine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 		 170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4492  adenine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 		 170 aa  178  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4303  adenine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 		 170 aa  178  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4141  adenine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 		 170 aa  178  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4638  adenine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 		 170 aa  178  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2974  adenine phosphoribosyltransferase  54.39 
 
 		 170 aa  178  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 		 171 aa  178  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 173 aa  178  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4542  adenine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 		 170 aa  178  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4488  adenine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 		 170 aa  178  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160658 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  51.15 
 
 		 177 aa  177  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  48.19 
 
 		 175 aa  177  9e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1185  adenine phosphoribosyltransferase  51.48 
 
 		 176 aa  177  9e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  51.46 
 
 		 171 aa  176  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3124  adenine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 		 170 aa  175  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0411014  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0873  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 170 aa  175  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 		 181 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  51.46 
 
 		 172 aa  174  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 		 181 aa  174  6e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 		 181 aa  173  9e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 		 181 aa  173  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 		 214 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  50.88 
 
 		 173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  49.69 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 		 199 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 		 181 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1205  adenine phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 		 172 aa  171  5e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 		 181 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  47.02 
 
 		 168 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  47.95 
 
 		 181 aa  170  6.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 		 176 aa  170  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  47.53 
 
 		 176 aa  169  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  48.48 
 
 		 181 aa  170  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 		 181 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  46.95 
 
 		 179 aa  169  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  45.09 
 
 		 175 aa  169  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 		 171 aa  169  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  45.73 
 
 		 179 aa  168  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1190  adenine phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 		 172 aa  168  3e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  50.59 
 
 		 172 aa  167  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 		 187 aa  166  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 178 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  50.59 
 
 		 178 aa  166  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 		 181 aa  166  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  49.38 
 
 		 178 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 		 187 aa  166  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 171 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 		 182 aa  165  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  45.61 
 
 		 181 aa  165  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  47.93 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0607  adenine phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 		 171 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.760951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>